26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2228 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2228  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  100 
 
 		 526 aa  1101    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0314397  hitchhiker  0.0000846728 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0904  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  56.2 
 
 		 514 aa  592  1e-168  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000734912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0197  Eco57I restriction endonuclease  53.33 
 
 		 562 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2422  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  49.72 
 
 		 531 aa  510  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0501515  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0747  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  46.76 
 
 		 530 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0926  Eco57I restriction endonuclease  56.72 
 
 		 321 aa  358  9.999999999999999e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.419584  normal  0.538577 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1453  Eco57I restriction endonuclease  38.55 
 
 		 348 aa  229  6e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1454  Eco57I restriction endonuclease  30.35 
 
 		 1359 aa  199  9e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1330  superfamily II DNA/RNA helicase  35.33 
 
 		 1462 aa  190  5.999999999999999e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1697  type II restriction endonuclease, putative  29.87 
 
 		 1324 aa  150  7e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.431885 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0750  Eco57I restriction endonuclease  24.35 
 
 		 1364 aa  140  4.999999999999999e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000117598 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1589  Eco57I restriction endonuclease  30.68 
 
 		 351 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0924  type III restriction system endonuclease, putative  44.44 
 
 		 139 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0708184  normal  0.517067 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0513  Eco57I restriction endonuclease  27.41 
 
 		 341 aa  89.4  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.611279  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1676  Eco57I restriction endonuclease  23.76 
 
 		 665 aa  81.3  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0514  hypothetical protein  38.38 
 
 		 1108 aa  74.3  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0645  hypothetical protein  55.77 
 
 		 164 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.881182  normal  0.484596 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1588  type III restriction enzyme, res subunit  35.71 
 
 		 1094 aa  63.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1677  type III restriction protein res subunit  30.69 
 
 		 1110 aa  63.5  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  34.41 
 
 		 1002 aa  51.2  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2423  hypothetical protein  49.06 
 
 		 218 aa  47.4  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.351192  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0195  type III restriction system methylase  45.28 
 
 		 213 aa  45.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0927  type III restriction system methylase  45.28 
 
 		 213 aa  45.8  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.714922 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  28.57 
 
 		 746 aa  44.3  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2229  type III restriction system methylase  35.06 
 
 		 221 aa  43.9  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0764738  hitchhiker  0.00005113 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0544  hypothetical protein  33.72 
 
 		 1093 aa  43.5  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>