193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4408 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4408  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 976 aa  1992    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1985  type III restriction enzyme, res subunit  27.22 
 
 		 1116 aa  304  6.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5222  type III restriction protein res subunit  27.84 
 
 		 995 aa  291  5.0000000000000004e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.276942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5781  type III restriction protein res subunit  26.93 
 
 		 978 aa  258  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0358672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2984  type III restriction protein res subunit  27.9 
 
 		 1113 aa  258  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.135376  normal  0.189592 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0066  type III restriction protein res subunit  26.09 
 
 		 1100 aa  241  2.9999999999999997e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3974  type III restriction enzyme, res subunit  26.32 
 
 		 1093 aa  241  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.361688  normal  0.0160055 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2131  DEAD/DEAH box helicase  33.42 
 
 		 1099 aa  184  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.812467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3695  putative helicase  28.16 
 
 		 676 aa  160  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.783104  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0432  type III restriction protein res subunit  30.87 
 
 		 619 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6393  type III restriction protein res subunit  27.76 
 
 		 609 aa  121  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  25.34 
 
 		 813 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  24.93 
 
 		 815 aa  77.8  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  22.36 
 
 		 848 aa  76.3  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  25.43 
 
 		 812 aa  76.3  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  24.93 
 
 		 536 aa  74.7  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  24.02 
 
 		 967 aa  72.8  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0992  type III restriction protein res subunit  27.08 
 
 		 938 aa  69.7  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.942343 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  24.36 
 
 		 773 aa  68.9  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  23.62 
 
 		 1077 aa  68.9  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  27.03 
 
 		 1418 aa  68.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  27.22 
 
 		 462 aa  68.6  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1089  type III restriction protein res subunit  26.8 
 
 		 1051 aa  68.6  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0977  type III restriction enzyme, res subunit  25.3 
 
 		 1063 aa  68.2  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  24.62 
 
 		 1149 aa  67.4  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3809  type III restriction enzyme, res subunit  25.3 
 
 		 1033 aa  66.6  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  28.66 
 
 		 1348 aa  67  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3530  transposase, IS4 family protein  28.83 
 
 		 956 aa  65.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.793252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  25 
 
 		 949 aa  65.1  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3192  type III restriction enzyme, res subunit  28.38 
 
 		 928 aa  65.1  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  25.8 
 
 		 475 aa  64.7  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  23.91 
 
 		 459 aa  64.3  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0368  helicase  27.43 
 
 		 982 aa  63.2  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2080  helicase  24.86 
 
 		 588 aa  63.5  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.453275  normal  0.977675 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1862  type III restriction enzyme, res subunit  23.77 
 
 		 580 aa  63.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.547726  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  25.58 
 
 		 1287 aa  62.8  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  24.48 
 
 		 469 aa  62.4  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  27.66 
 
 		 993 aa  62.4  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2754  hypothetical protein  23.29 
 
 		 526 aa  62.4  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  27 
 
 		 524 aa  61.6  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  26.52 
 
 		 949 aa  62  0.00000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  24.14 
 
 		 905 aa  61.6  0.00000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1910  type III restriction enzyme, res subunit  26.27 
 
 		 1043 aa  61.6  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3456  type III restriction enzyme, res subunit  23.71 
 
 		 597 aa  60.8  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2440  type III restriction protein res subunit  30.19 
 
 		 591 aa  60.5  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  26.01 
 
 		 998 aa  60.1  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0449  type III restriction enzyme, res subunit  25.91 
 
 		 1062 aa  59.7  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.457161  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3738  type III restriction protein res subunit  26.75 
 
 		 1035 aa  59.3  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3182  type III restriction protein res subunit  26.72 
 
 		 1029 aa  59.3  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  23.79 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1258  type III restriction protein res subunit  24.06 
 
 		 787 aa  58.9  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.377183  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0370  type III restriction protein res subunit  26.43 
 
 		 1055 aa  58.9  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0484136  hitchhiker  0.000113274 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  24.59 
 
 		 586 aa  58.9  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1242  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  24.45 
 
 		 657 aa  58.5  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000376746  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1543  type III restriction protein res subunit  25.32 
 
 		 979 aa  58.5  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  22.25 
 
 		 586 aa  58.5  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0822  DEAD/DEAH box helicase-like  25.11 
 
 		 1065 aa  58.2  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.317818  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  24.15 
 
 		 590 aa  58.5  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0337  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  23.99 
 
 		 979 aa  58.2  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0301  type III restriction enzyme, res subunit  25.34 
 
 		 1051 aa  57.4  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.177385  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  23.16 
 
 		 590 aa  57  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  25 
 
 		 967 aa  56.6  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  26.11 
 
 		 1052 aa  57  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  27.43 
 
 		 1055 aa  56.6  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17070  DNA/RNA helicase, superfamily II  26.02 
 
 		 1031 aa  56.2  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  24.27 
 
 		 580 aa  55.8  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  24.93 
 
 		 590 aa  56.2  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  25.2 
 
 		 590 aa  56.2  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0360  type III restriction protein res subunit  27.43 
 
 		 1055 aa  56.2  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1747  type III restriction protein res subunit  25.33 
 
 		 584 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0541375  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3842  type III restriction enzyme, res subunit  25.34 
 
 		 1061 aa  55.8  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1295  type III restriction enzyme, res subunit  21.72 
 
 		 584 aa  55.8  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0844  type III restriction enzyme, res subunit  26.94 
 
 		 613 aa  55.5  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  23.5 
 
 		 586 aa  55.5  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  23.94 
 
 		 1017 aa  55.1  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  22.22 
 
 		 583 aa  55.1  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  21.99 
 
 		 629 aa  55.1  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  23.39 
 
 		 586 aa  55.1  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  23.5 
 
 		 586 aa  55.1  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  23.5 
 
 		 586 aa  54.7  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  23.5 
 
 		 586 aa  54.7  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  23.5 
 
 		 586 aa  54.7  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1408  helicase, putative  27.15 
 
 		 987 aa  54.7  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  23.5 
 
 		 586 aa  54.7  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1790  type III restriction protein res subunit  24.8 
 
 		 584 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.766528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2533  type III restriction protein res subunit  23.92 
 
 		 584 aa  54.3  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10242  hitchhiker  0.000564265 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3253  type III restriction protein res subunit  30.06 
 
 		 585 aa  53.9  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.503255  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  22.42 
 
 		 953 aa  53.9  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  23.62 
 
 		 974 aa  53.9  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  22.42 
 
 		 953 aa  53.9  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  25.61 
 
 		 485 aa  53.5  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  24.86 
 
 		 545 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  24.04 
 
 		 586 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4384  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.92 
 
 		 1166 aa  53.5  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0169007  normal  0.744052 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1751  type III restriction protein res subunit  24.27 
 
 		 584 aa  53.5  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  24.19 
 
 		 586 aa  53.5  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  21.95 
 
 		 583 aa  53.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  24.32 
 
 		 586 aa  52.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  24.32 
 
 		 586 aa  53.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  24.32 
 
 		 586 aa  52.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>