More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0432 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0432  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 619 aa  1260    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3695  putative helicase  46.33 
 
 		 676 aa  519  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.783104  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6393  type III restriction protein res subunit  35.87 
 
 		 609 aa  312  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4408  type III restriction enzyme, res subunit  30.87 
 
 		 976 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2984  type III restriction protein res subunit  28.22 
 
 		 1113 aa  123  9e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.135376  normal  0.189592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1985  type III restriction enzyme, res subunit  26.9 
 
 		 1116 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5222  type III restriction protein res subunit  26.52 
 
 		 995 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.276942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3974  type III restriction enzyme, res subunit  29.4 
 
 		 1093 aa  103  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.361688  normal  0.0160055 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5781  type III restriction protein res subunit  27.61 
 
 		 978 aa  103  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0358672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0066  type III restriction protein res subunit  25.58 
 
 		 1100 aa  102  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  29.27 
 
 		 815 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  27.24 
 
 		 536 aa  97.8  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  25.97 
 
 		 629 aa  97.4  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2131  DEAD/DEAH box helicase  27.13 
 
 		 1099 aa  97.1  9e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.812467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  24.94 
 
 		 462 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  26.52 
 
 		 813 aa  96.7  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  27.17 
 
 		 812 aa  94.4  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0992  type III restriction protein res subunit  27.51 
 
 		 938 aa  92.8  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.942343 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  24.16 
 
 		 586 aa  92.4  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  25.67 
 
 		 459 aa  92  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  23.68 
 
 		 469 aa  89.7  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  25.21 
 
 		 475 aa  89.7  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  27.2 
 
 		 524 aa  87.8  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  25.85 
 
 		 590 aa  87.8  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  24.74 
 
 		 583 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  24.35 
 
 		 586 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  25.77 
 
 		 1077 aa  85.9  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3253  type III restriction protein res subunit  23.58 
 
 		 585 aa  86.3  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.503255  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  25.85 
 
 		 590 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  24.35 
 
 		 586 aa  85.5  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  24.32 
 
 		 560 aa  85.5  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  23.83 
 
 		 586 aa  85.1  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1637  type III restriction protein res subunit  22.88 
 
 		 586 aa  84.7  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2080  helicase  24.87 
 
 		 588 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.453275  normal  0.977675 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  24.32 
 
 		 560 aa  84.7  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  24.32 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  24.35 
 
 		 586 aa  84  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  24.09 
 
 		 586 aa  83.6  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  24.35 
 
 		 586 aa  83.6  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  24.09 
 
 		 586 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  24.09 
 
 		 586 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  24.09 
 
 		 586 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  24.62 
 
 		 560 aa  83.6  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1862  type III restriction enzyme, res subunit  23.64 
 
 		 580 aa  82  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.547726  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  24.03 
 
 		 586 aa  81.6  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  26.62 
 
 		 1348 aa  81.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  23.58 
 
 		 586 aa  80.9  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  23.79 
 
 		 560 aa  80.5  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  23.69 
 
 		 560 aa  80.5  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  23.58 
 
 		 586 aa  80.5  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  26.07 
 
 		 545 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4439  type III restriction protein res subunit  23.83 
 
 		 510 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.226232  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2440  type III restriction protein res subunit  22.73 
 
 		 591 aa  79.7  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  23.86 
 
 		 848 aa  80.1  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  23.58 
 
 		 586 aa  80.1  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  23.58 
 
 		 586 aa  80.1  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  27.95 
 
 		 1418 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  23.79 
 
 		 602 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  24.8 
 
 		 590 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  23.58 
 
 		 586 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2726  type III restriction protein res subunit  24.23 
 
 		 580 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.219655  hitchhiker  0.000185767 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1089  type III restriction protein res subunit  24.41 
 
 		 1051 aa  80.1  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  25 
 
 		 550 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  23.16 
 
 		 585 aa  79.7  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  22.74 
 
 		 560 aa  79  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  24.6 
 
 		 607 aa  79  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1295  type III restriction enzyme, res subunit  22.7 
 
 		 584 aa  79.3  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3456  type III restriction enzyme, res subunit  23.85 
 
 		 597 aa  79  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  25.2 
 
 		 590 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  22.99 
 
 		 1053 aa  78.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2719  putative helicase  23.08 
 
 		 585 aa  78.2  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00330465  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0844  type III restriction enzyme, res subunit  24.43 
 
 		 613 aa  78.2  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1489  putative helicase  23.08 
 
 		 585 aa  78.6  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.931099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0977  type III restriction enzyme, res subunit  25.43 
 
 		 1063 aa  78.2  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2794  type III restriction protein res subunit  23.08 
 
 		 585 aa  78.2  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1408  helicase, putative  23.48 
 
 		 987 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1543  type III restriction protein res subunit  24.93 
 
 		 979 aa  76.6  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1537  helicase domain-containing protein  26.06 
 
 		 569 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453838  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1908  type III restriction protein res subunit  21.93 
 
 		 586 aa  76.3  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  24.08 
 
 		 606 aa  75.9  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0821  type III restriction protein res subunit  25.71 
 
 		 1042 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0473136 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3182  type III restriction protein res subunit  25.3 
 
 		 1029 aa  75.5  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  22.97 
 
 		 581 aa  75.1  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  26.07 
 
 		 545 aa  74.7  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  25.38 
 
 		 773 aa  74.3  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1790  type III restriction protein res subunit  24.62 
 
 		 584 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.766528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1747  type III restriction protein res subunit  24.62 
 
 		 584 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0541375  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1359  helicase, putative  23.1 
 
 		 1041 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3530  transposase, IS4 family protein  25.74 
 
 		 956 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.793252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3192  type III restriction enzyme, res subunit  26.04 
 
 		 928 aa  73.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0449  type III restriction enzyme, res subunit  24.81 
 
 		 1062 aa  73.6  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.457161  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2082  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  26.01 
 
 		 574 aa  72.8  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  24.17 
 
 		 385 aa  72.8  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1751  type III restriction protein res subunit  25.13 
 
 		 584 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  21.51 
 
 		 643 aa  72.4  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  25.5 
 
 		 545 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  21.73 
 
 		 580 aa  72  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2533  type III restriction protein res subunit  23.92 
 
 		 584 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10242  hitchhiker  0.000564265 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  21.99 
 
 		 583 aa  71.6  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1532  type III restriction enzyme, res subunit  23.39 
 
 		 579 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413566  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>