183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5781 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5781  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 978 aa  2016    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0358672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2984  type III restriction protein res subunit  33.98 
 
 		 1113 aa  514  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.135376  normal  0.189592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1985  type III restriction enzyme, res subunit  34.45 
 
 		 1116 aa  499  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5222  type III restriction protein res subunit  35.14 
 
 		 995 aa  501  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.276942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3974  type III restriction enzyme, res subunit  33.67 
 
 		 1093 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.361688  normal  0.0160055 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0066  type III restriction protein res subunit  31.37 
 
 		 1100 aa  474  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2131  DEAD/DEAH box helicase  31.25 
 
 		 1099 aa  436  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.812467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4408  type III restriction enzyme, res subunit  26.93 
 
 		 976 aa  258  4e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2754  hypothetical protein  28.18 
 
 		 526 aa  175  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3695  putative helicase  26.39 
 
 		 676 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.783104  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0432  type III restriction protein res subunit  27.61 
 
 		 619 aa  103  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6393  type III restriction protein res subunit  25.75 
 
 		 609 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  25.13 
 
 		 848 aa  75.1  0.000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3844  type III restriction enzyme, res subunit  23.89 
 
 		 1020 aa  67.4  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.65672  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  24.65 
 
 		 545 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  24.3 
 
 		 545 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  25.42 
 
 		 949 aa  65.5  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  24.87 
 
 		 444 aa  63.9  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  25.21 
 
 		 545 aa  62  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  22.22 
 
 		 524 aa  60.8  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  23.78 
 
 		 654 aa  60.5  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  27.01 
 
 		 773 aa  60.1  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  26.04 
 
 		 998 aa  59.3  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  24.39 
 
 		 590 aa  59.3  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  23.7 
 
 		 953 aa  58.9  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  23.7 
 
 		 953 aa  58.9  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  24.06 
 
 		 590 aa  58.5  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  23.18 
 
 		 650 aa  58.2  0.0000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1475  type I restriction-modification system, R subunit  29.52 
 
 		 761 aa  58.2  0.0000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0902  Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit related helicase  29.02 
 
 		 1113 aa  57.8  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.164801  hitchhiker  0.00000563993 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  21.39 
 
 		 1053 aa  57.4  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  24.72 
 
 		 629 aa  56.6  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0366  type III restriction protein res subunit  23.28 
 
 		 1012 aa  57  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.64384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  21.84 
 
 		 967 aa  56.6  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  24.72 
 
 		 491 aa  56.2  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  23.53 
 
 		 590 aa  55.8  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2618  EcoEI R domain-containing protein  27.31 
 
 		 817 aa  56.2  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0707543 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1193  EcoEI R domain protein  27.48 
 
 		 827 aa  55.8  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325861  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  24.02 
 
 		 905 aa  55.5  0.000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  22.43 
 
 		 813 aa  55.5  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2408  DEAD/DEAH box helicase, putative  25.07 
 
 		 809 aa  54.7  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2039  type III restriction protein res subunit  25.07 
 
 		 809 aa  54.7  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3809  type III restriction enzyme, res subunit  26.54 
 
 		 1033 aa  54.7  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  23.77 
 
 		 455 aa  54.7  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  23.33 
 
 		 952 aa  53.9  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3774  type III restriction protein res subunit  23.42 
 
 		 583 aa  54.3  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.476443  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  20.72 
 
 		 468 aa  54.3  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  22.54 
 
 		 652 aa  54.3  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  26.44 
 
 		 586 aa  54.3  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  23.18 
 
 		 488 aa  53.9  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2082  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  23.9 
 
 		 574 aa  53.5  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  24.65 
 
 		 1149 aa  53.1  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  22.43 
 
 		 583 aa  53.5  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2726  type III restriction protein res subunit  23.63 
 
 		 580 aa  53.5  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.219655  hitchhiker  0.000185767 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  21.94 
 
 		 531 aa  53.1  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  22.96 
 
 		 949 aa  53.5  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17070  DNA/RNA helicase, superfamily II  25.61 
 
 		 1031 aa  53.1  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  22.16 
 
 		 583 aa  53.1  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3253  type III restriction protein res subunit  24.59 
 
 		 585 aa  52.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.503255  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  22.97 
 
 		 590 aa  52.8  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0789  type III restriction protein res subunit  25.14 
 
 		 795 aa  52.4  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.891259  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  25.21 
 
 		 499 aa  52.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  24.78 
 
 		 606 aa  52.4  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1025  type III restriction enzyme, res subunit  24.8 
 
 		 753 aa  52.4  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0006  type III restriction enzyme, res subunit  24.21 
 
 		 768 aa  52  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0977  type III restriction enzyme, res subunit  24.54 
 
 		 1063 aa  51.6  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1895  EcoEI R domain-containing protein  28.1 
 
 		 780 aa  51.6  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0749811  hitchhiker  0.00699891 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  24.46 
 
 		 479 aa  51.6  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  24.71 
 
 		 607 aa  51.6  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24400  DNA/RNA helicase, superfamily II  24.1 
 
 		 592 aa  51.2  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25110  DNA/RNA helicase, superfamily II  23.01 
 
 		 593 aa  50.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.862041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1234  type III restriction enzyme, res subunit  26.34 
 
 		 829 aa  50.8  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  22.81 
 
 		 466 aa  50.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1416  EcoEI R domain protein  23.5 
 
 		 800 aa  51.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1432  type III restriction protein, res subunit  28.3 
 
 		 1108 aa  50.8  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02470  DEAD box family helicase, putative  28.36 
 
 		 706 aa  50.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.384709  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  23.37 
 
 		 583 aa  50.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  24.55 
 
 		 560 aa  50.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  22.34 
 
 		 585 aa  50.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1242  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  24.35 
 
 		 657 aa  50.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000376746  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1920  type III restriction enzyme, res subunit  22.83 
 
 		 946 aa  50.1  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  22.54 
 
 		 812 aa  50.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0992  type III restriction protein res subunit  24.76 
 
 		 938 aa  49.7  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.942343 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  23.14 
 
 		 1017 aa  49.7  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2533  type III restriction protein res subunit  21.77 
 
 		 584 aa  49.7  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10242  hitchhiker  0.000564265 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0503  EcoEI R domain-containing protein  27.53 
 
 		 824 aa  49.7  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000156579  normal  0.0688429 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  23.55 
 
 		 796 aa  49.3  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  24.55 
 
 		 560 aa  49.3  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1134  EcoEI R domain-containing protein  25.07 
 
 		 780 aa  49.3  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0337  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  22.74 
 
 		 979 aa  49.7  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  22.49 
 
 		 1348 aa  49.7  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1862  type III restriction enzyme, res subunit  21.31 
 
 		 580 aa  49.3  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.547726  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03530  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.79 
 
 		 734 aa  49.7  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0301  type III restriction enzyme, res subunit  24.44 
 
 		 1051 aa  48.9  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.177385  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3842  type III restriction enzyme, res subunit  25 
 
 		 1061 aa  48.9  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  21.87 
 
 		 1077 aa  48.9  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3529  ATP-dependent DNA helicase RecQ  24.77 
 
 		 620 aa  49.3  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.600599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3077  type III restriction protein res subunit  23.42 
 
 		 980 aa  49.3  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3839  type III restriction enzyme, res subunit  26.83 
 
 		 471 aa  48.9  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1976  EcoEI R domain-containing protein  26 
 
 		 825 aa  49.3  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.411939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>