84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1438 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2242  type III restriction protein res subunit  64.84 
 
 		 595 aa  714    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0593  type III restriction enzyme, res subunit  62.34 
 
 		 560 aa  684    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0759  type III restriction enzyme, res subunit  63.96 
 
 		 566 aa  694    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523445  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0145  type III restriction enzyme, res subunit  62.34 
 
 		 574 aa  678    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1473  type III restriction enzyme, res subunit  94.45 
 
 		 577 aa  1034    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0615  type III restriction enzyme, res subunit  62.52 
 
 		 560 aa  686    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1719  DNA or RNA helicase of superfamily II-like protein  61.55 
 
 		 582 aa  674    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193156  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12931  hypothetical protein  60.03 
 
 		 626 aa  656    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.129963  normal  0.499246 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3879  type III restriction protein res subunit  61.19 
 
 		 593 aa  656    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4538  type III restriction protein res subunit  68.96 
 
 		 565 aa  781    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5135  type III restriction protein res subunit  60.88 
 
 		 622 aa  649    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1438  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 575 aa  1144    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1839  type III restriction protein res subunit  63.67 
 
 		 563 aa  700    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036346  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0602  type III restriction enzyme, res subunit  62.52 
 
 		 560 aa  686    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.44982  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0931  type III restriction protein res subunit  63.2 
 
 		 586 aa  666    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.355478  normal  0.978518 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2743  type III restriction protein res subunit  59.79 
 
 		 618 aa  639    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1502  type III restriction protein res subunit  64.23 
 
 		 572 aa  712    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1477  type III restriction protein res subunit  57.57 
 
 		 599 aa  637    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24400  DNA/RNA helicase, superfamily II  65.9 
 
 		 592 aa  747    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20110  DNA/RNA helicase, superfamily II  57.64 
 
 		 606 aa  627  1e-178  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.24796  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10520  DNA/RNA helicase, superfamily II  57.87 
 
 		 589 aa  627  1e-178  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1318  type III restriction protein res subunit  58.66 
 
 		 601 aa  620  1e-176  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0818356  hitchhiker  0.00409906 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2588  type III restriction enzyme, res subunit  56.12 
 
 		 591 aa  615  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245843  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25110  DNA/RNA helicase, superfamily II  57.07 
 
 		 593 aa  618  1e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.862041  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0376  type III restriction protein res subunit  56.87 
 
 		 574 aa  611  1e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2320  type III restriction protein res subunit  55.52 
 
 		 593 aa  609  1e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000427068 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1380  type III restriction enzyme, res subunit  60.28 
 
 		 601 aa  610  1e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.942893  normal  0.0185831 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1291  type III restriction enzyme, res subunit  58.48 
 
 		 598 aa  610  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1051  type III restriction protein res subunit  58.63 
 
 		 628 aa  606  9.999999999999999e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08280  DNA/RNA helicase, superfamily II  55.42 
 
 		 606 aa  603  1.0000000000000001e-171  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.265179  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2381  ATPase  58.71 
 
 		 569 aa  601  1e-170  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.191246  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0881  type III restriction protein res subunit  56.01 
 
 		 621 aa  589  1e-167  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3772  type III restriction protein res subunit  50 
 
 		 594 aa  474  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0796  type III restriction protein res subunit  47.86 
 
 		 598 aa  451  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42368  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3774  type III restriction protein res subunit  47.15 
 
 		 583 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.476443  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4526  DEAD-like helicase  41.71 
 
 		 559 aa  342  1e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1925  GGDEF family protein  31.62 
 
 		 477 aa  175  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1893  type III restriction protein res subunit  30.27 
 
 		 472 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3459  type III restriction protein res subunit  30.27 
 
 		 472 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06217  hypothetical protein  30 
 
 		 464 aa  148  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4016  type III restriction protein res subunit  29.8 
 
 		 469 aa  147  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3839  type III restriction enzyme, res subunit  28.61 
 
 		 471 aa  143  8e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0145  type III restriction enzyme, res subunit  30.61 
 
 		 465 aa  143  9e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4273  type III restriction protein res subunit  29.14 
 
 		 471 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3418  type III restriction enzyme, res subunit  28.28 
 
 		 469 aa  141  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.280626  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4412  type III restriction protein res subunit  29.14 
 
 		 471 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4219  FOG domain-containing protein  31.02 
 
 		 434 aa  140  8.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.701537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2283  type III restriction enzyme, res subunit  30.23 
 
 		 465 aa  139  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0080  helicase domain-containing protein  31.31 
 
 		 466 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2555  hypothetical protein  29.82 
 
 		 465 aa  138  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.813616 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0962  putative type III restriction enzyme  27.34 
 
 		 466 aa  137  5e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3891  helicase domain-containing protein  27.79 
 
 		 458 aa  125  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0682  hypothetical protein  31.22 
 
 		 456 aa  124  5e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835313  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4198  helicase domain protein  26.43 
 
 		 470 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0197  helicase domain-containing protein  30.86 
 
 		 429 aa  115  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.13298  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08571  helicase domain-containing protein  30.31 
 
 		 438 aa  113  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1979  hypothetical protein  29.31 
 
 		 435 aa  111  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3690  type III restriction protein res subunit  30.44 
 
 		 622 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367361 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0931  type III restriction protein res subunit  28.7 
 
 		 601 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2879  type III restriction protein res subunit  28.85 
 
 		 608 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450355  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  24.49 
 
 		 493 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  22.84 
 
 		 489 aa  73.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  23.98 
 
 		 489 aa  73.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  22.04 
 
 		 469 aa  73.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  23.53 
 
 		 492 aa  66.6  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  25.22 
 
 		 706 aa  65.1  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  20.2 
 
 		 698 aa  62.8  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2984  type III restriction protein res subunit  26.26 
 
 		 1113 aa  58.9  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.135376  normal  0.189592 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0497  type III restriction protein res subunit  20.17 
 
 		 696 aa  57.8  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.154157  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  24.54 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1374  type III restriction protein res subunit  21.18 
 
 		 707 aa  55.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.304908  normal  0.550958 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  21.89 
 
 		 551 aa  50.4  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  32.67 
 
 		 949 aa  48.9  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3022  type III restriction protein res subunit  31.9 
 
 		 1597 aa  48.1  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00583  ATP-dependent RNA helicase dbp10 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BFU7]  28.35 
 
 		 936 aa  47.4  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0160  type III restriction enzyme, res subunit  25.21 
 
 		 1137 aa  47  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0444998  normal  0.740458 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4564  helicase-like  24.58 
 
 		 453 aa  47  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1537  type III restriction enzyme, res subunit  20.19 
 
 		 732 aa  46.6  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  25.33 
 
 		 951 aa  45.8  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  23.1 
 
 		 462 aa  45.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0516  type I restriction-modification system R subunit (endonuclease)  25.65 
 
 		 1115 aa  45.1  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1238  hypothetical protein  24.87 
 
 		 1131 aa  44.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1094  type III restriction enzyme, res subunit  21.05 
 
 		 945 aa  44.3  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5514  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  23.08 
 
 		 558 aa  44.3  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>