133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2743 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3879  type III restriction protein res subunit  63.91 
 
 		 593 aa  733    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1719  DNA or RNA helicase of superfamily II-like protein  65.47 
 
 		 582 aa  761    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193156  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2381  ATPase  61.54 
 
 		 569 aa  640    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.191246  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0602  type III restriction enzyme, res subunit  60.51 
 
 		 560 aa  649    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.44982  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20110  DNA/RNA helicase, superfamily II  66.72 
 
 		 606 aa  764    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.24796  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2242  type III restriction protein res subunit  60.21 
 
 		 595 aa  670    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10520  DNA/RNA helicase, superfamily II  63.1 
 
 		 589 aa  737    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2588  type III restriction enzyme, res subunit  68.1 
 
 		 591 aa  795    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245843  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1291  type III restriction enzyme, res subunit  63.37 
 
 		 598 aa  707    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0615  type III restriction enzyme, res subunit  60.51 
 
 		 560 aa  649    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1502  type III restriction protein res subunit  59.68 
 
 		 572 aa  638    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0759  type III restriction enzyme, res subunit  60.44 
 
 		 566 aa  656    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523445  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0881  type III restriction protein res subunit  66.88 
 
 		 621 aa  808    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0593  type III restriction enzyme, res subunit  60.51 
 
 		 560 aa  649    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0145  type III restriction enzyme, res subunit  60.8 
 
 		 574 aa  659    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2320  type III restriction protein res subunit  67.92 
 
 		 593 aa  798    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000427068 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2743  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 618 aa  1210    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100626  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1318  type III restriction protein res subunit  71.69 
 
 		 601 aa  817    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0818356  hitchhiker  0.00409906 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0931  type III restriction protein res subunit  65.76 
 
 		 586 aa  724    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.355478  normal  0.978518 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0376  type III restriction protein res subunit  62.68 
 
 		 574 aa  676    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5135  type III restriction protein res subunit  62.65 
 
 		 622 aa  662    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1839  type III restriction protein res subunit  61.46 
 
 		 563 aa  671    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036346  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1051  type III restriction protein res subunit  71.77 
 
 		 628 aa  840    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25110  DNA/RNA helicase, superfamily II  73.66 
 
 		 593 aa  835    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.862041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1477  type III restriction protein res subunit  61.99 
 
 		 599 aa  719    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24400  DNA/RNA helicase, superfamily II  60.1 
 
 		 592 aa  671    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08280  DNA/RNA helicase, superfamily II  67.18 
 
 		 606 aa  780    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.265179  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12931  hypothetical protein  57.5 
 
 		 626 aa  630  1e-179  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.129963  normal  0.499246 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1473  type III restriction enzyme, res subunit  59.05 
 
 		 577 aa  619  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4538  type III restriction protein res subunit  57.68 
 
 		 565 aa  613  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1438  type III restriction protein res subunit  58.73 
 
 		 575 aa  608  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1380  type III restriction enzyme, res subunit  60.21 
 
 		 601 aa  601  1e-170  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.942893  normal  0.0185831 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0796  type III restriction protein res subunit  49.49 
 
 		 598 aa  473  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42368  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3772  type III restriction protein res subunit  50.17 
 
 		 594 aa  469  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3774  type III restriction protein res subunit  45.73 
 
 		 583 aa  437  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.476443  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4526  DEAD-like helicase  41.83 
 
 		 559 aa  356  5.999999999999999e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1925  GGDEF family protein  32.22 
 
 		 477 aa  182  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4016  type III restriction protein res subunit  30.48 
 
 		 469 aa  162  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3418  type III restriction enzyme, res subunit  29.41 
 
 		 469 aa  159  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.280626  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3839  type III restriction enzyme, res subunit  27.19 
 
 		 471 aa  155  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0145  type III restriction enzyme, res subunit  30 
 
 		 465 aa  153  7e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4273  type III restriction protein res subunit  28.9 
 
