177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3839 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4016  type III restriction protein res subunit  68.88 
 
 		 469 aa  687    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3418  type III restriction enzyme, res subunit  72.19 
 
 		 469 aa  709    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.280626  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3839  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 471 aa  983    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4273  type III restriction protein res subunit  88.32 
 
 		 471 aa  875    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1893  type III restriction protein res subunit  65.75 
 
 		 472 aa  643    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3459  type III restriction protein res subunit  65.75 
 
 		 472 aa  643    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4412  type III restriction protein res subunit  88.32 
 
 		 471 aa  875    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0962  putative type III restriction enzyme  55.01 
 
 		 466 aa  542  1e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2555  hypothetical protein  56.17 
 
 		 465 aa  535  1e-151  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.813616 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0145  type III restriction enzyme, res subunit  55.41 
 
 		 465 aa  528  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4198  helicase domain protein  49.47 
 
 		 470 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1925  GGDEF family protein  46.27 
 
 		 477 aa  434  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3891  helicase domain-containing protein  52.22 
 
 		 458 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0080  helicase domain-containing protein  51.4 
 
 		 466 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06217  hypothetical protein  49.22 
 
 		 464 aa  418  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2283  type III restriction enzyme, res subunit  51.02 
 
 		 465 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0197  helicase domain-containing protein  49.31 
 
 		 429 aa  358  9.999999999999999e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.13298  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4219  FOG domain-containing protein  43.06 
 
 		 434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.701537  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1839  type III restriction protein res subunit  31.68 
 
 		 563 aa  176  8e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036346  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2242  type III restriction protein res subunit  31.31 
 
 		 595 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10520  DNA/RNA helicase, superfamily II  30.56 
 
 		 589 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0759  type III restriction enzyme, res subunit  29.53 
 
 		 566 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523445  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1291  type III restriction enzyme, res subunit  30.18 
 
 		 598 aa  163  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1477  type III restriction protein res subunit  28.64 
 
 		 599 aa  162  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4526  DEAD-like helicase  31.31 
 
 		 559 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25110  DNA/RNA helicase, superfamily II  29.73 
 
 		 593 aa  162  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.862041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0602  type III restriction enzyme, res subunit  30.38 
 
 		 560 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.44982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0615  type III restriction enzyme, res subunit  30.38 
 
 		 560 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0593  type III restriction enzyme, res subunit  30.38 
 
 		 560 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1318  type III restriction protein res subunit  29.56 
 
 		 601 aa  159  9e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0818356  hitchhiker  0.00409906 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0931  type III restriction protein res subunit  30.62 
 
 		 586 aa  159  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.355478  normal  0.978518 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12931  hypothetical protein  30.95 
 
 		 626 aa  158  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.129963  normal  0.499246 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2743  type III restriction protein res subunit  27.35 
 
 		 618 aa  156  8e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3879  type III restriction protein res subunit  30.61 
 
 		 593 aa  156  9e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0376  type III restriction protein res subunit  28.75 
 
 		 574 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0145  type III restriction enzyme, res subunit  28.88 
 
 		 574 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2381  ATPase  30.3 
 
 		 569 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.191246  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2588  type III restriction enzyme, res subunit  28.46 
 
 		 591 aa  153  7e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245843  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1051  type III restriction protein res subunit  29.97 
 
 		 628 aa  152  8.999999999999999e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5135  type III restriction protein res subunit  30.13 
 
 		 622 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24400  DNA/RNA helicase, superfamily II  30.92 
 
 		 592 aa  147  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08280  DNA/RNA helicase, superfamily II  29.16 
 
 		 606 aa  146  9e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.265179  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20110  DNA/RNA helicase, superfamily II  27.09 
 
 		 606 aa  145  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.24796  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1719  DNA or RNA helicase of superfamily II-like protein  28.36 
 
 		 582 aa  143  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193156  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1502  type III restriction protein res subunit  28.1 
 
 		 572 aa  143  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2320  type III restriction protein res subunit  26.95 
 
 		 593 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000427068 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0881  type III restriction protein res subunit  28.03 
 
