57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3844 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3844  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 1020 aa  2099    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.65672  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0366  type III restriction protein res subunit  38.89 
 
 		 1012 aa  687    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.64384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5781  type III restriction protein res subunit  23.89 
 
 		 978 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0358672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0432  type III restriction protein res subunit  22.98 
 
 		 619 aa  66.2  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  24.52 
 
 		 475 aa  65.1  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1094  type III restriction enzyme, res subunit  24.53 
 
 		 945 aa  62.4  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5514  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  23.02 
 
 		 630 aa  62  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3695  putative helicase  19.84 
 
 		 676 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.783104  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  22.22 
 
 		 967 aa  56.6  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  22.25 
 
 		 462 aa  55.8  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  22.62 
 
 		 560 aa  54.3  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  29.33 
 
 		 583 aa  54.3  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  29.31 
 
 		 585 aa  54.3  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  28.26 
 
 		 583 aa  53.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2082  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  27.81 
 
 		 574 aa  52.4  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1306  type III restriction enzyme, res subunit family  22.01 
 
 		 786 aa  52  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.986066 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  22.22 
 
 		 1053 aa  52  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  21.65 
 
 		 479 aa  51.6  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2984  type III restriction protein res subunit  22.81 
 
 		 1113 aa  50.8  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.135376  normal  0.189592 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  23.36 
 
 		 1149 aa  50.8  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  23.31 
 
 		 643 aa  51.2  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  21.52 
 
 		 463 aa  50.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  29.8 
 
 		 469 aa  50.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0717  type III restriction protein res subunit  23.45 
 
 		 794 aa  50.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6393  type III restriction protein res subunit  25.79 
 
 		 609 aa  49.7  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  21.24 
 
 		 629 aa  49.7  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3146  type III restriction protein res subunit  22.77 
 
 		 630 aa  48.9  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0164842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  21.84 
 
 		 812 aa  48.9  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0388  type III restriction protein res subunit  23.39 
 
 		 907 aa  48.5  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000267171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  22.88 
 
 		 479 aa  48.1  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  38.1 
 
 		 951 aa  47.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  21.2 
 
 		 440 aa  47.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1242  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  28.16 
 
 		 657 aa  47.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000376746  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  26.72 
 
 		 443 aa  48.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5222  type III restriction protein res subunit  23.14 
 
 		 995 aa  48.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.276942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  21.65 
 
 		 581 aa  47.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  22.13 
 
 		 479 aa  47.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  22.33 
 
 		 560 aa  47.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1985  type III restriction enzyme, res subunit  22.74 
 
 		 1116 aa  47.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05940  general RNA polymerase II transcription factor, putative  22.99 
 
 		 866 aa  47.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.687804  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  26.29 
 
 		 524 aa  46.6  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01111  hypothetical protein  24.53 
 
 		 778 aa  47  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  30.22 
 
 		 586 aa  47.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  41.86 
 
 		 698 aa  46.2  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  22.15 
 
 		 479 aa  46.2  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2493  DEAD/DEAH box helicase-like  22.47 
 
 		 799 aa  46.2  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1295  type III restriction enzyme, res subunit  27.01 
 
 		 584 aa  45.8  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  22.64 
 
 		 560 aa  45.8  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  22.01 
 
 		 560 aa  45.8  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  26.92 
 
 		 494 aa  45.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3456  type III restriction enzyme, res subunit  33.53 
 
 		 597 aa  45.1  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  26.58 
 
 		 727 aa  45.1  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  30.43 
 
 		 455 aa  45.1  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  22.33 
 
 		 398 aa  45.1  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2080  helicase  30.77 
 
 		 588 aa  44.7  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.453275  normal  0.977675 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  21.49 
 
 		 813 aa  44.7  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  24.85 
 
 		 444 aa  44.7  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>