57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3844 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3844  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 74 aa  150  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.279149 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1862  putative transcriptional regulator  80 
 
 		 71 aa  110  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382901  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3430  putative transcriptional regulator  78.46 
 
 		 84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0554  phage transcriptional regulator, AlpA  72.73 
 
 		 69 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04063  VrlI like protein  70.49 
 
 		 65 aa  93.2  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1174  phage transcriptional regulator, AlpA  63.49 
 
 		 65 aa  92.8  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3682  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  66.67 
 
 		 83 aa  88.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2195  phage transcriptional regulator, AlpA  62.9 
 
 		 70 aa  87.4  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1683  DNA binding domain protein, excisionase family  57.14 
 
 		 64 aa  86.7  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.629523  decreased coverage  0.0000560234 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2760  putative transcriptional regulator  63.49 
 
 		 67 aa  85.5  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466966 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1226  DNA binding domain-containing protein  52.38 
 
 		 75 aa  75.9  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0533  DNA binding domain, excisionase family  40.68 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097622 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1468  excisionase/Xis, DNA-binding  40.43 
 
 		 78 aa  51.6  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118441  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2614  phage transcriptional regulator, AlpA  34.33 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1182  phage transcriptional regulator, AlpA  30.56 
 
 		 72 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.592067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3553  phage transcriptional regulator, AlpA  30.56 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0156  DNA binding domain-containing protein  37.1 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000704193 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  29.82 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2798  DNA binding domain-containing protein  36.54 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1498  DNA binding domain protein, excisionase family  30.51 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0810  DNA binding domain-containing protein  29.09 
 
 		 60 aa  45.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0378139 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4598  DNA binding domain protein, excisionase family  35.71 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  29.82 
 
 		 180 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1078  DNA-binding response regulator  34.04 
 
 		 180 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000063084  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1059  DNA binding domain protein, excisionase family  36.67 
 
 		 292 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1079  DNA-binding protein/PTS system, IIA component  42.59 
 
 		 201 aa  44.3  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1237  putative transcriptional regulator  29.69 
 
 		 74 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2531  phage transcriptional regulator, AlpA  30.36 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  hitchhiker  0.000129846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0603  excisionase/Xis, DNA-binding protein  40 
 
 		 58 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15570  hypothetical protein  30.36 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000408648  unclonable  2.14199e-22 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2679  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 233 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2780  phage transcriptional regulator, AlpA  32.69 
 
 		 57 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0923797  normal  0.386289 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3695  putative helicase  36.73 
 
 		 676 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.783104  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2677  DNA binding domain protein, excisionase family  29.63 
 
 		 248 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000367572  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1293  regulatory protein MerR  39.58 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0279  DNA binding domain-containing protein  34.78 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908043  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3283  hypothetical protein  30.65 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.484559 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0957  excision promoter, Xis  31.34 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.392434  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01114  hypothetical protein  30 
 
 		 56 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1172  phage transcriptional regulator, AlpA  32.61 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0630  DNA binding domain protein, excisionase family  32.61 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1273  DNA binding domain protein, excisionase family  33.96 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.33756  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4450  DNA binding domain protein, excisionase family  37.93 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1001  DNA-binding excisionase/Xis  39.29 
 
 		 290 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2705  excisionase/Xis, DNA-binding  39.66 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34571  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2744  DNA binding domain protein, excisionase family  32.84 
 
 		 78 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.587836  hitchhiker  0.00613887 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2286  DNA binding domain-containing protein  32.61 
 
 		 93 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1575  DNA binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 293 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.410844  hitchhiker  0.00561125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0537  hypothetical protein  36.21 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5007  DNA binding domain protein, excisionase family  37.93 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0520811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0251  excisionase family DNA binding domain-containing protein  36.21 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0244  DNA binding domain-containing protein  37.93 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00265398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3263  excision promoter, Xis  37.04 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1062  DNA binding domain protein, excisionase family  34.92 
 
 		 291 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2985  WD40 domain protein beta Propeller  37.66 
 
 		 703 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.52727  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3099  excision promoter, Xis  35.71 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3301  phage transcriptional regulator, AlpA  35.42 
 
 		 84 aa  40  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>