14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0872 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0872  mobilizable transposon, Xis protein  100 
 
 		 119 aa  241  3e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0188058 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2635  DNA binding domain-containing protein  46.94 
 
 		 110 aa  93.6  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3590  DNA binding domain-containing protein  44.9 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.297868  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0691  mobilizable transposon, xis protein  38.71 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2701  DNA binding domain-containing protein  32.67 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03950  hypothetical protein  30.48 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.33907  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3096  phage transcriptional regulator, AlpA  44 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.773415  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1463  excisionase  39.06 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00572875  normal  0.0821258 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0680  DNA binding domain protein, excisionase family  41.82 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0624  DNA binding domain protein, excisionase family  32.53 
 
 		 116 aa  49.7  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3283  hypothetical protein  27.37 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.484559 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1169  phage DNA-binding protein excisionase  34.92 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.704903  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3695  putative helicase  36.36 
 
 		 676 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.783104  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2614  phage transcriptional regulator, AlpA  37.04 
 
 		 75 aa  41.2  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.317776 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>