19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2635 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2635  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 		 110 aa  218  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3590  DNA binding domain-containing protein  85.05 
 
 		 112 aa  178  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.297868  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0872  mobilizable transposon, Xis protein  46.94 
 
 		 119 aa  93.6  9e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0188058 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2701  DNA binding domain-containing protein  34.29 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03950  hypothetical protein  32.73 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.33907  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1463  excisionase  38.67 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00572875  normal  0.0821258 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0691  mobilizable transposon, xis protein  40.62 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0624  DNA binding domain protein, excisionase family  38.14 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3283  hypothetical protein  28.7 
 
 		 121 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.484559 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0680  DNA binding domain protein, excisionase family  38.03 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3096  phage transcriptional regulator, AlpA  40.35 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.773415  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5334  DNA binding domain protein, excisionase family  31.63 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.329966 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5171  excisionase  46.15 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628893  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3991  phage transcriptional regulator, AlpA  33.85 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1169  phage DNA-binding protein excisionase  32.81 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.704903  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5490  DNA binding domain protein, excisionase family  31.25 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00405  putative excisionase  26.14 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.526782  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4255  DNA binding domain protein, excisionase family  36.49 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3682  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  32.65 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>