176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4273 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4016  type III restriction protein res subunit  70.61 
 
 		 469 aa  700    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4412  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 471 aa  986    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3418  type III restriction enzyme, res subunit  74.21 
 
 		 469 aa  734    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.280626  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3839  type III restriction enzyme, res subunit  88.32 
 
 		 471 aa  855    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4273  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 471 aa  986    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1893  type III restriction protein res subunit  67.65 
 
 		 472 aa  658    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3459  type III restriction protein res subunit  67.65 
 
 		 472 aa  658    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0962  putative type III restriction enzyme  54.58 
 
 		 466 aa  545  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2555  hypothetical protein  53.8 
 
 		 465 aa  526  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.813616 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0145  type III restriction enzyme, res subunit  53.59 
 
 		 465 aa  523  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4198  helicase domain protein  48.73 
 
 		 470 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1925  GGDEF family protein  48.3 
 
 		 477 aa  434  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3891  helicase domain-containing protein  50.91 
 
 		 458 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06217  hypothetical protein  51.04 
 
 		 464 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0080  helicase domain-containing protein  52.33 
 
 		 466 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2283  type III restriction enzyme, res subunit  49.75 
 
 		 465 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0197  helicase domain-containing protein  50.42 
 
 		 429 aa  364  2e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.13298  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4219  FOG domain-containing protein  41.69 
 
 		 434 aa  333  4e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.701537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4526  DEAD-like helicase  32.07 
 
 		 559 aa  167  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2242  type III restriction protein res subunit  30.89 
 
 		 595 aa  167  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1839  type III restriction protein res subunit  30.6 
 
 		 563 aa  165  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036346  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0759  type III restriction enzyme, res subunit  29.95 
 
 		 566 aa  163  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523445  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0931  type III restriction protein res subunit  28.66 
 
 		 586 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.355478  normal  0.978518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1477  type III restriction protein res subunit  29.31 
 
 		 599 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3879  type III restriction protein res subunit  28.84 
 
 		 593 aa  160  7e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1291  type III restriction enzyme, res subunit  30.18 
 
 		 598 aa  159  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10520  DNA/RNA helicase, superfamily II  30.29 
 
 		 589 aa  157  3e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25110  DNA/RNA helicase, superfamily II  29.7 
 
 		 593 aa  156  6e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.862041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12931  hypothetical protein  31.03 
 
 		 626 aa  156  7e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.129963  normal  0.499246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0602  type III restriction enzyme, res subunit  30.2 
 
 		 560 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.44982  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2588  type III restriction enzyme, res subunit  28.79 
 
 		 591 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245843  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0615  type III restriction enzyme, res subunit  30.2 
 
 		 560 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0593  type III restriction enzyme, res subunit  30.2 
 
 		 560 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1318  type III restriction protein res subunit  29.9 
 
 		 601 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0818356  hitchhiker  0.00409906 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0145  type III restriction enzyme, res subunit  29.59 
 
 		 574 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2743  type III restriction protein res subunit  28.9 
 
 		 618 aa  153  8e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2381  ATPase  30.92 
 
 		 569 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.191246  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1051  type III restriction protein res subunit  31.17 
 
 		 628 aa  152  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0376  type III restriction protein res subunit  28.44 
 
 		 574 aa  152  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5135  type III restriction protein res subunit  27.94 
 
 		 622 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0881  type III restriction protein res subunit  29.1 
 
 		 621 aa  146  8.000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2320  type III restriction protein res subunit  28.03 
 
 		 593 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000427068 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08280  DNA/RNA helicase, superfamily II  28.9 
 
 		 606 aa  145  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.265179  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1719  DNA or RNA helicase of superfamily II-like protein  28.46 
 
 		 582 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193156  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24400  DNA/RNA helicase, superfamily II  29.29 
 
 		 592 aa  143  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4538  type III restriction protein res subunit  29.41 
 
 		 565 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20110  DNA/RNA helicase, superfamily II  25.36 
 
 		 606 aa  137  5e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.24796  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1502  type III restriction protein res subunit  27.34 
 
