125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3891 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3891  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 458 aa  954    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06217  hypothetical protein  46.82 
 
 		 464 aa  449  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1893  type III restriction protein res subunit  48.18 
 
 		 472 aa  449  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3459  type III restriction protein res subunit  48.18 
 
 		 472 aa  449  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2555  hypothetical protein  48.82 
 
 		 465 aa  445  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.813616 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0962  putative type III restriction enzyme  52.48 
 
 		 466 aa  447  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0145  type III restriction enzyme, res subunit  48.82 
 
 		 465 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4016  type III restriction protein res subunit  52.22 
 
 		 469 aa  434  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4273  type III restriction protein res subunit  50.91 
 
 		 471 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4412  type III restriction protein res subunit  50.91 
 
 		 471 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3418  type III restriction enzyme, res subunit  45.82 
 
 		 469 aa  427  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.280626  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3839  type III restriction enzyme, res subunit  52.22 
 
 		 471 aa  422  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4198  helicase domain protein  50.39 
 
 		 470 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0080  helicase domain-containing protein  50 
 
 		 466 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1925  GGDEF family protein  47.91 
 
 		 477 aa  382  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2283  type III restriction enzyme, res subunit  47.34 
 
 		 465 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0197  helicase domain-containing protein  46.13 
 
 		 429 aa  331  2e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.13298  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4219  FOG domain-containing protein  40.77 
 
 		 434 aa  309  5.9999999999999995e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.701537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3879  type III restriction protein res subunit  31.71 
 
 		 593 aa  160  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1291  type III restriction enzyme, res subunit  29.04 
 
 		 598 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0881  type III restriction protein res subunit  31.61 
 
 		 621 aa  153  5.9999999999999996e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1318  type III restriction protein res subunit  28.26 
 
 		 601 aa  153  7e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0818356  hitchhiker  0.00409906 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2588  type III restriction enzyme, res subunit  28.68 
 
 		 591 aa  152  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245843  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0931  type III restriction protein res subunit  30.33 
 
 		 586 aa  149  8e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.355478  normal  0.978518 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20110  DNA/RNA helicase, superfamily II  29.95 
 
 		 606 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.24796  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5135  type III restriction protein res subunit  30.28 
 
 		 622 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1477  type III restriction protein res subunit  28.82 
 
 		 599 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25110  DNA/RNA helicase, superfamily II  31.44 
 
 		 593 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.862041  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1839  type III restriction protein res subunit  30.1 
 
 		 563 aa  147  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1719  DNA or RNA helicase of superfamily II-like protein  29.26 
 
 		 582 aa  146  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193156  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2320  type III restriction protein res subunit  28.21 
 
 		 593 aa  145  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000427068 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2242  type III restriction protein res subunit  31.15 
 
 		 595 aa  143  8e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1051  type III restriction protein res subunit  30.89 
 
 		 628 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10520  DNA/RNA helicase, superfamily II  29.18 
 
 		 589 aa  140  4.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2381  ATPase  29.61 
 
 		 569 aa  140  6e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.191246  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0376  type III restriction protein res subunit  27.07 
 
 		 574 aa  140  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0759  type III restriction enzyme, res subunit  28.5 
 
 		 566 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523445  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0145  type III restriction enzyme, res subunit  29.01 
 
 		 574 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24400  DNA/RNA helicase, superfamily II  30.05 
 
 		 592 aa  136  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4526  DEAD-like helicase  28.35 
 
 		 559 aa  136  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0602  type III restriction enzyme, res subunit  29.52 
 
 		 560 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.44982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0615  type III restriction enzyme, res subunit  29.52 
 
 		 560 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0593  type III restriction enzyme, res subunit  29.52 
 
 		 560 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2743  type III restriction protein res subunit  28.12 
 
 		 618 aa  133  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12931  hypothetical protein  28.14 
 
