25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3283 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3283  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  251  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.484559 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03950  hypothetical protein  35.04 
 
 		 118 aa  80.1  0.000000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.33907  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2701  DNA binding domain-containing protein  36.11 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2635  DNA binding domain-containing protein  28.7 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0680  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00405  putative excisionase  35.82 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.526782  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1463  excisionase  32.65 
 
 		 109 aa  51.6  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00572875  normal  0.0821258 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3991  phage transcriptional regulator, AlpA  38.89 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2195  phage transcriptional regulator, AlpA  35.59 
 
 		 70 aa  50.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1174  phage transcriptional regulator, AlpA  34.92 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3682  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  39.29 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0624  DNA binding domain protein, excisionase family  36.51 
 
 		 116 aa  47  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3430  putative transcriptional regulator  28.38 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3590  DNA binding domain-containing protein  26.21 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.297868  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04063  VrlI like protein  32.79 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1683  DNA binding domain protein, excisionase family  30.36 
 
 		 64 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.629523  decreased coverage  0.0000560234 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2798  DNA binding domain-containing protein  37.04 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2228  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  42.31 
 
 		 245 aa  43.9  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.193382  normal  0.0677009 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2760  putative transcriptional regulator  32.14 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466966 
 
 
-
 
NC_002950  PG0872  mobilizable transposon, Xis protein  27.37 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0188058 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3844  phage transcriptional regulator, AlpA  30.65 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.279149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5334  DNA binding domain protein, excisionase family  31.52 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.329966 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1862  putative transcriptional regulator  29.23 
 
 		 71 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2211  hypothetical protein  28.57 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.953966  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5490  DNA binding domain protein, excisionase family  29.67 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>