 		 471 aa  153  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4412  type III restriction protein res subunit  28.9 
 
 		 471 aa  153  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0080  helicase domain-containing protein  32.74 
 
 		 466 aa  150  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2555  hypothetical protein  29.68 
 
 		 465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.813616 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1893  type III restriction protein res subunit  29.25 
 
 		 472 aa  147  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3459  type III restriction protein res subunit  29.25 
 
 		 472 aa  147  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06217  hypothetical protein  28.97 
 
 		 464 aa  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0962  putative type III restriction enzyme  27.41 
 
 		 466 aa  144  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4219  FOG domain-containing protein  28.37 
 
 		 434 aa  137  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.701537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2283  type III restriction enzyme, res subunit  29.19 
 
 		 465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3891  helicase domain-containing protein  28.12 
 
 		 458 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4198  helicase domain protein  29.14 
 
 		 470 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0682  hypothetical protein  31.55 
 
 		 456 aa  124  6e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835313  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1979  hypothetical protein  29.18 
 
 		 435 aa  118  3e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08571  helicase domain-containing protein  31.51 
 
 		 438 aa  118  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0197  helicase domain-containing protein  30.47 
 
 		 429 aa  114  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.13298  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0931  type III restriction protein res subunit  32.43 
 
 		 601 aa  105  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3690  type III restriction protein res subunit  30.23 
 
 		 622 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367361 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2879  type III restriction protein res subunit  29.22 
 
 		 608 aa  87.4  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450355  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  22.63 
 
 		 469 aa  74.3  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  24.15 
 
 		 492 aa  70.9  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  25.25 
 
 		 462 aa  63.2  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1374  type III restriction protein res subunit  21.98 
 
 		 707 aa  62.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.304908  normal  0.550958 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  23.15 
 
 		 558 aa  60.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  19.58 
 
 		 698 aa  59.7  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  25 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  26.12 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  24.32 
 
 		 706 aa  57  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  25.73 
 
 		 469 aa  55.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  24.37 
 
 		 602 aa  56.2  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  27.39 
 
 		 652 aa  56.2  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1790  type III restriction protein res subunit  24.8 
 
 		 584 aa  55.1  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.766528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1238  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1131 aa  54.7  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2533  type III restriction protein res subunit  24.8 
 
 		 584 aa  54.3  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10242  hitchhiker  0.000564265 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  32.16 
 
 		 1129 aa  53.9  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5222  type III restriction protein res subunit  25.1 
 
 		 995 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.276942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  26.08 
 
 		 586 aa  52.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  24.41 
 
 		 951 aa  52.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  23.93 
 
 		 443 aa  51.6  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2087  type III restriction enzyme, res subunit  21.41 
 
 		 715 aa  50.8  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.167702  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1751  type III restriction protein res subunit  24.27 
 
 		 584 aa  50.8  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  24.07 
 
 		 590 aa  50.4  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04062  type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit  24.34 
 
 		 796 aa  50.4  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  26.9 
 
 		 489 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  26.9 
 
 		 489 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1747  type III restriction protein res subunit  24.32 
 
 		 584 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0541375  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  24.07 
 
 		 590 aa  47.8  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  27.72 
 
 		 650 aa  48.1  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  25.81 
 
 		 464 aa  48.1  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  25.82 
 
 		 586 aa  47.8  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  27.47 
 
 		 647 aa  47.4  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0497  type III restriction protein res subunit  20.05 
 
 		 696 aa  47.8  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.154157  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  25.82 
 
 		 586 aa  47.8  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0844  type III restriction enzyme, res subunit  26.38 
 
 		 613 aa  47.4  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  32.26 
 
 		 491 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2089  type III restriction enzyme, res subunit  23.47 
 
 		 616 aa  47  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.553683  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  23.54 
 
 		 590 aa  47  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6393  type III restriction protein res subunit  25.1 
 
 		 609 aa  47  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  32.63 
 
 		 949 aa  46.2  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>