More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5963 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0416  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.53 
 
 		 725 aa  790    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.65575 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0775  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.12 
 
 		 733 aa  810    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12343  putative ATP-dependent DNA helicase  54.08 
 
 		 734 aa  803    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.839573  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3602  ATP-dependent DNA helicase RecQ  74.93 
 
 		 737 aa  1184    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.436547 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0281  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.27 
 
 		 731 aa  781    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1165  hypothetical protein  55.8 
 
 		 724 aa  828    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.402826 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1951  ATP-dependent DNA helicase RecQ  51.36 
 
 		 729 aa  780    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0297  ATP-dependent DNA helicase RecQ  65.7 
 
 		 725 aa  1009    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 		 736 aa  1524    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.765409 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2064  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.37 
 
 		 729 aa  822    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256854  normal  0.150426 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.84 
 
 		 603 aa  525  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1667  ATP-requiring DNA helicase RecQ  42.12 
 
 		 615 aa  513  1e-144  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0061  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.32 
 
 		 647 aa  513  1e-144  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0053  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.75 
 
 		 619 aa  513  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.76 
 
 		 615 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4285  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.76 
 
 		 615 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.362747 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0072  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.42 
 
 		 674 aa  510  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.234386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2101  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.04 
 
 		 625 aa  511  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4166  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.17 
 
 		 615 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.86 
 
 		 599 aa  509  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4296  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.5 
 
 		 715 aa  509  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0839194  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  41.92 
 
 		 611 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.92 
 
 		 611 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  41.92 
 
 		 609 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.19 
 
 		 608 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.97 
 
 		 596 aa  508  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.92 
 
 		 609 aa  506  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.72 
 
 		 601 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3103  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.57 
 
 		 601 aa  508  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.69477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.4 
 
 		 599 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.36 
 
 		 608 aa  508  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4187  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.6 
 
 		 615 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4345  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.6 
 
 		 615 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0695  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.93 
 
 		 612 aa  506  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.02 
 
 		 607 aa  507  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.92 
 
 		 611 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.695622 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.67 
 
 		 601 aa  509  9.999999999999999e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.92 
 
 		 609 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4516  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.47 
 
 		 715 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0041  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.6 
 
 		 615 aa  503  1e-141  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00446699  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2993  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.02 
 
 		 633 aa  504  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768661  normal  0.830913 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1604  ATP-dependent DNA helicase  44.33 
 
 		 601 aa  504  1e-141  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.92 
 
 		 609 aa  504  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1171  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.23 
 
 		 881 aa  504  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4022  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.35 
 
 		 715 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0251984 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.92 
 
 		 609 aa  503  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.47 
 
 		 715 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3805  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.28 
 
 		 714 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824216  hitchhiker  0.00000305051 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.92 
 
 		 611 aa  505  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.57 
 
 		 599 aa  504  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1931  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.09 
 
 		 711 aa  504  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161576  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.63 
 
 		 610 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3998  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.63 
 
 		 597 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0373347  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.43 
 
 		 709 aa  499  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0870  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.33 
 
 		 611 aa  500  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.36 
 
 		 620 aa  501  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0555  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.63 
 
 		 610 aa  499  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32800  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.07 
 
 		 707 aa  501  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0649  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.52 
 
 		 600 aa  496  1e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.16 
 
 		 598 aa  497  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3738  ATP-dependent DNA helicase RecQ:ATP-requiring DNA helicase RecQ  41.54 
 
 		 709 aa  495  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145176  normal  0.0175539 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.93 
 
 		 617 aa  497  1e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4306  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.83 
 
 		 607 aa  498  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.03 
 
 		 712 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1812  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.39 
 
 		 710 aa  498  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646087  normal  0.880119 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.78 
 
 		 714 aa  497  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3974  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.68 
 
 		 609 aa  493  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.172016  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1644  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.91 
 
 		 709 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0734  ATP-dependent DNA helicase  42.36 
 
 		 600 aa  495  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.792164  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.55 
 
 		 718 aa  495  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1786  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.11 
 
 		 711 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0953  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.94 
 
 		 611 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.94 
 
 		 611 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5313  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.78 
 
 		 616 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4701  ATP-dependent DNA helicase, RecQ  43.09 
 
 		 618 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6924  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.64 
 
 		 625 aa  491  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.286849 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1711  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.23 
 
 		 624 aa  491  1e-137  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.41 
 
 		 731 aa  492  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0299  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.32 
 
 		 609 aa  487  1e-136  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236448  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0514  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.96 
 
 		 599 aa  486  1e-136  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2446  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.36 
 
 		 739 aa  488  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.772322  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3687  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.44 
 
 		 612 aa  487  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1868  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.86 
 
 		 719 aa  484  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.17 
 
 		 605 aa  484  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00245617  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0089  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.37 
 
 		 629 aa  484  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0181751  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4412  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.67 
 
 		 619 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.659664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0224  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.39 
 
 		 611 aa  482  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1438  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.33 
 
 		 625 aa  484  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.1 
 
 		 611 aa  481  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0839  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.2 
 
 		 626 aa  481  1e-134  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.305009 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.63 
 
 		 614 aa  481  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.486098  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2981  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.89 
 
 		 693 aa  481  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2808  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.73 
 
 		 705 aa  479  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0391  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.97 
 
 		 607 aa  479  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000840098 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0153  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.3 
 
 		 633 aa  481  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41 
 
 		 606 aa  478  1e-133  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1489  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.26 
 
 		 603 aa  477  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0818763 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2984  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.73 
 
 		 600 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.31482 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0635  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.79 
 
 		 748 aa  476  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000112896  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.89 
 
 		 602 aa  478  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>