88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0810 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0810  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 		 60 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0378139 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1498  DNA binding domain protein, excisionase family  86.67 
 
 		 67 aa  111  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0630  DNA binding domain protein, excisionase family  48.98 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2286  DNA binding domain-containing protein  48.98 
 
 		 93 aa  62  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1172  phage transcriptional regulator, AlpA  48.98 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2614  phage transcriptional regulator, AlpA  44.44 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0279  DNA binding domain-containing protein  41.07 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908043  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2531  phage transcriptional regulator, AlpA  40.74 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  hitchhiker  0.000129846 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3553  phage transcriptional regulator, AlpA  43.33 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15570  hypothetical protein  40.74 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000408648  unclonable  2.14199e-22 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1182  phage transcriptional regulator, AlpA  43.33 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.592067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2780  phage transcriptional regulator, AlpA  43.14 
 
 		 57 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0923797  normal  0.386289 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3695  putative helicase  43.86 
 
 		 676 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.783104  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0156  DNA binding domain-containing protein  38.18 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000704193 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4254  phage transcriptional regulator, AlpA  44 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631275  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0957  excision promoter, Xis  43.14 
 
 		 69 aa  54.7  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.392434  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01114  hypothetical protein  40 
 
 		 56 aa  53.9  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0057  DNA binding domain protein, excisionase family  41.67 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0085  DNA binding domain-containing protein  48 
 
 		 73 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0754203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0665  excisionase/Xis, DNA-binding  40.82 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.950953  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  34.69 
 
 		 180 aa  51.2  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2760  putative transcriptional regulator  35.09 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466966 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  34.69 
 
 		 180 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1078  DNA-binding response regulator  34.69 
 
 		 180 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000063084  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1468  excisionase/Xis, DNA-binding  40 
 
 		 78 aa  50.8  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118441  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7292  DNA binding domain-containing protein  40.82 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137944  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2438  DNA binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 291 aa  50.4  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0403  DNA binding domain-containing protein  46.81 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00109148  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2677  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 		 248 aa  48.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000367572  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0602  DNA binding domain protein, excisionase family  44.68 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0812  DNA binding domain protein, excisionase family  41.18 
 
 		 308 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4598  DNA binding domain protein, excisionase family  39.58 
 
 		 76 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1174  phage transcriptional regulator, AlpA  36.96 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3682  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  39.13 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0537  hypothetical protein  36.73 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2195  phage transcriptional regulator, AlpA  37.78 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02760  DNA-binding protein, excisionase family  32.65 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04063  VrlI like protein  34.78 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4353  putative transcriptional regulator  34.04 
 
 		 74 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0271  excisionase/Xis, DNA-binding  44.68 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000397414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8339  excision promoter, Xis  34.69 
 
 		 74 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0484  DNA binding domain-containing protein  30.19 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111356  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3099  excision promoter, Xis  34.69 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0251  excisionase family DNA binding domain-containing protein  34.69 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1862  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 71 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382901  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0661  DNA binding domain protein, excisionase family  31.37 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4450  DNA binding domain protein, excisionase family  34.69 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1004  DNA binding domain protein, excisionase family  31.91 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3844  phage transcriptional regulator, AlpA  29.09 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.279149 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2705  excisionase/Xis, DNA-binding  32.65 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34571  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3430  putative transcriptional regulator  30.43 
 
 		 84 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1683  DNA binding domain protein, excisionase family  30.43 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.629523  decreased coverage  0.0000560234 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0700  DNA binding domain-containing protein  30.61 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000271881  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1738  DNA binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 272 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0682  DNA binding domain-containing protein  30.61 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160899  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0838  DNA binding domain-containing protein  30.61 
 
 		 90 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.385284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0662  DNA binding domain-containing protein  30.61 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.87984 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0074  DNA binding domain-containing protein  30.61 
 
 		 90 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0669  excisionase/Xis, DNA-binding protein  30.61 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.873991  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0244  DNA binding domain-containing protein  32.76 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00265398  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5007  DNA binding domain protein, excisionase family  32.65 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0520811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10510  hypothetical protein  29.41 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3301  phage transcriptional regulator, AlpA  30.61 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5502  DNA binding domain-containing protein  34.04 
 
 		 291 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0912  DNA binding domain protein, excisionase family  32.65 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1158  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 		 320 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4125  MerR family regulatory protein  48.94 
 
 		 51 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2798  DNA binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0612  phage transcriptional regulator, AlpA  32.61 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274045  normal  0.0916726 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1923  phage transcriptional regulator, AlpA  35.42 
 
 		 65 aa  42.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151509  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0554  phage transcriptional regulator, AlpA  27.78 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6742  DNA binding domain protein, excisionase family  30.61 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0413  DNA binding domain-containing protein  32.65 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229992 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6523  prophage CP4-57 regulatory  35.71 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3416  DNA binding domain protein, excisionase family  39.22 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3263  excision promoter, Xis  28.57 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4589  DNA binding domain protein, excisionase family  32.65 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2744  DNA binding domain protein, excisionase family  30.61 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.587836  hitchhiker  0.00613887 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1079  DNA-binding protein/PTS system, IIA component  35.9 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6047  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30.19 
 
 		 380 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0094  DNA binding domain-containing protein  34 
 
 		 87 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0288586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0291  DNA binding domain-containing protein  40.91 
 
 		 56 aa  40.8  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2133  DNA binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 252 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0343  DNA binding domain-containing protein  30.61 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.683411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0794  phage transcriptional regulator, AlpA  35.42 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1737  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 		 315 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2745  DNA binding domain-containing protein  36.96 
 
 		 300 aa  40  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1557  molybdate-binding protein  36.96 
 
 		 317 aa  40  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>