46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0554 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0554  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 69 aa  141  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3430  putative transcriptional regulator  79.1 
 
 		 84 aa  115  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1862  putative transcriptional regulator  76.12 
 
 		 71 aa  110  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382901  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3844  phage transcriptional regulator, AlpA  72.73 
 
 		 74 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.279149 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3682  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  70.69 
 
 		 83 aa  90.5  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1174  phage transcriptional regulator, AlpA  65.62 
 
 		 65 aa  90.5  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2760  putative transcriptional regulator  67.19 
 
 		 67 aa  90.5  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466966 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2195  phage transcriptional regulator, AlpA  68.25 
 
 		 70 aa  89.4  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04063  VrlI like protein  66.13 
 
 		 65 aa  89  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1683  DNA binding domain protein, excisionase family  63.49 
 
 		 64 aa  88.6  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.629523  decreased coverage  0.0000560234 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1226  DNA binding domain-containing protein  54.1 
 
 		 75 aa  75.5  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0533  DNA binding domain, excisionase family  39.66 
 
 		 61 aa  55.1  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097622 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2614  phage transcriptional regulator, AlpA  35.19 
 
 		 75 aa  50.1  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2677  DNA binding domain protein, excisionase family  30.77 
 
 		 248 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000367572  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1468  excisionase/Xis, DNA-binding  36.96 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118441  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1078  DNA-binding response regulator  30.77 
 
 		 180 aa  47  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000063084  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 180 aa  47  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 180 aa  47  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3553  phage transcriptional regulator, AlpA  31.48 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1182  phage transcriptional regulator, AlpA  31.48 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.592067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3099  excision promoter, Xis  37.25 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0156  DNA binding domain-containing protein  29.51 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000704193 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2798  DNA binding domain-containing protein  36.54 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3301  phage transcriptional regulator, AlpA  37.25 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1273  DNA binding domain protein, excisionase family  31.25 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.33756  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0279  DNA binding domain-containing protein  34.78 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908043  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2531  phage transcriptional regulator, AlpA  28.57 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  hitchhiker  0.000129846 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15570  hypothetical protein  28.57 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000408648  unclonable  2.14199e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3695  putative helicase  34 
 
 		 676 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.783104  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2705  excisionase/Xis, DNA-binding  37.25 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34571  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1172  phage transcriptional regulator, AlpA  29.63 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0810  DNA binding domain-containing protein  27.78 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0378139 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4254  phage transcriptional regulator, AlpA  31.37 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631275  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4598  DNA binding domain protein, excisionase family  31.48 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1498  DNA binding domain protein, excisionase family  28.26 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8339  excision promoter, Xis  32.76 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0630  DNA binding domain protein, excisionase family  29.63 
 
 		 93 aa  42  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0484  DNA binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111356  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1237  putative transcriptional regulator  32.65 
 
 		 74 aa  41.6  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2286  DNA binding domain-containing protein  29.63 
 
 		 93 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0612  phage transcriptional regulator, AlpA  35.29 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274045  normal  0.0916726 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3263  excision promoter, Xis  35.85 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0680  DNA binding domain protein, excisionase family  29.41 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4270  HNH nuclease  39.58 
 
 		 258 aa  40.8  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.740281  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2780  phage transcriptional regulator, AlpA  29.41 
 
 		 57 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0923797  normal  0.386289 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0665  excisionase/Xis, DNA-binding  29.79 
 
 		 73 aa  40  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.950953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>