 		 621 aa  142  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4538  type III restriction protein res subunit  29.14 
 
 		 565 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1473  type III restriction enzyme, res subunit  28.28 
 
 		 577 aa  136  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1438  type III restriction protein res subunit  28.54 
 
 		 575 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1380  type III restriction enzyme, res subunit  29.25 
 
 		 601 aa  128  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.942893  normal  0.0185831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3774  type III restriction protein res subunit  27.93 
 
 		 583 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.476443  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3772  type III restriction protein res subunit  25.24 
 
 		 594 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1979  hypothetical protein  25.63 
 
 		 435 aa  108  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0682  hypothetical protein  26.09 
 
 		 456 aa  106  8e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835313  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0796  type III restriction protein res subunit  25.06 
 
 		 598 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42368  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1868  hypothetical protein  37.06 
 
 		 139 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.776543  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3384  hypothetical protein  37.06 
 
 		 139 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08571  helicase domain-containing protein  26.26 
 
 		 438 aa  94  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1862  type III restriction enzyme, res subunit  23.08 
 
 		 580 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.547726  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1205  hypothetical protein  30.77 
 
 		 919 aa  69.7  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.326173  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3274  type I site-specific deoxyribonuclease  35.33 
 
 		 917 aa  69.3  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  25.09 
 
 		 531 aa  67.4  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0853  type III restriction enzyme, res subunit  32.73 
 
 		 921 aa  66.6  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.237382  normal  0.0361479 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0509  type III restriction enzyme, res subunit  31.44 
 
 		 918 aa  65.9  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1495  type III restriction enzyme, res subunit  40 
 
 		 931 aa  63.9  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0931  type III restriction protein res subunit  23.92 
 
 		 601 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2080  helicase  23.85 
 
 		 588 aa  62.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.453275  normal  0.977675 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2726  type III restriction protein res subunit  23.51 
 
 		 580 aa  62  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.219655  hitchhiker  0.000185767 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  23.34 
 
 		 580 aa  62  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  23.53 
 
 		 451 aa  60.8  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  22.6 
 
 		 585 aa  60.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3695  putative helicase  22.62 
 
 		 676 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.783104  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3512  type III restriction protein res subunit  32.56 
 
 		 924 aa  60.5  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  22.87 
 
 		 590 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2178  Type III restriction enzyme, res subunit  24.12 
 
 		 873 aa  60.1  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0087  type III restriction enzyme, res subunit  36.73 
 
 		 925 aa  59.7  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.517588  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  22.58 
 
 		 590 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1532  type III restriction enzyme, res subunit  23.34 
 
 		 579 aa  59.3  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  24.93 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  22.58 
 
 		 590 aa  57.8  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  21.39 
 
 		 602 aa  57  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  23.98 
 
 		 444 aa  56.2  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  22.99 
 
 		 590 aa  56.6  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2533  type III restriction protein res subunit  21.66 
 
 		 584 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10242  hitchhiker  0.000564265 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  22.22 
 
 		 654 aa  56.6  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1751  type III restriction protein res subunit  20.81 
 
 		 584 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1790  type III restriction protein res subunit  21.08 
 
 		 584 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.766528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  22.19 
 
 		 443 aa  55.8  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  23.12 
 
 		 586 aa  55.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1747  type III restriction protein res subunit  21.08 
 
 		 584 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0541375  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2089  type III restriction enzyme, res subunit  22.16 
 
 		 616 aa  55.1  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.553683  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1030  type III restriction enzyme, res subunit  22.18 
 
 		 893 aa  55.1  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0182402  normal  0.455384 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3690  type III restriction protein res subunit  22.71 
 
 		 622 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367361 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03609  Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicase  21.97 
 
 		 1141 aa  53.5  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  22.49 
 
 		 583 aa  53.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1295  type III restriction enzyme, res subunit  22.3 
 
 		 584 aa  52.4  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1895  EcoEI R domain-containing protein  22.15 
 
 		 780 aa  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0749811  hitchhiker  0.00699891 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  26.33 
 
 		 488 aa  52.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0432  type III restriction protein res subunit  21.13 
 
 		 619 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>