121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4219 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4219  FOG domain-containing protein  100 
 
 		 434 aa  896    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.701537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1893  type III restriction protein res subunit  41.2 
 
 		 472 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3459  type III restriction protein res subunit  41.2 
 
 		 472 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4273  type III restriction protein res subunit  41.69 
 
 		 471 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4412  type III restriction protein res subunit  41.69 
 
 		 471 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2555  hypothetical protein  42.35 
 
 		 465 aa  331  1e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.813616 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0145  type III restriction enzyme, res subunit  41.19 
 
 		 465 aa  330  3e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0962  putative type III restriction enzyme  43.53 
 
 		 466 aa  328  1.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4016  type III restriction protein res subunit  42.22 
 
 		 469 aa  324  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3418  type III restriction enzyme, res subunit  40.34 
 
 		 469 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.280626  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1925  GGDEF family protein  40.91 
 
 		 477 aa  321  1.9999999999999998e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3839  type III restriction enzyme, res subunit  43.06 
 
 		 471 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06217  hypothetical protein  41.71 
 
 		 464 aa  317  2e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0080  helicase domain-containing protein  43.13 
 
 		 466 aa  315  9e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4198  helicase domain protein  40.32 
 
 		 470 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3891  helicase domain-containing protein  40.77 
 
 		 458 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2283  type III restriction enzyme, res subunit  41.53 
 
 		 465 aa  295  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0197  helicase domain-containing protein  41.85 
 
 		 429 aa  283  4.0000000000000003e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.13298  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2242  type III restriction protein res subunit  30.29 
 
 		 595 aa  162  9e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1318  type III restriction protein res subunit  29.78 
 
 		 601 aa  154  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0818356  hitchhiker  0.00409906 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1839  type III restriction protein res subunit  30 
 
 		 563 aa  150  4e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036346  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3879  type III restriction protein res subunit  29.51 
 
 		 593 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1477  type III restriction protein res subunit  26.24 
 
 		 599 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2320  type III restriction protein res subunit  29.51 
 
 		 593 aa  146  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000427068 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2588  type III restriction enzyme, res subunit  30.22 
 
 		 591 aa  146  8.000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245843  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1291  type III restriction enzyme, res subunit  29.22 
 
 		 598 aa  144  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20110  DNA/RNA helicase, superfamily II  28.27 
 
 		 606 aa  143  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.24796  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0376  type III restriction protein res subunit  27.96 
 
 		 574 aa  143  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25110  DNA/RNA helicase, superfamily II  28.49 
 
 		 593 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.862041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0881  type III restriction protein res subunit  29.67 
 
 		 621 aa  140  4.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1473  type III restriction enzyme, res subunit  31.86 
 
 		 577 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0145  type III restriction enzyme, res subunit  27.82 
 
 		 574 aa  137  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2743  type III restriction protein res subunit  28.37 
 
 		 618 aa  136  6.0000000000000005e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0602  type III restriction enzyme, res subunit  27.03 
 
 		 560 aa  136  8e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.44982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0615  type III restriction enzyme, res subunit  27.03 
 
 		 560 aa  136  8e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5135  type III restriction protein res subunit  28.85 
 
 		 622 aa  136  8e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0593  type III restriction enzyme, res subunit  27.03 
 
 		 560 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1719  DNA or RNA helicase of superfamily II-like protein  27.38 
 
 		 582 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193156  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0759  type III restriction enzyme, res subunit  27.27 
 
 		 566 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523445  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1051  type III restriction protein res subunit  28.86 
 
 		 628 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1438  type III restriction protein res subunit  31.3 
 
 		 575 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4526  DEAD-like helicase  29.41 
 
 		 559 aa  133  7.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10520  DNA/RNA helicase, superfamily II  26.73 
 
 		 589 aa  132  9e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2381  ATPase  28.69 
 
 		 569 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.191246  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08280  DNA/RNA helicase, superfamily II  28.69 
 
 		 606 aa  131  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.265179  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24400  DNA/RNA helicase, superfamily II  27.73 
 
