149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2381 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2381  ATPase  100 
 
 		 569 aa  1155    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.191246  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0881  type III restriction protein res subunit  61.58 
 
 		 621 aa  685    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20110  DNA/RNA helicase, superfamily II  59.79 
 
 		 606 aa  668    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.24796  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24400  DNA/RNA helicase, superfamily II  58.96 
 
 		 592 aa  660    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2588  type III restriction enzyme, res subunit  61.35 
 
 		 591 aa  689    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245843  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1291  type III restriction enzyme, res subunit  62.48 
 
 		 598 aa  682    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1719  DNA or RNA helicase of superfamily II-like protein  69.29 
 
 		 582 aa  793    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193156  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0376  type III restriction protein res subunit  79.17 
 
 		 574 aa  928    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1318  type III restriction protein res subunit  64.59 
 
 		 601 aa  695    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0818356  hitchhiker  0.00409906 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08280  DNA/RNA helicase, superfamily II  59.93 
 
 		 606 aa  659    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.265179  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1839  type III restriction protein res subunit  59.25 
 
 		 563 aa  650    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036346  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1477  type III restriction protein res subunit  62.46 
 
 		 599 aa  707    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1051  type III restriction protein res subunit  61.81 
 
 		 628 aa  659    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0931  type III restriction protein res subunit  69.64 
 
 		 586 aa  754    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.355478  normal  0.978518 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2242  type III restriction protein res subunit  60.46 
 
 		 595 aa  653    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3879  type III restriction protein res subunit  68.61 
 
 		 593 aa  774    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5135  type III restriction protein res subunit  62.98 
 
 		 622 aa  695    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25110  DNA/RNA helicase, superfamily II  61.28 
 
 		 593 aa  681    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.862041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1502  type III restriction protein res subunit  56.82 
 
 		 572 aa  635    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2743  type III restriction protein res subunit  61.54 
 
 		 618 aa  664    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10520  DNA/RNA helicase, superfamily II  60.25 
 
 		 589 aa  646    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2320  type III restriction protein res subunit  62.65 
 
 		 593 aa  698    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000427068 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1380  type III restriction enzyme, res subunit  61.14 
 
 		 601 aa  633  1e-180  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.942893  normal  0.0185831 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0759  type III restriction enzyme, res subunit  59.28 
 
 		 566 aa  625  1e-178  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523445  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0145  type III restriction enzyme, res subunit  58.48 
 
 		 574 aa  625  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0602  type III restriction enzyme, res subunit  57.55 
 
 		 560 aa  614  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.44982  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4538  type III restriction protein res subunit  57.37 
 
 		 565 aa  613  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0615  type III restriction enzyme, res subunit  57.55 
 
 		 560 aa  614  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0593  type III restriction enzyme, res subunit  57.55 
 
 		 560 aa  614  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12931  hypothetical protein  55.81 
 
 		 626 aa  611  9.999999999999999e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.129963  normal  0.499246 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1473  type III restriction enzyme, res subunit  57.29 
 
 		 577 aa  594  1e-168  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1438  type III restriction protein res subunit  57.04 
 
 		 575 aa  592  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3772  type III restriction protein res subunit  49.56 
 
 		 594 aa  481  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0796  type III restriction protein res subunit  47.37 
 
 		 598 aa  464  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42368  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3774  type III restriction protein res subunit  46.21 
 
 		 583 aa  460  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.476443  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4526  DEAD-like helicase  39.47 
 
 		 559 aa  331  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1925  GGDEF family protein  33.76 
 
 		 477 aa  189  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4016  type III restriction protein res subunit  31.47 
 
 		 469 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3418  type III restriction enzyme, res subunit  32.76 
 
 		 469 aa  177  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.280626  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1893  type III restriction protein res subunit  32.99 
 
 		 472 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3459  type III restriction protein res subunit  32.99 
 
 		 472 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06217  hypothetical protein  34.15 
 
 		 464 aa  173  7.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0962  putative type III restriction enzyme  30.86 
 
 		 466 aa  170  6e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4273  type III restriction protein res subunit  30.46 
 
