17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2701 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2701  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 		 111 aa  225  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3590  DNA binding domain-containing protein  37.38 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.297868  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2635  DNA binding domain-containing protein  34.29 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3283  hypothetical protein  36.11 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.484559 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0680  DNA binding domain protein, excisionase family  44.12 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0872  mobilizable transposon, Xis protein  32.67 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0188058 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5334  DNA binding domain protein, excisionase family  39.76 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.329966 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03950  hypothetical protein  43.4 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.33907  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0624  DNA binding domain protein, excisionase family  41.27 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0691  mobilizable transposon, xis protein  34.09 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1463  excisionase  31.33 
 
 		 109 aa  53.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00572875  normal  0.0821258 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00405  putative excisionase  30.21 
 
 		 111 aa  50.1  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.526782  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4255  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5171  excisionase  36.36 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628893  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3096  phage transcriptional regulator, AlpA  41.18 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.773415  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3678  excision promoter, Xis  40.82 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0057  DNA binding domain protein, excisionase family  34.69 
 
 		 126 aa  40  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>