 		 592 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12931  hypothetical protein  25.96 
 
 		 626 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.129963  normal  0.499246 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0931  type III restriction protein res subunit  29.39 
 
 		 586 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.355478  normal  0.978518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4538  type III restriction protein res subunit  28.95 
 
 		 565 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1979  hypothetical protein  28.06 
 
 		 435 aa  124  4e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1502  type III restriction protein res subunit  26.79 
 
 		 572 aa  123  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1380  type III restriction enzyme, res subunit  28.99 
 
 		 601 aa  120  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.942893  normal  0.0185831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3774  type III restriction protein res subunit  26.2 
 
 		 583 aa  117  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.476443  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3772  type III restriction protein res subunit  28.41 
 
 		 594 aa  116  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08571  helicase domain-containing protein  27.33 
 
 		 438 aa  110  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0682  hypothetical protein  27.78 
 
 		 456 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835313  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0796  type III restriction protein res subunit  24.87 
 
 		 598 aa  101  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42368  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1868  hypothetical protein  46.58 
 
 		 139 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.776543  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3384  hypothetical protein  45.21 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1862  type III restriction enzyme, res subunit  24.91 
 
 		 580 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.547726  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  22.06 
 
 		 993 aa  57  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0822  DEAD/DEAH box helicase-like  23.2 
 
 		 1065 aa  55.5  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.317818  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2089  type III restriction enzyme, res subunit  22.86 
 
 		 616 aa  55.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.553683  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  23.08 
 
 		 967 aa  55.5  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2726  type III restriction protein res subunit  22.22 
 
 		 580 aa  53.9  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.219655  hitchhiker  0.000185767 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  21.5 
 
 		 583 aa  53.9  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  24.01 
 
 		 812 aa  53.1  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0725  type III restriction protein res subunit  22.9 
 
 		 1005 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147192 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  21.59 
 
 		 583 aa  50.4  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  20.87 
 
 		 583 aa  50.1  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0931  type III restriction protein res subunit  25.82 
 
 		 601 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  20.77 
 
 		 905 aa  49.3  0.0001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3456  type III restriction enzyme, res subunit  19.93 
 
 		 597 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2026  type III restriction enzyme, res subunit  20.16 
 
 		 1138 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476841 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1295  type III restriction enzyme, res subunit  21.24 
 
 		 584 aa  49.7  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  23.79 
 
 		 385 aa  49.3  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2080  helicase  23.08 
 
 		 588 aa  48.5  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.453275  normal  0.977675 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0432  type III restriction protein res subunit  22.73 
 
 		 619 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17070  DNA/RNA helicase, superfamily II  22.41 
 
 		 1031 aa  48.9  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  23.75 
 
 		 602 aa  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  19.8 
 
 		 586 aa  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1089  type III restriction protein res subunit  22.99 
 
 		 1051 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3695  putative helicase  23.9 
 
 		 676 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.783104  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  23.77 
 
 		 1052 aa  47.4  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1790  type III restriction protein res subunit  23.75 
 
 		 584 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.766528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  29.79 
 
 		 949 aa  47.4  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2533  type III restriction protein res subunit  23.96 
 
 		 584 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10242  hitchhiker  0.000564265 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  24 
 
 		 590 aa  47  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  24.38 
 
 		 590 aa  47  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  24.14 
 
 		 590 aa  47  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0760  DEAD/DEAH box helicase-like  22.49 
 
 		 646 aa  46.6  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.254087  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  21.1 
 
 		 1017 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1532  type III restriction enzyme, res subunit  22.6 
 
 		 579 aa  46.2  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  23.18 
 
 		 443 aa  46.2  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1747  type III restriction protein res subunit  23.48 
 
 		 584 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0541375  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3690  type III restriction protein res subunit  24.36 
 
 		 622 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367361 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  23.67 
 
 		 590 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1751  type III restriction protein res subunit  23.61 
 
 		 584 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  22.81 
 
 		 815 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6393  type III restriction protein res subunit  20.55 
 
 		 609 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>