108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1291 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2381  ATPase  62.48 
 
 		 569 aa  660    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.191246  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1318  type III restriction protein res subunit  62.8 
 
 		 601 aa  690    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0818356  hitchhiker  0.00409906 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2588  type III restriction enzyme, res subunit  62.37 
 
 		 591 aa  709    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245843  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1291  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 598 aa  1194    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5135  type III restriction protein res subunit  61.2 
 
 		 622 aa  649    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0931  type III restriction protein res subunit  64.21 
 
 		 586 aa  696    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.355478  normal  0.978518 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0376  type III restriction protein res subunit  61.66 
 
 		 574 aa  663    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2320  type III restriction protein res subunit  62.71 
 
 		 593 aa  714    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000427068 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2743  type III restriction protein res subunit  63.37 
 
 		 618 aa  705    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08280  DNA/RNA helicase, superfamily II  61.42 
 
 		 606 aa  685    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.265179  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1502  type III restriction protein res subunit  60.74 
 
 		 572 aa  643    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1477  type III restriction protein res subunit  62.31 
 
 		 599 aa  708    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24400  DNA/RNA helicase, superfamily II  59.97 
 
 		 592 aa  654    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10520  DNA/RNA helicase, superfamily II  60.45 
 
 		 589 aa  682    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20110  DNA/RNA helicase, superfamily II  60.52 
 
 		 606 aa  682    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.24796  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0881  type III restriction protein res subunit  62.2 
 
 		 621 aa  694    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1839  type III restriction protein res subunit  60.21 
 
 		 563 aa  651    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036346  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2242  type III restriction protein res subunit  59.41 
 
 		 595 aa  645    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3879  type III restriction protein res subunit  62.27 
 
 		 593 aa  720    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25110  DNA/RNA helicase, superfamily II  62.07 
 
 		 593 aa  683    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.862041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1051  type III restriction protein res subunit  63.46 
 
 		 628 aa  676    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1719  DNA or RNA helicase of superfamily II-like protein  63.93 
 
 		 582 aa  725    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193156  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0145  type III restriction enzyme, res subunit  59.4 
 
 		 574 aa  634  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0759  type III restriction enzyme, res subunit  58.87 
 
 		 566 aa  629  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523445  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12931  hypothetical protein  56.57 
 
 		 626 aa  617  1e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.129963  normal  0.499246 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4538  type III restriction protein res subunit  57.17 
 
 		 565 aa  603  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1380  type III restriction enzyme, res subunit  60.48 
 
 		 601 aa  601  1e-170  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.942893  normal  0.0185831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0602  type III restriction enzyme, res subunit  55.2 
 
 		 560 aa  597  1e-169  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.44982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0615  type III restriction enzyme, res subunit  55.2 
 
 		 560 aa  597  1e-169  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0593  type III restriction enzyme, res subunit  55.2 
 
 		 560 aa  597  1e-169  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1473  type III restriction enzyme, res subunit  57.92 
 
 		 577 aa  590  1e-167  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1438  type III restriction protein res subunit  57.95 
 
 		 575 aa  586  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3772  type III restriction protein res subunit  46.84 
 
 		 594 aa  451  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3774  type III restriction protein res subunit  47.41 
 
 		 583 aa  451  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.476443  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0796  type III restriction protein res subunit  47.37 
 
 		 598 aa  443  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42368  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4526  DEAD-like helicase  39.86 
 
 		 559 aa  323  5e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1925  GGDEF family protein  32.65 
 
 		 477 aa  177  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4016  type III restriction protein res subunit  31.71 
 
 		 469 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1893  type III restriction protein res subunit  32.15 
 
 		 472 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3459  type III restriction protein res subunit  32.15 
 
 		 472 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3839  type III restriction enzyme, res subunit  30.18 
 
 		 471 aa  162  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3418  type III restriction enzyme, res subunit  30.81 
 
 		 469 aa  161  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.280626  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0145  type III restriction enzyme, res subunit  30.16 
 
 		 465 aa  159  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2555  hypothetical protein  30.16 
 
