28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00405 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_00405  putative excisionase  100 
 
 		 111 aa  227  5e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.526782  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5334  DNA binding domain protein, excisionase family  31.91 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.329966 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1463  excisionase  32.47 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00572875  normal  0.0821258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3283  hypothetical protein  35.82 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.484559 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3096  phage transcriptional regulator, AlpA  32.29 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.773415  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0215  putative excisionase  37.35 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113601  unclonable  0.00000733316 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2701  DNA binding domain-containing protein  30.21 
 
 		 111 aa  50.1  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0680  DNA binding domain protein, excisionase family  28.99 
 
 		 116 aa  50.4  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3991  phage transcriptional regulator, AlpA  30.14 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4255  DNA binding domain protein, excisionase family  27.27 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03950  hypothetical protein  32 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.33907  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5490  DNA binding domain protein, excisionase family  29.41 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1468  excisionase/Xis, DNA-binding  40.91 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118441  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0624  DNA binding domain protein, excisionase family  25.76 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2211  hypothetical protein  29.31 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.953966  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2595  DNA binding domain, excisionase family protein  29.79 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2727  DNA binding domain, excisionase family protein  29.79 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000622476  hitchhiker  0.000211315 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3717  DNA binding domain protein, excisionase family  28.12 
 
 		 307 aa  42.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.222458  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2228  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  34.78 
 
 		 245 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.193382  normal  0.0677009 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1169  phage DNA-binding protein excisionase  33.82 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.704903  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0957  excision promoter, Xis  36 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.392434  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01114  hypothetical protein  33.33 
 
 		 56 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3590  DNA binding domain-containing protein  28.28 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.297868  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2635  DNA binding domain-containing protein  26.14 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1498  DNA binding domain protein, excisionase family  35.19 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0665  excisionase/Xis, DNA-binding  36.17 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.950953  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0279  DNA binding domain-containing protein  32 
 
 		 89 aa  40.4  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908043  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1908  excisionase/Xis, DNA-binding  29.63 
 
 		 307 aa  40  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>