26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1226 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_1226  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 		 75 aa  155  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3682  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  60.61 
 
 		 83 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2195  phage transcriptional regulator, AlpA  60.29 
 
 		 70 aa  89.4  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2760  putative transcriptional regulator  60.71 
 
 		 67 aa  85.1  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466966 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1174  phage transcriptional regulator, AlpA  60.66 
 
 		 65 aa  85.1  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1862  putative transcriptional regulator  59.02 
 
 		 71 aa  83.6  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382901  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3430  putative transcriptional regulator  57.38 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04063  VrlI like protein  54.1 
 
 		 65 aa  80.1  0.000000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1683  DNA binding domain protein, excisionase family  62.5 
 
 		 64 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.629523  decreased coverage  0.0000560234 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3844  phage transcriptional regulator, AlpA  52.38 
 
 		 74 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.279149 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0554  phage transcriptional regulator, AlpA  54.1 
 
 		 69 aa  75.5  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0533  DNA binding domain, excisionase family  46.67 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097622 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0156  DNA binding domain-containing protein  37.25 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000704193 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0279  DNA binding domain-containing protein  37.78 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908043  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0630  DNA binding domain protein, excisionase family  37.78 
 
 		 93 aa  42.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1182  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.592067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3553  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2286  DNA binding domain-containing protein  37.78 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1468  excisionase/Xis, DNA-binding  40 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118441  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2614  phage transcriptional regulator, AlpA  36.17 
 
 		 75 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1172  phage transcriptional regulator, AlpA  35.56 
 
 		 93 aa  41.6  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0957  excision promoter, Xis  36.59 
 
 		 69 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.392434  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4598  DNA binding domain protein, excisionase family  41.46 
 
 		 76 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  30 
 
 		 180 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  30 
 
 		 180 aa  40  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1078  DNA-binding response regulator  30 
 
 		 180 aa  40  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000063084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>