176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2283 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2283  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 465 aa  967    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0197  helicase domain-containing protein  61.21 
 
 		 429 aa  553  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.13298  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0080  helicase domain-containing protein  51.91 
 
 		 466 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3418  type III restriction enzyme, res subunit  51.13 
 
 		 469 aa  404  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.280626  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4016  type III restriction protein res subunit  49.49 
 
 		 469 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4273  type III restriction protein res subunit  49.75 
 
 		 471 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1893  type III restriction protein res subunit  50.86 
 
 		 472 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3459  type III restriction protein res subunit  50.86 
 
 		 472 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4412  type III restriction protein res subunit  49.75 
 
 		 471 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2555  hypothetical protein  49.23 
 
 		 465 aa  396  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.813616 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3839  type III restriction enzyme, res subunit  51.02 
 
 		 471 aa  398  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1925  GGDEF family protein  48.23 
 
 		 477 aa  392  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4198  helicase domain protein  47.78 
 
 		 470 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0145  type III restriction enzyme, res subunit  48.72 
 
 		 465 aa  392  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0962  putative type III restriction enzyme  48.13 
 
 		 466 aa  393  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06217  hypothetical protein  47.94 
 
 		 464 aa  379  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3891  helicase domain-containing protein  47.34 
 
 		 458 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4219  FOG domain-containing protein  41.53 
 
 		 434 aa  295  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.701537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2242  type III restriction protein res subunit  31.5 
 
 		 595 aa  160  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3879  type III restriction protein res subunit  31.37 
 
 		 593 aa  159  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25110  DNA/RNA helicase, superfamily II  31.54 
 
 		 593 aa  159  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.862041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1477  type III restriction protein res subunit  30.3 
 
 		 599 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2381  ATPase  33.42 
 
 		 569 aa  155  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.191246  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4526  DEAD-like helicase  33.17 
 
 		 559 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20110  DNA/RNA helicase, superfamily II  32.61 
 
 		 606 aa  153  5e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.24796  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24400  DNA/RNA helicase, superfamily II  32.42 
 
 		 592 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1839  type III restriction protein res subunit  30.42 
 
 		 563 aa  152  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036346  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2588  type III restriction enzyme, res subunit  29.44 
 
 		 591 aa  152  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245843  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0376  type III restriction protein res subunit  30.9 
 
 		 574 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10520  DNA/RNA helicase, superfamily II  31.37 
 
 		 589 aa  150  4e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2320  type III restriction protein res subunit  29.64 
 
 		 593 aa  149  8e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000427068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1719  DNA or RNA helicase of superfamily II-like protein  30.98 
 
 		 582 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193156  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0931  type III restriction protein res subunit  31.72 
 
 		 586 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.355478  normal  0.978518 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5135  type III restriction protein res subunit  30.85 
 
 		 622 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1318  type III restriction protein res subunit  28.63 
 
 		 601 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0818356  hitchhiker  0.00409906 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12931  hypothetical protein  30.65 
 
 		 626 aa  144  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.129963  normal  0.499246 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0881  type III restriction protein res subunit  30.29 
 
 		 621 aa  144  4e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1051  type III restriction protein res subunit  31 
 
 		 628 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1291  type III restriction enzyme, res subunit  28.93 
 
 		 598 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0759  type III restriction enzyme, res subunit  29.26 
 
 		 566 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523445  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08280  DNA/RNA helicase, superfamily II  29.92 
 
 		 606 aa  135  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.265179  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0145  type III restriction enzyme, res subunit  29.85 
 
 		 574 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0602  type III restriction enzyme, res subunit  29.47 
 
 		 560 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.44982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0615  type III restriction enzyme, res subunit  29.47 
 
 		 560 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2743  type III restriction protein res subunit  29.19 
 
 		 618 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0593  type III restriction enzyme, res subunit  29.47 
 
 		 560 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1502  type III restriction protein res subunit  30.42 
 
 		 572 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1473  type III restriction enzyme, res subunit  29.21 
 
 		 577 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1438  type III restriction protein res subunit  30.23 
 
 		 575 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1380  type III restriction enzyme, res subunit  30.32 
 
 		 601 aa  127  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.942893  normal  0.0185831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4538  type III restriction protein res subunit  28.12 
 
 		 565 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3772  type III restriction protein res subunit  28.61 
 
 		 594 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3774  type III restriction protein res subunit  29.07 
 
 		 583 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.476443  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1979  hypothetical protein  26.56 
 
 		 435 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0796  type III restriction protein res subunit  27.2 
 
 		 598 aa  103  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42368  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08571  helicase domain-containing protein  26.17 
 
 		 438 aa  98.2  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0682  hypothetical protein  25.77 
 
 		 456 aa  87.4  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835313  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1868  hypothetical protein  60.61 
 
 		 139 aa  87  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.776543  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3384  hypothetical protein  60.61 
 
 		 139 aa  87  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  22.98 
 
 		 586 aa  70.1  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  25.91 
 
 		 485 aa  68.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  24.73 
 
 		 590 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  25 
 
 		 590 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1862  type III restriction enzyme, res subunit  22.41 
 
 		 580 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.547726  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  25.63 
 
 		 485 aa  67.4  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  23.47 
 
 		 585 aa  67  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  24.48 
 
 		 586 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  24.48 
 
 		 586 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  23.64 
 
 		 586 aa  66.6  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  23.64 
 
 		 586 aa  66.6  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  24.48 
 
 		 586 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  23.5 
 
 		 586 aa  66.6  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2089  type III restriction enzyme, res subunit  23.34 
 
 		 616 aa  65.9  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.553683  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  23.64 
 
 		 586 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  24.59 
 
 		 590 aa  65.1  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  23.56 
 
 		 586 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  24.08 
 
 		 583 aa  65.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  24.23 
 
 		 586 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0803  type III restriction enzyme, res subunit  27.27 
 
 		 1137 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.874877  normal  0.710753 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  24.23 
 
 		 586 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  24.23 
 
 		 586 aa  64.3  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  24.23 
 
 		 586 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1908  type III restriction protein res subunit  24.74 
 
 		 586 aa  64.3  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3456  type III restriction enzyme, res subunit  22.16 
 
 		 597 aa  63.5  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  24.23 
 
 		 586 aa  63.5  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  23.5 
 
 		 952 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1637  type III restriction protein res subunit  24.22 
 
 		 586 aa  63.2  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  24.19 
 
 		 590 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2726  type III restriction protein res subunit  22.25 
 
 		 580 aa  63.2  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.219655  hitchhiker  0.000185767 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  25.91 
 
 		 479 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  25.91 
 
 		 479 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  22.55 
 
 		 580 aa  62  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  25.51 
 
 		 479 aa  60.5  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  23.48 
 
 		 586 aa  60.1  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2080  helicase  23.16 
 
 		 588 aa  59.7  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.453275  normal  0.977675 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1295  type III restriction enzyme, res subunit  22.36 
 
 		 584 aa  58.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  24.48 
 
 		 967 aa  58.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1532  type III restriction enzyme, res subunit  23.87 
 
 		 579 aa  58.9  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2719  putative helicase  24.14 
 
 		 585 aa  58.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00330465  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2794  type III restriction protein res subunit  24.14 
 
 		 585 aa  58.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>