101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1502 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1380  type III restriction enzyme, res subunit  62.63 
 
 		 601 aa  672    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.942893  normal  0.0185831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0602  type III restriction enzyme, res subunit  67.43 
 
 		 560 aa  769    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.44982  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2588  type III restriction enzyme, res subunit  58.25 
 
 		 591 aa  649    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245843  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1291  type III restriction enzyme, res subunit  61.16 
 
 		 598 aa  659    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0615  type III restriction enzyme, res subunit  67.43 
 
 		 560 aa  769    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0759  type III restriction enzyme, res subunit  67.66 
 
 		 566 aa  773    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523445  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0593  type III restriction enzyme, res subunit  67.43 
 
 		 560 aa  768    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0145  type III restriction enzyme, res subunit  67.37 
 
 		 574 aa  761    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1473  type III restriction enzyme, res subunit  64.54 
 
 		 577 aa  705    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12931  hypothetical protein  66.19 
 
 		 626 aa  746    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.129963  normal  0.499246 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5135  type III restriction protein res subunit  64.98 
 
 		 622 aa  729    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1438  type III restriction protein res subunit  64.41 
 
 		 575 aa  699    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2320  type III restriction protein res subunit  57.5 
 
 		 593 aa  645    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000427068 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2743  type III restriction protein res subunit  59.5 
 
 		 618 aa  655    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08280  DNA/RNA helicase, superfamily II  58.1 
 
 		 606 aa  637    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.265179  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1502  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 572 aa  1161    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1477  type III restriction protein res subunit  58.67 
 
 		 599 aa  671    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24400  DNA/RNA helicase, superfamily II  76.53 
 
 		 592 aa  900    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10520  DNA/RNA helicase, superfamily II  58.63 
 
 		 589 aa  647    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20110  DNA/RNA helicase, superfamily II  56.38 
 
 		 606 aa  640    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.24796  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2242  type III restriction protein res subunit  72.18 
 
 		 595 aa  838    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3879  type III restriction protein res subunit  62.32 
 
 		 593 aa  702    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25110  DNA/RNA helicase, superfamily II  58.43 
 
 		 593 aa  647    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.862041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1051  type III restriction protein res subunit  58.83 
 
 		 628 aa  636    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1719  DNA or RNA helicase of superfamily II-like protein  59.93 
 
 		 582 aa  674    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193156  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4538  type III restriction protein res subunit  60.67 
 
 		 565 aa  684    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1839  type III restriction protein res subunit  70.28 
 
 		 563 aa  805    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036346  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0931  type III restriction protein res subunit  62.3 
 
 		 586 aa  669    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.355478  normal  0.978518 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0376  type III restriction protein res subunit  59.19 
 
 		 574 aa  651    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1318  type III restriction protein res subunit  58.76 
 
 		 601 aa  630  1e-179  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0818356  hitchhiker  0.00409906 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2381  ATPase  56.82 
 
 		 569 aa  627  1e-178  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.191246  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0881  type III restriction protein res subunit  57.32 
 
 		 621 aa  627  1e-178  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3772  type III restriction protein res subunit  47.31 
 
 		 594 aa  469  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0796  type III restriction protein res subunit  45.98 
 
 		 598 aa  463  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42368  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3774  type III restriction protein res subunit  46.22 
 
 		 583 aa  456  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.476443  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4526  DEAD-like helicase  39.82 
 
 		 559 aa  343  7e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1925  GGDEF family protein  30.67 
 
 		 477 aa  162  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4016  type III restriction protein res subunit  30.33 
 
 		 469 aa  158  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06217  hypothetical protein  32.43 
 
 		 464 aa  150  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0145  type III restriction enzyme, res subunit  28.78 
 
 		 465 aa  149  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1893  type III restriction protein res subunit  29.56 
 
 		 472 aa  146  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3459  type III restriction protein res subunit  29.56 
 
 		 472 aa  146  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2555  hypothetical protein  29.14 
 
 		 465 aa  144  6e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.813616 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3839  type III restriction enzyme, res subunit  28.61 
 
