31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1330 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1697  type II restriction endonuclease, putative  38.46 
 
 		 1324 aa  879    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.431885 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1330  superfamily II DNA/RNA helicase  100 
 
 		 1462 aa  3025    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1454  Eco57I restriction endonuclease  41.67 
 
 		 1359 aa  339  2.9999999999999997e-91  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0514  hypothetical protein  33.98 
 
 		 1108 aa  322  3.9999999999999996e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1588  type III restriction enzyme, res subunit  33.69 
 
 		 1094 aa  315  3.9999999999999997e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1677  type III restriction protein res subunit  33.85 
 
 		 1110 aa  292  4e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2226  putative uncharacterized restriction enzyme  29.62 
 
 		 837 aa  267  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000214566  decreased coverage  0.00000161131 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1453  Eco57I restriction endonuclease  41.31 
 
 		 348 aa  255  5.000000000000001e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0905  putative restriction enzyme  29.26 
 
 		 853 aa  253  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0923  type III restriction system endonuclease, putative  29.27 
 
 		 850 aa  237  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297782  normal  0.710941 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0745  hypothetical protein  26.2 
 
 		 852 aa  229  4e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.947615  normal  0.0888833 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0198  type III restriction system endonuclease, putative  27.82 
 
 		 848 aa  228  6e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2421  hypothetical protein  27.76 
 
 		 844 aa  226  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.128408  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2228  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  35.61 
 
 		 526 aa  204  7e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0314397  hitchhiker  0.0000846728 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0904  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  35.67 
 
 		 514 aa  195  4e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000734912  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2422  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  31.61 
 
 		 531 aa  188  6e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0501515  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0747  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  32.51 
 
 		 530 aa  187  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0197  Eco57I restriction endonuclease  32.28 
 
 		 562 aa  186  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0750  Eco57I restriction endonuclease  29.08 
 
 		 1364 aa  143  1.9999999999999998e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000117598 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1589  Eco57I restriction endonuclease  32.03 
 
 		 351 aa  131  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0513  Eco57I restriction endonuclease  34.44 
 
 		 341 aa  118  6.9999999999999995e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.611279  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0926  Eco57I restriction endonuclease  38.74 
 
 		 321 aa  95.1  8e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.419584  normal  0.538577 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1676  Eco57I restriction endonuclease  25.47 
 
 		 665 aa  71.6  0.00000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0924  type III restriction system endonuclease, putative  29.05 
 
 		 139 aa  70.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0708184  normal  0.517067 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3601  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  22.46 
 
 		 1137 aa  48.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1670  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  22.71 
 
 		 1169 aa  47  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225795  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04216  endonuclease R  22.65 
 
 		 1170 aa  46.2  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1432  type III restriction protein, res subunit  24.5 
 
 		 1108 aa  46.6  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  29.59 
 
 		 974 aa  46.2  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4267  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  22.99 
 
 		 1188 aa  45.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1098  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  28.57 
 
 		 1124 aa  45.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>