24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1697 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1697  type II restriction endonuclease, putative  100 
 
 		 1324 aa  2766    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.431885 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1330  superfamily II DNA/RNA helicase  38.08 
 
 		 1462 aa  845    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1589  Eco57I restriction endonuclease  45.58 
 
 		 351 aa  316  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0514  hypothetical protein  32.97 
 
 		 1108 aa  308  3e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1588  type III restriction enzyme, res subunit  33.01 
 
 		 1094 aa  305  3.0000000000000004e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0513  Eco57I restriction endonuclease  41.98 
 
 		 341 aa  288  4e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.611279  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1677  type III restriction protein res subunit  33.49 
 
 		 1110 aa  286  1.0000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0750  Eco57I restriction endonuclease  40.72 
 
 		 1364 aa  275  4.0000000000000004e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000117598 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0923  type III restriction system endonuclease, putative  27.88 
 
 		 850 aa  273  2e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297782  normal  0.710941 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2226  putative uncharacterized restriction enzyme  28.5 
 
 		 837 aa  273  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000214566  decreased coverage  0.00000161131 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0905  putative restriction enzyme  29.11 
 
 		 853 aa  270  1e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0198  type III restriction system endonuclease, putative  28.37 
 
 		 848 aa  268  5.999999999999999e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0745  hypothetical protein  27.1 
 
 		 852 aa  253  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.947615  normal  0.0888833 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2421  hypothetical protein  26.85 
 
 		 844 aa  238  6e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.128408  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1454  Eco57I restriction endonuclease  22.52 
 
 		 1359 aa  164  8.000000000000001e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2228  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  29.87 
 
 		 526 aa  149  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0314397  hitchhiker  0.0000846728 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0904  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  33.33 
 
 		 514 aa  147  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000734912  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2422  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  27.57 
 
 		 531 aa  128  8.000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0501515  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1453  Eco57I restriction endonuclease  25.93 
 
 		 348 aa  117  1.0000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0747  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.26 
 
 		 530 aa  115  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0197  Eco57I restriction endonuclease  40.37 
 
 		 562 aa  86.3  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1676  Eco57I restriction endonuclease  24.47 
 
 		 665 aa  73.2  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0926  Eco57I restriction endonuclease  38.61 
 
 		 321 aa  73.2  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.419584  normal  0.538577 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0924  type III restriction system endonuclease, putative  30 
 
 		 139 aa  62.4  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0708184  normal  0.517067 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>