More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3695 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3695  putative helicase  100 
 
 		 676 aa  1405    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.783104  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0432  type III restriction protein res subunit  46.33 
 
 		 619 aa  523  1e-147  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6393  type III restriction protein res subunit  37.19 
 
 		 609 aa  295  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4408  type III restriction enzyme, res subunit  28.88 
 
 		 976 aa  165  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2984  type III restriction protein res subunit  26.88 
 
 		 1113 aa  120  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.135376  normal  0.189592 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5781  type III restriction protein res subunit  26.39 
 
 		 978 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0358672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5222  type III restriction protein res subunit  28.26 
 
 		 995 aa  115  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.276942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2131  DEAD/DEAH box helicase  29.21 
 
 		 1099 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.812467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1985  type III restriction enzyme, res subunit  25.4 
 
 		 1116 aa  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  25.47 
 
 		 813 aa  100  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  27.64 
 
 		 536 aa  100  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0992  type III restriction protein res subunit  29.11 
 
 		 938 aa  99  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.942343 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0066  type III restriction protein res subunit  27.32 
 
 		 1100 aa  98.6  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  26.47 
 
 		 815 aa  98.2  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  25.71 
 
 		 812 aa  98.6  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  24.84 
 
 		 1077 aa  94.7  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  28.4 
 
 		 560 aa  94  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  25.41 
 
 		 629 aa  90.9  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  27.97 
 
 		 967 aa  90.9  8e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  25.93 
 
 		 581 aa  90.5  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  23.8 
 
 		 459 aa  89.7  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  27.35 
 
 		 560 aa  89.4  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1908  type III restriction protein res subunit  23.12 
 
 		 586 aa  88.6  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1637  type III restriction protein res subunit  22.86 
 
 		 586 aa  88.2  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  27.5 
 
 		 560 aa  88.2  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  23.14 
 
 		 462 aa  87.4  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  26.27 
 
 		 1418 aa  86.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  22.79 
 
 		 1053 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  24.73 
 
 		 475 aa  86.3  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  23.8 
 
 		 993 aa  85.9  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3974  type III restriction enzyme, res subunit  24.55 
 
 		 1093 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.361688  normal  0.0160055 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  27.24 
 
 		 560 aa  86.3  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  27.24 
 
 		 560 aa  86.3  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  26.83 
 
 		 398 aa  85.9  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1537  helicase domain-containing protein  25.26 
 
 		 569 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453838  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  22.72 
 
 		 586 aa  85.5  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  24.22 
 
 		 590 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  25.41 
 
 		 773 aa  84.7  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  27.24 
 
 		 560 aa  84.7  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  25.39 
 
 		 583 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  23.22 
 
 		 586 aa  82.8  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  24.87 
 
 		 583 aa  81.3  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0977  type III restriction enzyme, res subunit  24.59 
 
 		 1063 aa  81.3  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  23.43 
 
 		 586 aa  80.9  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0449  type III restriction enzyme, res subunit  25.52 
 
 		 1062 aa  81.3  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.457161  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  23.96 
 
 		 590 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  26.12 
 
 		 848 aa  80.5  0.00000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  27.2 
 
 		 550 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0962  putative type III restriction enzyme  23.14 
 
 		 466 aa  80.5  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  25.07 
 
 		 1149 aa  80.1  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  26.32 
 
 		 953 aa  79.7  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  26.32 
 
 		 953 aa  79.7  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  24.9 
 
 		 949 aa  79.3  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3253  type III restriction protein res subunit  22.84 
 
 		 585 aa  79  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.503255  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1359  helicase, putative  25.62 
 
 		 1041 aa  79  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2695  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  26.56 
 
 		 504 aa  79  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.089972  hitchhiker  0.000356695 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2533  type III restriction protein res subunit  25 
 
 		 584 aa  79  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10242  hitchhiker  0.000564265 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  24.38 
 
 		 524 aa  78.6  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  24.68 
 
 		 1348 aa  78.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  24.42 
 
 		 602 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3456  type III restriction enzyme, res subunit  22.96 
 
 		 597 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  23.44 
 
 		 590 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  28.14 
 
 		 952 aa  77.8  0.0000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1790  type III restriction protein res subunit  24.02 
 
 		 584 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.766528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  26.64 
 
 		 967 aa  77.4  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1747  type III restriction protein res subunit  24.28 
 
 		 584 aa  77.4  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0541375  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1489  putative helicase  22.08 
 
 		 585 aa  77.4  0.0000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.931099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1258  type III restriction protein res subunit  22.83 
 
 		 787 aa  77.4  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.377183  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2719  putative helicase  22.08 
 
 		 585 aa  77  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00330465  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02470  DEAD box family helicase, putative  23.23 
 
 		 706 aa  76.6  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.384709  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2794  type III restriction protein res subunit  22.08 
 
 		 585 aa  77  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2726  type III restriction protein res subunit  22.96 
 
 		 580 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.219655  hitchhiker  0.000185767 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  27.39 
 
 		 385 aa  76.6  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3182  type III restriction protein res subunit  26.94 
 
 		 1029 aa  76.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  22.08 
 
 		 580 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1910  type III restriction enzyme, res subunit  25.29 
 
 		 1043 aa  76.3  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3192  type III restriction enzyme, res subunit  25.42 
 
 		 928 aa  75.5  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1751  type III restriction protein res subunit  24.02 
 
 		 584 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  24.55 
 
 		 583 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2492  type III restriction protein res subunit  25.3 
 
 		 1066 aa  75.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1862  type III restriction enzyme, res subunit  23.32 
 
 		 580 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.547726  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  25.88 
 
 		 545 aa  75.1  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1532  type III restriction enzyme, res subunit  22.74 
 
 		 579 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2089  type III restriction enzyme, res subunit  25.52 
 
 		 616 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.553683  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  24.89 
 
 		 1052 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  25.49 
 
 		 545 aa  74.3  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2080  helicase  24.48 
 
 		 588 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.453275  normal  0.977675 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3530  transposase, IS4 family protein  25.42 
 
 		 956 aa  74.3  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.793252  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  23.18 
 
 		 590 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2440  type III restriction protein res subunit  21.92 
 
 		 591 aa  73.6  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  25.88 
 
 		 1287 aa  73.6  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0810  DEAD/DEAH box helicase-like  22.11 
 
 		 797 aa  72.8  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135985  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1295  type III restriction enzyme, res subunit  22.83 
 
 		 584 aa  72.4  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1408  helicase, putative  23.86 
 
 		 987 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  23.32 
 
 		 469 aa  72  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0821  type III restriction protein res subunit  24.07 
 
 		 1042 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0473136 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  22.92 
 
 		 586 aa  71.6  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0368  helicase  26.69 
 
 		 982 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0301  type III restriction enzyme, res subunit  25.11 
 
 		 1051 aa  72  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.177385  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  22.92 
 
 		 586 aa  71.6  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>