86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1473 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5135  type III restriction protein res subunit  61.4 
 
 		 622 aa  649    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0759  type III restriction enzyme, res subunit  63.56 
 
 		 566 aa  699    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523445  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0615  type III restriction enzyme, res subunit  62.65 
 
 		 560 aa  688    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1719  DNA or RNA helicase of superfamily II-like protein  62.85 
 
 		 582 aa  681    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193156  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0593  type III restriction enzyme, res subunit  62.83 
 
 		 560 aa  686    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0145  type III restriction enzyme, res subunit  62.37 
 
 		 574 aa  687    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1473  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 577 aa  1145    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12931  hypothetical protein  59.65 
 
 		 626 aa  657    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.129963  normal  0.499246 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4538  type III restriction protein res subunit  68.95 
 
 		 565 aa  783    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3879  type III restriction protein res subunit  61.61 
 
 		 593 aa  665    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2242  type III restriction protein res subunit  64.08 
 
 		 595 aa  708    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1839  type III restriction protein res subunit  63.89 
 
 		 563 aa  703    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036346  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0602  type III restriction enzyme, res subunit  62.65 
 
 		 560 aa  688    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.44982  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0931  type III restriction protein res subunit  62.98 
 
 		 586 aa  669    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.355478  normal  0.978518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1438  type III restriction protein res subunit  95.67 
 
 		 575 aa  1035    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24400  DNA/RNA helicase, superfamily II  66.19 
 
 		 592 aa  752    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2743  type III restriction protein res subunit  59.4 
 
 		 618 aa  639    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1502  type III restriction protein res subunit  64.54 
 
 		 572 aa  715    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1477  type III restriction protein res subunit  58.42 
 
 		 599 aa  646    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20110  DNA/RNA helicase, superfamily II  58.14 
 
 		 606 aa  634  1e-180  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.24796  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1318  type III restriction protein res subunit  58.8 
 
 		 601 aa  624  1e-177  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0818356  hitchhiker  0.00409906 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10520  DNA/RNA helicase, superfamily II  57.39 
 
 		 589 aa  623  1e-177  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25110  DNA/RNA helicase, superfamily II  57.22 
 
 		 593 aa  620  1e-176  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.862041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2588  type III restriction enzyme, res subunit  56.62 
 
 		 591 aa  620  1e-176  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245843  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2320  type III restriction protein res subunit  55.67 
 
 		 593 aa  614  9.999999999999999e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000427068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1291  type III restriction enzyme, res subunit  58.27 
 
 		 598 aa  610  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1380  type III restriction enzyme, res subunit  60.24 
 
 		 601 aa  610  1e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.942893  normal  0.0185831 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1051  type III restriction protein res subunit  58.09 
 
 		 628 aa  608  1e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0376  type III restriction protein res subunit  56.23 
 
 		 574 aa  607  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08280  DNA/RNA helicase, superfamily II  55.92 
 
 		 606 aa  607  9.999999999999999e-173  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.265179  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2381  ATPase  57.99 
 
 		 569 aa  593  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.191246  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0881  type III restriction protein res subunit  55.91 
 
 		 621 aa  590  1e-167  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3772  type III restriction protein res subunit  49.32 
 
 		 594 aa  471  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0796  type III restriction protein res subunit  47.68 
 
 		 598 aa  450  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42368  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3774  type III restriction protein res subunit  46.8 
 
 		 583 aa  449  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.476443  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4526  DEAD-like helicase  41.51 
 
 		 559 aa  347  3e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1925  GGDEF family protein  31.88 
 
 		 477 aa  178  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1893  type III restriction protein res subunit  30.62 
 
 		 472 aa  150  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3459  type III restriction protein res subunit  30.62 
 
 		 472 aa  150  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06217  hypothetical protein  30 
 
 		 464 aa  147  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4016  type III restriction protein res subunit  29.04 
 
 		 469 aa  145  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0145  type III restriction enzyme, res subunit  30.34 
 
 		 465 aa  143  8e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4219  FOG domain-containing protein  31.86 
 
 		 434 aa  141  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.701537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3839  type III restriction enzyme, res subunit  28.36 
 
 		 471 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4273  type III restriction protein res subunit  29.38 
 
 		 471 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4412  type III restriction protein res subunit  29.38 
 
 		 471 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3418  type III restriction enzyme, res subunit  28.54 
 
 		 469 aa  139  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.280626  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2555  hypothetical protein  29.82 
 
 		 465 aa  139  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.813616 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0080  helicase domain-containing protein  31.06 
 
 		 466 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2283  type III restriction enzyme, res subunit  29.21 
 
 		 465 aa  136  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0962  putative type III restriction enzyme  27.27 
 
 		 466 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0682  hypothetical protein  31.55 
 
 		 456 aa  127  4.0000000000000003e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835313  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3891  helicase domain-containing protein  27.3 
 
 		 458 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4198  helicase domain protein  26.7 
 
 		 470 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1979  hypothetical protein  30.3 
 
 		 435 aa  119  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08571  helicase domain-containing protein  30.31 
 
 		 438 aa  113  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0197  helicase domain-containing protein  30.27 
 
 		 429 aa  109  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.13298  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3690  type III restriction protein res subunit  29.51 
 
 		 622 aa  84.3  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367361 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  25 
 
 		 493 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2879  type III restriction protein res subunit  28.12 
 
 		 608 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450355  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0931  type III restriction protein res subunit  28.04 
 
 		 601 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  24.11 
 
 		 489 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  23.68 
 
 		 489 aa  74.7  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  24.26 
 
 		 492 aa  70.5  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  25.53 
 
 		 706 aa  61.2  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  26.26 
 
 		 469 aa  61.2  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  19.95 
 
 		 698 aa  61.2  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2984  type III restriction protein res subunit  26.26 
 
 		 1113 aa  59.3  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.135376  normal  0.189592 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1374  type III restriction protein res subunit  21.65 
 
 		 707 aa  58.2  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.304908  normal  0.550958 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  25.13 
 
 		 385 aa  55.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0497  type III restriction protein res subunit  19.89 
 
 		 696 aa  56.2  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.154157  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  25.41 
 
 		 462 aa  50.4  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  21.62 
 
 		 551 aa  48.5  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  23.44 
 
 		 558 aa  47.8  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  22.7 
 
 		 444 aa  47.4  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  31.68 
 
 		 949 aa  47  0.0009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3022  type III restriction protein res subunit  32.76 
 
 		 1597 aa  46.2  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0160  type III restriction enzyme, res subunit  23.76 
 
 		 1137 aa  46.2  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0444998  normal  0.740458 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  25.73 
 
 		 951 aa  45.4  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1537  type III restriction enzyme, res subunit  20.44 
 
 		 732 aa  45.1  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  27.27 
 
 		 949 aa  44.7  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1238  hypothetical protein  25.38 
 
 		 1131 aa  45.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  30.41 
 
 		 968 aa  44.3  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2087  type III restriction enzyme, res subunit  20.49 
 
 		 715 aa  43.9  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.167702  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4564  helicase-like  24.65 
 
 		 453 aa  43.9  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0355  type III restriction enzyme, res subunit  20.15 
 
 		 596 aa  43.5  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.098863  normal  0.390536 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>