 		 471 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4412  type III restriction protein res subunit  30.46 
 
 		 471 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2283  type III restriction enzyme, res subunit  32.07 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3839  type III restriction enzyme, res subunit  30.81 
 
 		 471 aa  160  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0145  type III restriction enzyme, res subunit  30.95 
 
 		 465 aa  160  6e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2555  hypothetical protein  30.48 
 
 		 465 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.813616 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3891  helicase domain-containing protein  29.97 
 
 		 458 aa  146  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4219  FOG domain-containing protein  29.49 
 
 		 434 aa  146  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.701537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0080  helicase domain-containing protein  32.74 
 
 		 466 aa  144  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4198  helicase domain protein  28.02 
 
 		 470 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0197  helicase domain-containing protein  31.16 
 
 		 429 aa  128  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.13298  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0682  hypothetical protein  30.47 
 
 		 456 aa  127  6e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835313  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1979  hypothetical protein  28.79 
 
 		 435 aa  117  6e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08571  helicase domain-containing protein  30.58 
 
 		 438 aa  108  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0931  type III restriction protein res subunit  27.04 
 
 		 601 aa  87.8  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2879  type III restriction protein res subunit  27.51 
 
 		 608 aa  87  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450355  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3690  type III restriction protein res subunit  26.79 
 
 		 622 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367361 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  25.98 
 
 		 489 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  26.23 
 
 		 489 aa  80.1  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  25.6 
 
 		 492 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  24.57 
 
 		 469 aa  77.8  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  23.84 
 
 		 493 aa  74.7  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  26.4 
 
 		 706 aa  74.3  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  26.33 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1238  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1131 aa  61.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  20.19 
 
 		 698 aa  60.5  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2087  type III restriction enzyme, res subunit  22.55 
 
 		 715 aa  59.7  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.167702  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2877  type III restriction protein res subunit  24.14 
 
 		 1137 aa  59.7  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  24.52 
 
 		 464 aa  58.2  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4712  type III restriction enzyme, res subunit  23.34 
 
 		 1137 aa  58.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  24.61 
 
 		 558 aa  57.8  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4808  type III restriction enzyme, res subunit  23.34 
 
 		 1137 aa  57.8  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.564367  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1537  type III restriction enzyme, res subunit  22.22 
 
 		 732 aa  57.4  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0160  type III restriction enzyme, res subunit  24.87 
 
 		 1137 aa  55.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0444998  normal  0.740458 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2440  type III restriction protein res subunit  25.26 
 
 		 591 aa  53.9  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0497  type III restriction protein res subunit  20.8 
 
 		 696 aa  53.9  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.154157  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1034  type III restriction protein res subunit  24.23 
 
 		 1126 aa  53.5  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0485696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  33.79 
 
 		 1131 aa  52.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  26.36 
 
 		 479 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  24.67 
 
 		 586 aa  52.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1908  type III restriction protein res subunit  24.83 
 
 		 586 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1374  type III restriction protein res subunit  29.24 
 
 		 707 aa  52  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.304908  normal  0.550958 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  26.54 
 
 		 462 aa  52  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3253  type III restriction protein res subunit  24.34 
 
 		 585 aa  52  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.503255  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  27.98 
 
 		 1160 aa  52  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00119  Type III restriction enzyme, res subunit  21.27 
 
 		 744 aa  52  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.431054  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  27.44 
 
 		 449 aa  51.2  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1094  type III restriction enzyme, res subunit  22.36 
 
 		 945 aa  51.2  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5514  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  25.48 
 
 		 499 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2892  type III restriction protein res subunit  26.2 
 
 		 583 aa  50.8  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  24.87 
 
 		 551 aa  50.8  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1171  type III restriction enzyme, res subunit  21.93 
 
 		 912 aa  50.4  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.145829  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1637  type III restriction protein res subunit  24.61 
 
 		 586 aa  50.4  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0388  type III restriction protein res subunit  23.12 
 
 		 907 aa  50.4  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000267171 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  27.93 
 
 		 1144 aa  49.7  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  23.79 
 
 		 443 aa  50.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  32.48 
 
 		 1116 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>