201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2984 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3974  type III restriction enzyme, res subunit  38.91 
 
 		 1093 aa  676    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.361688  normal  0.0160055 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2984  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 1113 aa  2286    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.135376  normal  0.189592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1985  type III restriction enzyme, res subunit  36.32 
 
 		 1116 aa  588  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5222  type III restriction protein res subunit  35.34 
 
 		 995 aa  557  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.276942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5781  type III restriction protein res subunit  33.98 
 
 		 978 aa  528  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0358672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0066  type III restriction protein res subunit  31.72 
 
 		 1100 aa  500  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2131  DEAD/DEAH box helicase  32.2 
 
 		 1099 aa  491  1e-137  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.812467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4408  type III restriction enzyme, res subunit  27.9 
 
 		 976 aa  273  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2754  hypothetical protein  34.89 
 
 		 526 aa  235  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0432  type III restriction protein res subunit  28.22 
 
 		 619 aa  127  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6393  type III restriction protein res subunit  27.4 
 
 		 609 aa  119  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3695  putative helicase  27.15 
 
 		 676 aa  118  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.783104  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  27.39 
 
 		 815 aa  85.9  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  26.48 
 
 		 813 aa  83.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0992  type III restriction protein res subunit  26.43 
 
 		 938 aa  82.4  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.942343 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  25.31 
 
 		 586 aa  81.3  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2089  type III restriction enzyme, res subunit  25.89 
 
 		 616 aa  79.7  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.553683  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  24.62 
 
 		 583 aa  79.3  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3456  type III restriction enzyme, res subunit  26.7 
 
 		 597 aa  77.4  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  24.74 
 
 		 590 aa  76.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  24.23 
 
 		 590 aa  74.7  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  24.42 
 
 		 586 aa  73.9  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  24.23 
 
 		 590 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  24.48 
 
 		 590 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0844  type III restriction enzyme, res subunit  25.31 
 
 		 613 aa  72.4  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3774  type III restriction protein res subunit  26.32 
 
 		 583 aa  71.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.476443  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3253  type III restriction protein res subunit  24.16 
 
 		 585 aa  70.5  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.503255  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  23.7 
 
 		 585 aa  69.3  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  24.73 
 
 		 545 aa  68.9  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  22.68 
 
 		 583 aa  69.3  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1862  type III restriction enzyme, res subunit  23.98 
 
 		 580 aa  68.9  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.547726  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  26.61 
 
 		 607 aa  68.9  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  26.7 
 
 		 606 aa  68.9  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1537  helicase domain-containing protein  26.84 
 
 		 569 aa  68.2  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453838  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1489  putative helicase  24.35 
 
 		 585 aa  67.4  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.931099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  24.36 
 
 		 545 aa  67.8  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2794  type III restriction protein res subunit  24.35 
 
 		 585 aa  67.4  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  26.39 
 
 		 462 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2719  putative helicase  24.35 
 
 		 585 aa  67.4  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00330465  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  25.26 
 
 		 545 aa  67.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  22.68 
 
 		 583 aa  67  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1242  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  24.23 
 
 		 657 aa  65.9  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000376746  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2082  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  22.28 
 
 		 574 aa  65.5  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3192  type III restriction enzyme, res subunit  26.81 
 
 		 928 aa  65.5  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1532  type III restriction enzyme, res subunit  24.68 
 
 		 579 aa  65.5  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  26.43 
 
 		 848 aa  63.9  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  25.93 
 
 		 550 aa  63.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  25.32 
 
 		 586 aa  62.8  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3530  transposase, IS4 family protein  26.2 
 
 		 956 aa  62.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.793252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  23.64 
 
 		 586 aa  63.2  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1637  type III restriction protein res subunit  23.97 
 
 		 586 aa  62.8  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2533  type III restriction protein res subunit  22.42 
 
 		 584 aa  62.8  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10242  hitchhiker  0.000564265 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2440  type III restriction protein res subunit  23.33 
 
 		 591 aa  62.4  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1295  type III restriction enzyme, res subunit  22.88 
 
 		 584 aa  62.4  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1790  type III restriction protein res subunit  22.42 
 
 		 584 aa  62  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.766528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2726  type III restriction protein res subunit  23.77 
 
 		 580 aa  62  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.219655  hitchhiker  0.000185767 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1751  type III restriction protein res subunit  22.42 
 
 		 584 aa  61.6  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1747  type III restriction protein res subunit  22.11 
 
 		 584 aa  61.6  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0541375  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0822  DEAD/DEAH box helicase-like  27.27 
 
 		 1065 aa  60.8  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.317818  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  24.48 
 
 		 586 aa  60.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  24.48 
 
 		 586 aa  60.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1908  type III restriction protein res subunit  23.91 
 
 		 586 aa  61.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2080  helicase  24.93 
 
 		 588 aa  61.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.453275  normal  0.977675 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  24.48 
 
 		 586 aa  60.1  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  24.48 
 
 		 586 aa  60.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1258  type III restriction protein res subunit  24.81 
 
 		 787 aa  60.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.377183  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  21.85 
 
 		 602 aa  60.1  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  25.64 
 
 		 581 aa  60.1  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  25.06 
 
 		 586 aa  59.7  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  25.06 
 
 		 586 aa  59.7  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  24.74 
 
 		 586 aa  59.7  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  24.74 
 
 		 586 aa  59.7  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  25.06 
 
 		 586 aa  59.7  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  24.74 
 
 		 586 aa  59.7  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  26.13 
 
 		 560 aa  59.7  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4538  type III restriction protein res subunit  25.45 
 
 		 565 aa  59.7  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  23.21 
 
 		 812 aa  59.7  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20110  DNA/RNA helicase, superfamily II  26.12 
 
 		 606 aa  59.3  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.24796  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24400  DNA/RNA helicase, superfamily II  24.38 
 
 		 592 aa  59.3  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  23.97 
 
 		 586 aa  59.3  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  26.52 
 
 		 558 aa  58.9  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2917  type III restriction enzyme, res subunit  21.96 
 
 		 538 aa  58.5  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.633235  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  22.08 
 
 		 580 aa  58.5  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  24.93 
 
 		 949 aa  58.2  0.0000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0366  type III restriction protein res subunit  23.5 
 
 		 1012 aa  57.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.64384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3182  type III restriction protein res subunit  24.71 
 
 		 1029 aa  57.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  24.25 
 
 		 1149 aa  57.4  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5135  type III restriction protein res subunit  26.46 
 
 		 622 aa  57.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  24.65 
 
 		 524 aa  58.2  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  24.23 
 
 		 586 aa  57.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0368  helicase  24.12 
 
 		 982 aa  56.6  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  24.11 
 
 		 560 aa  56.6  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  26.24 
 
 		 560 aa  57  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0307  Type III restriction enzyme, res subunit  24.61 
 
 		 539 aa  56.2  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0435132  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3651  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  24.87 
 
 		 1126 aa  56.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.408969 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  22.25 
 
 		 459 aa  56.2  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0006  type III restriction enzyme, res subunit  25.97 
 
 		 768 aa  55.5  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08280  DNA/RNA helicase, superfamily II  25.38 
 
 		 606 aa  55.5  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.265179  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  26.73 
 
 		 1348 aa  55.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  24.53 
 
 		 949 aa  55.1  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>