24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1454 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0750  Eco57I restriction endonuclease  51.19 
 
 		 1364 aa  1313    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000117598 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1454  Eco57I restriction endonuclease  100 
 
 		 1359 aa  2738    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1453  Eco57I restriction endonuclease  49.58 
 
 		 348 aa  343  1e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1330  superfamily II DNA/RNA helicase  41.47 
 
 		 1462 aa  342  2e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0904  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  29.33 
 
 		 514 aa  210  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000734912  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2228  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  30.67 
 
 		 526 aa  201  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0314397  hitchhiker  0.0000846728 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2422  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  27.27 
 
 		 531 aa  178  6e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0501515  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0197  Eco57I restriction endonuclease  27.85 
 
 		 562 aa  177  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0747  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.54 
 
 		 530 aa  171  9e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2226  putative uncharacterized restriction enzyme  26.29 
 
 		 837 aa  168  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000214566  decreased coverage  0.00000161131 
 
 
-
 
NC_002950  PG1697  type II restriction endonuclease, putative  23.08 
 
 		 1324 aa  164  1e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.431885 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0745  hypothetical protein  24.33 
 
 		 852 aa  160  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.947615  normal  0.0888833 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0198  type III restriction system endonuclease, putative  23.59 
 
 		 848 aa  151  9e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0905  putative restriction enzyme  24.11 
 
 		 853 aa  147  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2421  hypothetical protein  24.35 
 
 		 844 aa  138  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.128408  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0923  type III restriction system endonuclease, putative  24.91 
 
 		 850 aa  133  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297782  normal  0.710941 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1588  type III restriction enzyme, res subunit  22.57 
 
 		 1094 aa  111  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1589  Eco57I restriction endonuclease  28.73 
 
 		 351 aa  103  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0514  hypothetical protein  25 
 
 		 1108 aa  100  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0926  Eco57I restriction endonuclease  25.26 
 
 		 321 aa  88.6  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.419584  normal  0.538577 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1677  type III restriction protein res subunit  22.12 
 
 		 1110 aa  82.8  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0924  type III restriction system endonuclease, putative  29.93 
 
 		 139 aa  75.9  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0708184  normal  0.517067 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0513  Eco57I restriction endonuclease  26.8 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.611279  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1676  Eco57I restriction endonuclease  22.05 
 
 		 665 aa  50.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>