 		 471 aa  143  8e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0962  putative type III restriction enzyme  28.21 
 
 		 466 aa  141  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3418  type III restriction enzyme, res subunit  27.34 
 
 		 469 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.280626  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4273  type III restriction protein res subunit  27.85 
 
 		 471 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4412  type III restriction protein res subunit  27.85 
 
 		 471 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2283  type III restriction enzyme, res subunit  31.75 
 
 		 465 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0080  helicase domain-containing protein  30.62 
 
 		 466 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3891  helicase domain-containing protein  28.93 
 
 		 458 aa  125  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4219  FOG domain-containing protein  26.74 
 
 		 434 aa  124  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.701537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4198  helicase domain protein  28.91 
 
 		 470 aa  123  9e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0682  hypothetical protein  30.42 
 
 		 456 aa  120  9e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835313  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1979  hypothetical protein  30.21 
 
 		 435 aa  114  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0197  helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 429 aa  114  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.13298  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2879  type III restriction protein res subunit  30.18 
 
 		 608 aa  104  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450355  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08571  helicase domain-containing protein  28.72 
 
 		 438 aa  97.8  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3690  type III restriction protein res subunit  29.18 
 
 		 622 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367361 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0931  type III restriction protein res subunit  29.46 
 
 		 601 aa  91.3  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  22.06 
 
 		 492 aa  73.6  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  22.82 
 
 		 469 aa  72.8  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  22.59 
 
 		 489 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  22.37 
 
 		 489 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  21.48 
 
 		 493 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  25.13 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1094  type III restriction enzyme, res subunit  22.79 
 
 		 945 aa  61.6  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5514  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  23.36 
 
 		 444 aa  53.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  30.77 
 
 		 443 aa  53.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  25.32 
 
 		 444 aa  53.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  23.38 
 
 		 462 aa  52.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0497  type III restriction protein res subunit  22.22 
 
 		 696 aa  51.6  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.154157  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0785  EcoEI R domain-containing protein  25 
 
 		 791 aa  51.6  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519017  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6393  type III restriction protein res subunit  26.48 
 
 		 609 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3022  type III restriction protein res subunit  24.33 
 
 		 1597 aa  50.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  22.25 
 
 		 558 aa  48.5  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  20.34 
 
 		 698 aa  48.1  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2984  type III restriction protein res subunit  23.12 
 
 		 1113 aa  48.5  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.135376  normal  0.189592 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  24.47 
 
 		 440 aa  48.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1875  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.19 
 
 		 633 aa  47.8  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5781  type III restriction protein res subunit  23.83 
 
 		 978 aa  48.1  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0358672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2877  type III restriction protein res subunit  21.23 
 
 		 1137 aa  47.8  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5222  type III restriction protein res subunit  24.21 
 
 		 995 aa  47.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.276942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2450  DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  29.47 
 
 		 952 aa  46.2  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  22.87 
 
 		 586 aa  46.2  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  24.23 
 
 		 652 aa  45.8  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  30.86 
 
 		 451 aa  46.2  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04062  type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit  23.81 
 
 		 796 aa  45.8  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0270  DEAD/DEAH box helicase  22.79 
 
 		 790 aa  45.4  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.113163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0516  type I restriction-modification system R subunit (endonuclease)  26.32 
 
 		 1115 aa  45.1  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0160  type III restriction enzyme, res subunit  28.21 
 
 		 1137 aa  45.4  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0444998  normal  0.740458 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  28.57 
 
 		 706 aa  45.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  23.45 
 
 		 499 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1454  Eco57I restriction endonuclease  24.12 
 
 		 1359 aa  44.7  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  29.55 
 
 		 451 aa  44.7  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4712  type III restriction enzyme, res subunit  20.49 
 
 		 1137 aa  44.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1238  hypothetical protein  26.28 
 
 		 1131 aa  44.3  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4808  type III restriction enzyme, res subunit  20.49 
 
 		 1137 aa  44.3  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.564367  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3456  type III restriction enzyme, res subunit  24.05 
 
 		 597 aa  44.3  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  29.49 
 
 		 468 aa  43.9  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>