79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3690 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2879  type III restriction protein res subunit  86.39 
 
 		 608 aa  874    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450355  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3690  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 622 aa  1187    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367361 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0931  type III restriction protein res subunit  71.4 
 
 		 601 aa  719    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24400  DNA/RNA helicase, superfamily II  30.15 
 
 		 592 aa  121  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5135  type III restriction protein res subunit  30.26 
 
 		 622 aa  117  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2588  type III restriction enzyme, res subunit  29.41 
 
 		 591 aa  114  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245843  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2743  type III restriction protein res subunit  30.39 
 
 		 618 aa  113  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12931  hypothetical protein  29.25 
 
 		 626 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.129963  normal  0.499246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0615  type III restriction enzyme, res subunit  29.9 
 
 		 560 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0593  type III restriction enzyme, res subunit  29.9 
 
 		 560 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0602  type III restriction enzyme, res subunit  29.9 
 
 		 560 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.44982  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0145  type III restriction enzyme, res subunit  28.54 
 
 		 574 aa  110  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1719  DNA or RNA helicase of superfamily II-like protein  29.43 
 
 		 582 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193156  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0759  type III restriction enzyme, res subunit  28.83 
 
 		 566 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523445  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1839  type III restriction protein res subunit  29.02 
 
 		 563 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036346  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2242  type III restriction protein res subunit  29.11 
 
 		 595 aa  107  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4526  DEAD-like helicase  29.21 
 
 		 559 aa  107  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1291  type III restriction enzyme, res subunit  29.55 
 
 		 598 aa  107  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1477  type III restriction protein res subunit  28.24 
 
 		 599 aa  107  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2320  type III restriction protein res subunit  28.47 
 
 		 593 aa  106  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000427068 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0376  type III restriction protein res subunit  29.77 
 
 		 574 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10520  DNA/RNA helicase, superfamily II  28.68 
 
 		 589 aa  105  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20110  DNA/RNA helicase, superfamily II  28.06 
 
 		 606 aa  105  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.24796  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3774  type III restriction protein res subunit  31.81 
 
 		 583 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.476443  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1502  type III restriction protein res subunit  29.75 
 
 		 572 aa  100  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0931  type III restriction protein res subunit  28.02 
 
 		 586 aa  99.4  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.355478  normal  0.978518 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3879  type III restriction protein res subunit  28.17 
 
 		 593 aa  99  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1318  type III restriction protein res subunit  28.74 
 
 		 601 aa  97.8  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0818356  hitchhiker  0.00409906 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0881  type III restriction protein res subunit  28.44 
 
 		 621 aa  96.7  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1380  type III restriction enzyme, res subunit  28.64 
 
 		 601 aa  96.3  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.942893  normal  0.0185831 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25110  DNA/RNA helicase, superfamily II  28.94 
 
 		 593 aa  95.5  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.862041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3772  type III restriction protein res subunit  29.63 
 
 		 594 aa  95.5  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0796  type III restriction protein res subunit  28.75 
 
 		 598 aa  94.4  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42368  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4538  type III restriction protein res subunit  28.97 
 
 		 565 aa  94  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2381  ATPase  27.23 
 
 		 569 aa  94  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.191246  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1473  type III restriction enzyme, res subunit  29.31 
 
 		 577 aa  92.8  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08280  DNA/RNA helicase, superfamily II  27.04 
 
 		 606 aa  89.4  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.265179  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1051  type III restriction protein res subunit  29.34 
 
 		 628 aa  86.3  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1438  type III restriction protein res subunit  30.26 
 
 		 575 aa  85.1  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08571  helicase domain-containing protein  27.8 
 
 		 438 aa  73.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1925  GGDEF family protein  23.79 
 
 		 477 aa  72  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0682  hypothetical protein  27.29 
 
 		 456 aa  70.9  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835313  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3839  type III restriction enzyme, res subunit  23.49 
 
 		 471 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3651  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  24.42 
 
 		 1126 aa  70.1  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.408969 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1979  hypothetical protein  26.57 
 
 		 435 aa  66.6  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06217  hypothetical protein  23.36 
 
 		 464 aa  67  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4016  type III restriction protein res subunit  22.88 
 
 		 469 aa  65.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2555  hypothetical protein  22.14 
 
 		 465 aa  66.2  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.813616 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4412  type III restriction protein res subunit  21.96 
 
 		 471 aa  64.3  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4273  type III restriction protein res subunit  21.96 
 
 		 471 aa  64.3  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3459  type III restriction protein res subunit  23.11 
 
 		 472 aa  63.2  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1893  type III restriction protein res subunit  23.11 
 
 		 472 aa  63.2  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3418  type III restriction enzyme, res subunit  22.67 
 
 		 469 aa  61.6  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.280626  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0962  putative type III restriction enzyme  20.34 
 
 		 466 aa  60.8  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1993  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  21.74 
 
 		 1082 aa  58.9  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000937848  normal  0.215415 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4219  FOG domain-containing protein  23.38 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.701537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1672  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  22.41 
 
 		 1080 aa  58.5  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4198  helicase domain protein  22.54 
 
 		 470 aa  58.2  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3274  type I site-specific deoxyribonuclease  20.41 
 
 		 917 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0516  type I restriction-modification system R subunit (endonuclease)  27.81 
 
 		 1115 aa  54.3  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02066  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  23.41 
 
 		 1157 aa  52.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0080  helicase domain-containing protein  24.64 
 
 		 466 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3891  helicase domain-containing protein  21.88 
 
 		 458 aa  52  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0840  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  20.65 
 
 		 1068 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473643  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0087  type III restriction enzyme, res subunit  21.45 
 
 		 925 aa  49.7  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.517588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0843  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  21.11 
 
 		 1068 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.76009e-28 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0197  type III restriction protein res subunit  24.39 
 
 		 1125 aa  49.7  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000621753 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1495  type III restriction enzyme, res subunit  30.25 
 
 		 931 aa  48.9  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3671  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  21.49 
 
 		 1174 aa  48.5  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2946  hypothetical protein  32.14 
 
 		 730 aa  47.8  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.505303  hitchhiker  0.00920589 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0803  type III restriction enzyme, res subunit  29.66 
 
 		 1137 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.874877  normal  0.710753 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2963  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  22.62 
 
 		 1167 aa  47  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4932  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  29.2 
 
 		 1169 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2283  type III restriction enzyme, res subunit  26.06 
 
 		 465 aa  46.2  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1030  type III restriction enzyme, res subunit  28.29 
 
 		 893 aa  46.2  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0182402  normal  0.455384 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04216  endonuclease R  29.2 
 
 		 1170 aa  46.2  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1205  hypothetical protein  20.74 
 
 		 919 aa  46.6  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.326173  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3512  type III restriction protein res subunit  28.87 
 
 		 924 aa  44.7  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0509  type III restriction enzyme, res subunit  26.8 
 
 		 918 aa  44.3  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>