96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1498 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1498  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 
67 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0810  DNA binding domain-containing protein  86.67 
 
 
60 aa  111  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0378139 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2614  phage transcriptional regulator, AlpA  42.25 
 
 
75 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0279  DNA binding domain-containing protein  44.64 
 
 
89 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908043  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0630  DNA binding domain protein, excisionase family  44.64 
 
 
93 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.168372 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2286  DNA binding domain-containing protein  44.64 
 
 
93 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15570  hypothetical protein  40.74 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000408648  unclonable  2.14199e-22 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2531  phage transcriptional regulator, AlpA  40.74 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  hitchhiker  0.000129846 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1172  phage transcriptional regulator, AlpA  41.07 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3553  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 
126 aa  57.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1182  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 
72 aa  57.4  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.592067  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01114  hypothetical protein  44 
 
 
56 aa  56.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0057  DNA binding domain protein, excisionase family  40 
 
 
126 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0665  excisionase/Xis, DNA-binding  40 
 
 
73 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.950953  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2780  phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 
57 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0923797  normal  0.386289 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4254  phage transcriptional regulator, AlpA  45.83 
 
 
62 aa  54.7  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631275  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  34.62 
 
 
180 aa  53.9  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3695  putative helicase  43.48 
 
 
676 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.783104  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  34.62 
 
 
180 aa  53.9  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0957  excision promoter, Xis  41.18 
 
 
69 aa  53.9  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.392434  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1078  DNA-binding response regulator  34.62 
 
 
180 aa  53.5  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000063084  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0156  DNA binding domain-containing protein  32.79 
 
 
70 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000704193 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0403  DNA binding domain-containing protein  48.94 
 
 
118 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00109148  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2438  DNA binding domain-containing protein  39.58 
 
 
291 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1468  excisionase/Xis, DNA-binding  41.82 
 
 
78 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118441  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2760  putative transcriptional regulator  32.14 
 
 
67 aa  51.2  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000466966 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7292  DNA binding domain-containing protein  40.82 
 
 
76 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137944  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0602  DNA binding domain protein, excisionase family  42.11 
 
 
147 aa  50.8  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2677  DNA binding domain protein, excisionase family  35.19 
 
 
248 aa  50.4  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000367572  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0085  DNA binding domain-containing protein  46 
 
 
73 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0754203  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0484  DNA binding domain-containing protein  32.26 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111356  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3682  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  35.71 
 
 
83 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0271  excisionase/Xis, DNA-binding  39.34 
 
 
139 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000397414  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1004  DNA binding domain protein, excisionase family  32.08 
 
 
82 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4353  putative transcriptional regulator  32.69 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10510  hypothetical protein  33.96 
 
 
78 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1174  phage transcriptional regulator, AlpA  36.96 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195229  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4598  DNA binding domain protein, excisionase family  37.04 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04063  VrlI like protein  34.78 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0074  DNA binding domain-containing protein  32.08 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0669  excisionase/Xis, DNA-binding protein  32.08 
 
 
84 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.873991  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1738  DNA binding domain-containing protein  34.69 
 
 
272 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0662  DNA binding domain-containing protein  32.08 
 
 
84 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.87984 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2195  phage transcriptional regulator, AlpA  37.78 
 
 
70 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248245  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0838  DNA binding domain-containing protein  32.08 
 
 
90 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.385284 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0682  DNA binding domain-containing protein  32.08 
 
 
84 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160899  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0612  phage transcriptional regulator, AlpA  32.08 
 
 
66 aa  47.4  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274045  normal  0.0916726 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2705  excisionase/Xis, DNA-binding  34.69 
 
 
77 aa  47  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34571  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3099  excision promoter, Xis  33.93 
 
 
70 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0812  DNA binding domain protein, excisionase family  37.25 
 
 
308 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3844  phage transcriptional regulator, AlpA  30.51 
 
 
74 aa  46.2  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.279149 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0661  DNA binding domain protein, excisionase family  29.09 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1862  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382901  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0700  DNA binding domain-containing protein  32.08 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000271881  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02760  DNA-binding protein, excisionase family  28.3 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1683  DNA binding domain protein, excisionase family  31.48 
 
 
64 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.629523  decreased coverage  0.0000560234 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1923  phage transcriptional regulator, AlpA  37.04 
 
 
65 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151509  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3430  putative transcriptional regulator  29.79 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0251  excisionase family DNA binding domain-containing protein  32.65 
 
 
67 aa  45.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23187  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8339  excision promoter, Xis  30 
 
 
74 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0094  DNA binding domain-containing protein  35.29 
 
 
87 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0288586  normal 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6523  prophage CP4-57 regulatory  37.5 
 
 
69 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4450  DNA binding domain protein, excisionase family  32.65 
 
 
67 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5764  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  32.14 
 
 
69 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0537  hypothetical protein  30 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2744  DNA binding domain protein, excisionase family  28.81 
 
 
78 aa  43.9  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.587836  hitchhiker  0.00613887 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6047  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  32.69 
 
 
380 aa  43.5  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0912  DNA binding domain protein, excisionase family  28.3 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6742  DNA binding domain protein, excisionase family  28.3 
 
 
70 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4125  MerR family regulatory protein  50 
 
 
51 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5502  DNA binding domain-containing protein  34.04 
 
 
291 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3301  phage transcriptional regulator, AlpA  28.57 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2798  DNA binding domain-containing protein  41.67 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0554  phage transcriptional regulator, AlpA  28.26 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2745  DNA binding domain-containing protein  36.36 
 
 
300 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5007  DNA binding domain protein, excisionase family  30.61 
 
 
67 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0520811  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3981  DNA binding domain-containing protein  40.74 
 
 
134 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.805397 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4589  DNA binding domain protein, excisionase family  28.85 
 
 
112 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1079  DNA-binding protein/PTS system, IIA component  33.33 
 
 
201 aa  41.2  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01890  DNA-binding protein, excisionase family  32.65 
 
 
321 aa  41.2  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0766202 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1158  DNA binding domain protein, excisionase family  32.2 
 
 
320 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0291  DNA binding domain-containing protein  41.67 
 
 
56 aa  41.2  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0244  DNA binding domain-containing protein  28.57 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00265398  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0794  phage transcriptional regulator, AlpA  34 
 
 
80 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00405  putative excisionase  35.19 
 
 
111 aa  40.8  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.526782  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3717  DNA binding domain protein, excisionase family  28.81 
 
 
307 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.222458  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0019  DNA binding domain protein, excisionase family  37.29 
 
 
326 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2133  DNA binding domain-containing protein  27.66 
 
 
252 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3263  excision promoter, Xis  25.4 
 
 
75 aa  40.8  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13782  excisionase  32.2 
 
 
130 aa  40.8  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.696326 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1557  molybdate-binding protein  35.42 
 
 
317 aa  40.8  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1062  DNA binding domain protein, excisionase family  29.31 
 
 
291 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2925  hypothetical protein  32.26 
 
 
66 aa  40.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.318513  normal  0.0737042 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3272  DNA binding domain protein, excisionase family  40 
 
 
143 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0413  DNA binding domain-containing protein  28.3 
 
 
69 aa  40  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229992 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3416  DNA binding domain protein, excisionase family  39.58 
 
 
64 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>