32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1273 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1273  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 		 79 aa  156  1e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.33756  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01890  DNA-binding protein, excisionase family  38.18 
 
 		 321 aa  48.9  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0766202 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0554  phage transcriptional regulator, AlpA  31.25 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3430  putative transcriptional regulator  33.96 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1557  molybdate-binding protein  35.19 
 
 		 317 aa  43.9  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2798  DNA binding domain-containing protein  42.31 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0059  DNA binding domain-containing protein  39.62 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0245  Prophage CP4-57 regulatory  48.89 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0229  putative molybdopterin biosynthesis protein  34.55 
 
 		 306 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2706  DNA binding domain-containing protein  43.1 
 
 		 190 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.781066  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3844  phage transcriptional regulator, AlpA  33.96 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.279149 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2684  excisionase/Xis, DNA-binding  51.22 
 
 		 95 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0047  DNA binding domain, excisionase family  38.1 
 
 		 136 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.509276  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2677  DNA binding domain protein, excisionase family  38.46 
 
 		 248 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000367572  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1862  putative transcriptional regulator  30.19 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382901  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5098  periplasmic molybdate-binding protein  34.55 
 
 		 306 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1468  excisionase/Xis, DNA-binding  31.91 
 
 		 78 aa  40.8  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118441  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0223  molybdopterin biosynthesis protein, putative  34.55 
 
 		 315 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0246  putative molybdopterin biosynthesis protein  34.55 
 
 		 306 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2744  DNA binding domain protein, excisionase family  37.1 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.587836  hitchhiker  0.00613887 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0194  molybdate-binding protein  34.55 
 
 		 315 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0201  DNA binding domain-containing protein  33.9 
 
 		 305 aa  40.8  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0230  DNA binding domain-containing protein  38.98 
 
 		 59 aa  40.4  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.016519 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0222  putative molybdopterin biosynthesis protein  32.73 
 
 		 306 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0277  DNA binding domain-containing protein  41.18 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.830937  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0205  molybdopterin biosynthesis protein  32.73 
 
 		 306 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0190  molybdate-binding protein  32.73 
 
 		 315 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0204  molybdopterin biosynthesis protein  32.73 
 
 		 306 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4630  DNA binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0484  DNA binding domain-containing protein  34.04 
 
 		 67 aa  40  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111356  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2049  DNA binding domain-containing protein  53.66 
 
 		 95 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.531029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4561  DNA binding domain protein, excisionase family  36.36 
 
 		 335 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000373649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>