 		 465 aa  159  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.813616 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4273  type III restriction protein res subunit  30.18 
 
 		 471 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06217  hypothetical protein  30.22 
 
 		 464 aa  159  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4412  type III restriction protein res subunit  30.18 
 
 		 471 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3891  helicase domain-containing protein  28.97 
 
 		 458 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0080  helicase domain-containing protein  32.51 
 
 		 466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4219  FOG domain-containing protein  29.22 
 
 		 434 aa  144  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.701537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2283  type III restriction enzyme, res subunit  28.93 
 
 		 465 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4198  helicase domain protein  30.08 
 
 		 470 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0962  putative type III restriction enzyme  26.27 
 
 		 466 aa  140  4.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1979  hypothetical protein  30.69 
 
 		 435 aa  121  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0197  helicase domain-containing protein  30.46 
 
 		 429 aa  116  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.13298  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0682  hypothetical protein  30.02 
 
 		 456 aa  115  3e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835313  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08571  helicase domain-containing protein  30.31 
 
 		 438 aa  105  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0931  type III restriction protein res subunit  29.4 
 
 		 601 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2879  type III restriction protein res subunit  29.29 
 
 		 608 aa  94.4  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450355  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3690  type III restriction protein res subunit  29.18 
 
 		 622 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367361 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  23.18 
 
 		 469 aa  72.4  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  25.16 
 
 		 492 aa  68.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  24.23 
 
 		 464 aa  63.2  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  25.95 
 
 		 951 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1537  type III restriction enzyme, res subunit  22.38 
 
 		 732 aa  60.5  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0388  type III restriction protein res subunit  23.92 
 
 		 907 aa  60.5  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000267171 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  25 
 
 		 706 aa  59.7  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  20 
 
 		 698 aa  60.1  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  25.38 
 
 		 385 aa  59.7  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  23.71 
 
 		 558 aa  57.8  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2877  type III restriction protein res subunit  22.16 
 
 		 1137 aa  57.4  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  25.52 
 
 		 443 aa  57  0.0000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0497  type III restriction protein res subunit  22.85 
 
 		 696 aa  56.6  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.154157  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0731  type III restriction enzyme, res subunit  24.77 
 
 		 899 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04062  type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit  25 
 
 		 796 aa  55.1  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0725  type III restriction protein res subunit  23.27 
 
 		 1005 aa  54.3  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147192 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  26.97 
 
 		 489 aa  53.9  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  26.97 
 
 		 489 aa  53.9  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0785  EcoEI R domain-containing protein  25.79 
 
 		 791 aa  52.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519017  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1034  type III restriction protein res subunit  23.6 
 
 		 1126 aa  53.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0485696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1374  type III restriction protein res subunit  21.63 
 
 		 707 aa  51.6  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.304908  normal  0.550958 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2087  type III restriction enzyme, res subunit  21.67 
 
 		 715 aa  51.2  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.167702  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  24.05 
 
 		 531 aa  50.8  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3202  type III restriction protein res subunit  21.73 
 
 		 1133 aa  50.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  28.57 
 
 		 493 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  27.34 
 
 		 451 aa  48.5  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  30.53 
 
 		 949 aa  48.1  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5278  type III restriction protein res subunit  25.24 
 
 		 899 aa  48.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  26.73 
 
 		 494 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2990  EcoEI R domain protein  23.51 
 
 		 875 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  25.33 
 
 		 652 aa  47.4  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1128  type III restriction enzyme, res subunit  21.91 
 
 		 932 aa  47.4  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1456  type III restriction protein res subunit  21.91 
 
 		 932 aa  46.6  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2088  EcoEI R domain protein  30 
 
 		 546 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000340083 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  28.49 
 
 		 647 aa  45.8  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  22.59 
 
 		 602 aa  45.8  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  26.42 
 
 		 499 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  25.42 
 
 		 440 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3022  type III restriction protein res subunit  27.08 
 
 		 1597 aa  45.4  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5222  type III restriction protein res subunit  25.3 
 
 		 995 aa  45.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.276942  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>