 		 572 aa  136  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1473  type III restriction enzyme, res subunit  28.47 
 
 		 577 aa  133  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1438  type III restriction protein res subunit  28.22 
 
 		 575 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1380  type III restriction enzyme, res subunit  28.85 
 
 		 601 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.942893  normal  0.0185831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3774  type III restriction protein res subunit  26.85 
 
 		 583 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.476443  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3772  type III restriction protein res subunit  26.67 
 
 		 594 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1979  hypothetical protein  25.46 
 
 		 435 aa  106  9e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0796  type III restriction protein res subunit  25.3 
 
 		 598 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42368  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0682  hypothetical protein  26.02 
 
 		 456 aa  104  4e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835313  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1868  hypothetical protein  40 
 
 		 139 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.776543  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3384  hypothetical protein  39.31 
 
 		 139 aa  99.8  8e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08571  helicase domain-containing protein  25.47 
 
 		 438 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3274  type I site-specific deoxyribonuclease  32.65 
 
 		 917 aa  68.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0509  type III restriction enzyme, res subunit  31.96 
 
 		 918 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  24.62 
 
 		 531 aa  67.4  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  22.98 
 
 		 580 aa  67  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  22.73 
 
 		 602 aa  65.9  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1862  type III restriction enzyme, res subunit  22.84 
 
 		 580 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.547726  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2533  type III restriction protein res subunit  22.46 
 
 		 584 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10242  hitchhiker  0.000564265 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  23.67 
 
 		 590 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2080  helicase  23.8 
 
 		 588 aa  64.7  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.453275  normal  0.977675 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1751  type III restriction protein res subunit  22.19 
 
 		 584 aa  64.7  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1790  type III restriction protein res subunit  22.19 
 
 		 584 aa  64.3  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.766528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1747  type III restriction protein res subunit  22.46 
 
 		 584 aa  64.3  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0541375  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2726  type III restriction protein res subunit  22.43 
 
 		 580 aa  62.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.219655  hitchhiker  0.000185767 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  23.53 
 
 		 590 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  23.12 
 
 		 590 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  23.8 
 
 		 590 aa  62  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0853  type III restriction enzyme, res subunit  29.9 
 
 		 921 aa  60.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.237382  normal  0.0361479 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1205  hypothetical protein  29.74 
 
 		 919 aa  60.5  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.326173  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1532  type III restriction enzyme, res subunit  24.4 
 
 		 579 aa  59.7  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0087  type III restriction enzyme, res subunit  27.36 
 
 		 925 aa  58.9  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.517588  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2089  type III restriction enzyme, res subunit  22.81 
 
 		 616 aa  58.2  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.553683  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  21.9 
 
 		 585 aa  58.2  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  22.73 
 
 		 586 aa  58.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2178  Type III restriction enzyme, res subunit  23.82 
 
 		 873 aa  57.8  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1495  type III restriction enzyme, res subunit  27.6 
 
 		 931 aa  57.4  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  22.83 
 
 		 583 aa  55.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3695  putative helicase  22.19 
 
 		 676 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.783104  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  24.38 
 
 		 444 aa  54.3  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1895  EcoEI R domain-containing protein  21.74 
 
 		 780 aa  54.7  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0749811  hitchhiker  0.00699891 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  21.49 
 
 		 558 aa  54.3  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  25.06 
 
 		 444 aa  53.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03609  Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicase  22.51 
 
 		 1141 aa  53.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3512  type III restriction protein res subunit  33.98 
 
 		 924 aa  52.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  20.75 
 
 		 654 aa  52.4  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1030  type III restriction enzyme, res subunit  33.01 
 
 		 893 aa  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0182402  normal  0.455384 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3690  type III restriction protein res subunit  21.26 
 
 		 622 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367361 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  21.63 
 
 		 451 aa  51.6  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  24.28 
 
 		 531 aa  51.6  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  22.78 
 
 		 449 aa  50.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  21.24 
 
 		 463 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  23.06 
 
 		 440 aa  50.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>