88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0366 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0366  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 1012 aa  2080    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.64384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3844  type III restriction enzyme, res subunit  38.89 
 
 		 1020 aa  687    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.65672  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5222  type III restriction protein res subunit  23.63 
 
 		 995 aa  75.1  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.276942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0432  type III restriction protein res subunit  24.29 
 
 		 619 aa  63.9  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  24.23 
 
 		 479 aa  60.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  23.49 
 
 		 479 aa  59.7  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  23.62 
 
 		 479 aa  59.3  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0066  type III restriction protein res subunit  25.71 
 
 		 1100 aa  58.2  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2984  type III restriction protein res subunit  23.5 
 
 		 1113 aa  57.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.135376  normal  0.189592 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3695  putative helicase  21.53 
 
 		 676 aa  57  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.783104  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5781  type III restriction protein res subunit  23.28 
 
 		 978 aa  57  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0358672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  23.2 
 
 		 485 aa  56.6  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6393  type III restriction protein res subunit  23.68 
 
 		 609 aa  57  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1128  type III restriction enzyme, res subunit  25 
 
 		 932 aa  55.8  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  23.2 
 
 		 485 aa  55.5  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  23.17 
 
 		 479 aa  55.5  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1456  type III restriction protein res subunit  25.24 
 
 		 932 aa  55.1  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1985  type III restriction enzyme, res subunit  23.05 
 
 		 1116 aa  54.7  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2131  DEAD/DEAH box helicase  28.35 
 
 		 1099 aa  54.3  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.812467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4243  type III restriction protein res subunit  23.93 
 
 		 933 aa  53.5  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  24.53 
 
 		 548 aa  53.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2739  helicase domain protein  23.65 
 
 		 564 aa  53.5  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.628328  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  22.5 
 
 		 463 aa  52.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4439  type III restriction protein res subunit  29.49 
 
 		 510 aa  52.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.226232  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  25.15 
 
 		 796 aa  52.8  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.53 
 
 		 714 aa  52.8  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1523  DEAD/DEAH box helicase-like  23.7 
 
 		 936 aa  52.8  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2721  helicase domain-containing protein  26.21 
 
 		 590 aa  52.4  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34360  DNA/RNA helicase, superfamily II  28.65 
 
 		 548 aa  52  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3974  type III restriction enzyme, res subunit  32.92 
 
 		 1093 aa  52  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.361688  normal  0.0160055 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  21.52 
 
 		 953 aa  51.6  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  21.52 
 
 		 953 aa  51.6  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2089  type III restriction enzyme, res subunit  23.26 
 
 		 616 aa  51.2  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.553683  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  30.95 
 
 		 456 aa  51.2  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  21.52 
 
 		 815 aa  50.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  23.74 
 
 		 475 aa  51.2  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  29.53 
 
 		 451 aa  50.1  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  22.81 
 
 		 462 aa  49.7  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1302  putative helicase  22.28 
 
 		 516 aa  49.7  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10878  DNA helicase ercc3  28.24 
 
 		 542 aa  49.7  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000621155  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4553  ATP-dependent DNA helicase RecQ  23.39 
 
 		 864 aa  49.7  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0297  ATP-dependent DNA helicase RecQ  24.1 
 
 		 725 aa  49.7  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  24.42 
 
 		 666 aa  49.7  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  25 
 
 		 548 aa  48.9  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0809  type III restriction protein res subunit  23.53 
 
 		 556 aa  48.1  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  22.71 
 
 		 949 aa  48.1  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  24.43 
 
 		 545 aa  48.1  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3950  helicase domain-containing protein  23.99 
 
 		 581 aa  48.1  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.626862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0803  type III restriction protein res subunit  23.57 
 
 		 561 aa  48.1  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  22.65 
 
 		 606 aa  47.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  20.47 
 
 		 952 aa  47.8  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0083  ATP-dependent DNA helicase RecQ  22.38 
 
 		 615 aa  48.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2724  type III restriction protein res subunit  23.53 
 
 		 936 aa  47.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  26.16 
 
 		 1418 aa  47.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  25 
 
 		 549 aa  47.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  28.93 
 
 		 451 aa  47.4  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00903  RecQ domain protein  29.11 
 
 		 679 aa  47  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  22.43 
 
 		 451 aa  47  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  20.11 
 
 		 1149 aa  47  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1697  type III restriction enzyme, res subunit  23.21 
 
 		 549 aa  47  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3431  hypothetical protein  33.06 
 
 		 593 aa  47  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  23.42 
 
 		 558 aa  47  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1210  helicase domain protein  27.06 
 
 		 555 aa  46.6  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  28.93 
 
 		 451 aa  47  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  23.8 
 
 		 545 aa  47  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  23.13 
 
 		 649 aa  46.2  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3296  helicase domain-containing protein  22.42 
 
 		 551 aa  46.2  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.553593 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0332  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.32 
 
 		 613 aa  46.2  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  23.14 
 
 		 630 aa  46.2  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4296  ATP-dependent DNA helicase RecQ  23.82 
 
 		 715 aa  46.2  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0839194  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4341  helicase domain-containing protein  28.24 
 
 		 559 aa  46.2  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0453  type III restriction protein res subunit  28.05 
 
 		 550 aa  45.8  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  20.12 
 
 		 499 aa  45.8  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4206  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.82 
 
 		 628 aa  45.8  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  24.3 
 
 		 455 aa  45.4  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0899  hypothetical protein  22.22 
 
 		 608 aa  45.4  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0930  hypothetical protein  22.39 
 
 		 608 aa  45.4  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  23.8 
 
 		 951 aa  45.4  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  22.49 
 
 		 705 aa  45.1  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  22.36 
 
 		 736 aa  45.1  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.765409 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4868  type III restriction enzyme, res subunit  27.06 
 
 		 549 aa  44.7  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4572  type III restriction enzyme, res subunit  27.06 
 
 		 549 aa  44.7  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0637895 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0015  ATP-dependent DNA helicase RecQ  24.85 
 
 		 656 aa  44.7  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4485  type III restriction enzyme, res subunit  27.06 
 
 		 549 aa  44.7  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0905  helicase domain protein  22.43 
 
 		 548 aa  44.7  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.223145 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  24.61 
 
 		 558 aa  44.7  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1920  type III restriction enzyme, res subunit  23.58 
 
 		 946 aa  44.7  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3947  helicase domain-containing protein  24.86 
 
 		 546 aa  44.7  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>