 		 626 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.129963  normal  0.499246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1502  type III restriction protein res subunit  28.57 
 
 		 572 aa  130  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08280  DNA/RNA helicase, superfamily II  27.99 
 
 		 606 aa  128  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.265179  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1380  type III restriction enzyme, res subunit  26.85 
 
 		 601 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.942893  normal  0.0185831 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1473  type III restriction enzyme, res subunit  27.41 
 
 		 577 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4538  type III restriction protein res subunit  29.77 
 
 		 565 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1438  type III restriction protein res subunit  27.92 
 
 		 575 aa  121  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3774  type III restriction protein res subunit  28.5 
 
 		 583 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.476443  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3772  type III restriction protein res subunit  28.38 
 
 		 594 aa  104  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0796  type III restriction protein res subunit  26.87 
 
 		 598 aa  103  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42368  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1868  hypothetical protein  67.21 
 
 		 139 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.776543  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3384  hypothetical protein  67.21 
 
 		 139 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1979  hypothetical protein  22.82 
 
 		 435 aa  82.4  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0682  hypothetical protein  22.62 
 
 		 456 aa  73.6  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835313  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08571  helicase domain-containing protein  26.5 
 
 		 438 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  22.73 
 
 		 580 aa  65.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1242  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  23.24 
 
 		 657 aa  61.6  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000376746  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  23.67 
 
 		 583 aa  60.8  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  23.4 
 
 		 583 aa  60.5  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  22.37 
 
 		 585 aa  58.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2726  type III restriction protein res subunit  22.67 
 
 		 580 aa  57  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.219655  hitchhiker  0.000185767 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  24.91 
 
 		 479 aa  55.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2089  type III restriction enzyme, res subunit  22.28 
 
 		 616 aa  54.3  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.553683  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1295  type III restriction enzyme, res subunit  24.15 
 
 		 584 aa  53.9  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  22.45 
 
 		 444 aa  53.5  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  23.81 
 
 		 952 aa  53.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  21.37 
 
 		 583 aa  52.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  23.05 
 
 		 517 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0509  type III restriction enzyme, res subunit  32 
 
 		 918 aa  52.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1862  type III restriction enzyme, res subunit  23.02 
 
 		 580 aa  52.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.547726  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2178  Type III restriction enzyme, res subunit  24.86 
 
 		 873 aa  51.6  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1359  helicase, putative  21.77 
 
 		 1041 aa  50.4  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  23.13 
 
 		 470 aa  50.4  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2879  type III restriction protein res subunit  21.66 
 
 		 608 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450355  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  23.9 
 
 		 488 aa  50.1  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  21.47 
 
 		 590 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2080  helicase  21.92 
 
 		 588 aa  49.7  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.453275  normal  0.977675 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  23.18 
 
 		 967 aa  49.7  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  21.05 
 
 		 1149 aa  49.7  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1030  type III restriction enzyme, res subunit  32.94 
 
 		 893 aa  49.3  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0182402  normal  0.455384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3695  putative helicase  22.31 
 
 		 676 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.783104  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  21.25 
 
 		 590 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  22.72 
 
 		 444 aa  48.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2096  type III restriction protein res subunit  24.67 
 
 		 889 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  23.38 
 
 		 449 aa  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  21.08 
 
 		 590 aa  47.8  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  21.31 
 
 		 494 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3456  type III restriction enzyme, res subunit  22.57 
 
 		 597 aa  47.8  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0432  type III restriction protein res subunit  20.8 
 
 		 619 aa  47  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  20.43 
 
 		 485 aa  47  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  31.52 
 
 		 953 aa  47  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  31.52 
 
 		 953 aa  47  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2125  Type III restriction enzyme, res subunit  21.72 
 
 		 842 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  21.2 
 
 		 590 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2082  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  20.27 
 
 		 574 aa  46.2  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3022  type III restriction protein res subunit  24.26 
 
 		 1597 aa  46.6  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>