76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2131 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2131  DEAD/DEAH box helicase  100 
 
 		 1099 aa  2258    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.812467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0066  type III restriction protein res subunit  54.78 
 
 		 1100 aa  1189    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2984  type III restriction protein res subunit  32.29 
 
 		 1113 aa  482  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.135376  normal  0.189592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1985  type III restriction enzyme, res subunit  34.29 
 
 		 1116 aa  474  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3974  type III restriction enzyme, res subunit  32.34 
 
 		 1093 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.361688  normal  0.0160055 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5781  type III restriction protein res subunit  31.25 
 
 		 978 aa  444  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0358672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5222  type III restriction protein res subunit  31.51 
 
 		 995 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.276942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4408  type III restriction enzyme, res subunit  33.42 
 
 		 976 aa  194  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2754  hypothetical protein  26.97 
 
 		 526 aa  159  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3695  putative helicase  29.37 
 
 		 676 aa  115  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.783104  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0432  type III restriction protein res subunit  27.66 
 
 		 619 aa  105  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6393  type III restriction protein res subunit  27.25 
 
 		 609 aa  94.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2408  DEAD/DEAH box helicase, putative  26.61 
 
 		 809 aa  65.1  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2039  type III restriction protein res subunit  26.61 
 
 		 809 aa  65.1  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  25.42 
 
 		 815 aa  64.7  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0006  type III restriction enzyme, res subunit  28.7 
 
 		 768 aa  62.8  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  24.79 
 
 		 813 aa  61.6  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0307  type III restriction protein res subunit  26.63 
 
 		 784 aa  60.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1543  type III restriction protein res subunit  25.07 
 
 		 979 aa  60.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0789  type III restriction protein res subunit  24.76 
 
 		 795 aa  59.3  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.891259  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  24.56 
 
 		 949 aa  58.5  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  23.92 
 
 		 459 aa  56.2  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  26.39 
 
 		 796 aa  55.8  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0366  type III restriction protein res subunit  24.41 
 
 		 1012 aa  56.2  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.64384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  22.81 
 
 		 848 aa  53.5  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0337  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  25.69 
 
 		 979 aa  53.5  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  22.99 
 
 		 967 aa  52.8  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2244  type III restriction protein res subunit  24.93 
 
 		 788 aa  52.8  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450731  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  25.61 
 
 		 462 aa  52.4  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1316  type III restriction enzyme, res subunit  24.17 
 
 		 796 aa  52.4  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0717  type III restriction protein res subunit  24.52 
 
 		 794 aa  52  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1258  type III restriction protein res subunit  26.72 
 
 		 787 aa  51.6  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.377183  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  25.55 
 
 		 479 aa  50.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  27.27 
 
 		 524 aa  50.8  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0977  type III restriction enzyme, res subunit  25.68 
 
 		 1063 aa  50.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1416  type III restriction protein, res subunit  25.53 
 
 		 920 aa  51.2  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8756  type III restriction enzyme, res subunit  25.09 
 
 		 1028 aa  50.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  24.79 
 
 		 812 aa  50.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  22.63 
 
 		 952 aa  49.7  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  25.38 
 
 		 479 aa  48.9  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  25.3 
 
 		 654 aa  48.9  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  22.49 
 
 		 953 aa  48.5  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0301  type III restriction enzyme, res subunit  24.88 
 
 		 1051 aa  48.5  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.177385  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  22.49 
 
 		 953 aa  48.5  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3842  type III restriction enzyme, res subunit  24.88 
 
 		 1061 aa  47.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  23.95 
 
 		 773 aa  47.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1034  type III restriction protein res subunit  24.16 
 
 		 1126 aa  47.8  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0485696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  22.54 
 
 		 967 aa  48.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  25 
 
 		 998 aa  48.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0368  helicase  23.47 
 
 		 982 aa  48.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  24.93 
 
 		 479 aa  47.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2440  type III restriction protein res subunit  24.07 
 
 		 591 aa  47  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  23.94 
 
 		 1017 aa  46.6  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3456  type III restriction enzyme, res subunit  25.07 
 
 		 597 aa  47  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1359  helicase, putative  27.59 
 
 		 1041 aa  47  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  24.87 
 
 		 586 aa  47  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3182  type III restriction protein res subunit  25.88 
 
 		 1029 aa  46.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  23.64 
 
 		 586 aa  46.6  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1408  helicase, putative  25.45 
 
 		 987 aa  46.6  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  24.3 
 
 		 1052 aa  46.2  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  24.15 
 
 		 586 aa  46.2  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  27.98 
 
 		 1348 aa  45.8  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  26.9 
 
 		 1418 aa  46.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3809  type III restriction enzyme, res subunit  25.96 
 
 		 1033 aa  45.8  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  25.89 
 
 		 647 aa  46.2  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2724  helicase domain protein  27.78 
 
 		 648 aa  46.2  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000143899  hitchhiker  0.000226715 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0992  type III restriction protein res subunit  24.65 
 
 		 938 aa  45.8  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.942343 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  23.28 
 
 		 949 aa  45.8  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  24.7 
 
 		 536 aa  45.8  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0388  type III restriction protein res subunit  23.74 
 
 		 907 aa  45.4  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000267171 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0796  type III restriction protein res subunit  31.19 
 
 		 598 aa  45.4  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42368  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1089  type III restriction protein res subunit  24.45 
 
 		 1051 aa  45.4  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07860  ATP-dependent RNA helicase ded1, putative  22.07 
 
 		 637 aa  45.4  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  25.52 
 
 		 652 aa  44.7  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004445  ATP-dependent RNA helicase SrmB  24.72 
 
 		 407 aa  44.7  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0454053  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  23.81 
 
 		 545 aa  44.7  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>