17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3590 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3590  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 		 112 aa  223  5.0000000000000005e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.297868  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2635  DNA binding domain-containing protein  85.05 
 
 		 110 aa  178  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0872  mobilizable transposon, Xis protein  44.9 
 
 		 119 aa  86.3  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0188058 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2701  DNA binding domain-containing protein  37.38 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03950  hypothetical protein  33.04 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.33907  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0691  mobilizable transposon, xis protein  38.37 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1463  excisionase  37.18 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00572875  normal  0.0821258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5334  DNA binding domain protein, excisionase family  31.58 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.329966 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5171  excisionase  44.23 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628893  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3283  hypothetical protein  26.21 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.484559 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0680  DNA binding domain protein, excisionase family  35.53 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0624  DNA binding domain protein, excisionase family  37.5 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00405  putative excisionase  28.28 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.526782  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3096  phage transcriptional regulator, AlpA  41.3 
 
 		 100 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.773415  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5490  DNA binding domain protein, excisionase family  36.36 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3991  phage transcriptional regulator, AlpA  29.21 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1169  phage DNA-binding protein excisionase  32.26 
 
 		 81 aa  41.2  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.704903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>