91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0544 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0544  hypothetical protein  100 
 
 		 1093 aa  2265    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1062  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1231 aa  392  1e-107  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000818904  hitchhiker  0.00000512763 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4725  hypothetical protein  25.4 
 
 		 1022 aa  154  8e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0308  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1086 aa  95.1  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  26.49 
 
 		 694 aa  64.3  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  23.33 
 
 		 1058 aa  63.2  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  30.81 
 
 		 1339 aa  61.2  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  26.88 
 
 		 504 aa  59.7  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1224  N-6 DNA methylase  35.87 
 
 		 796 aa  58.5  0.0000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.708606 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  29.8 
 
 		 489 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0324  N-6 DNA methylase  30.71 
 
 		 657 aa  57.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00528654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  20.21 
 
 		 1036 aa  57  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  29.14 
 
 		 489 aa  57  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  30.77 
 
 		 489 aa  56.2  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2889  N-6 DNA methylase  26.19 
 
 		 578 aa  56.2  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  23.99 
 
 		 1125 aa  56.2  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0217  N-6 DNA methylase  26.19 
 
 		 578 aa  56.2  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2488  putative RNA methylase  31.52 
 
 		 604 aa  55.8  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  32.38 
 
 		 1195 aa  55.8  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2863  N-6 DNA methylase  27.4 
 
 		 500 aa  55.5  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  31.93 
 
 		 673 aa  55.5  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0927  type III restriction system methylase  56.86 
 
 		 213 aa  55.5  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.714922 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2355  N-6 DNA methylase  30.33 
 
 		 1038 aa  55.5  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  21.75 
 
 		 1178 aa  55.5  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0195  type III restriction system methylase  34.75 
 
 		 213 aa  54.3  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  28.23 
 
 		 1239 aa  53.5  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  27.69 
 
 		 490 aa  53.1  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0748  type III restriction system methylase  50 
 
 		 214 aa  53.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.124073 
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  28.08 
 
 		 1002 aa  53.1  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  29.23 
 
 		 477 aa  52.8  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  31.58 
 
 		 1319 aa  52.8  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4283  hypothetical protein  30.08 
 
 		 1233 aa  52  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20220  N-6 DNA methylase  26.45 
 
 		 484 aa  52  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.644983  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3271  putative RNA methylase  30 
 
 		 479 aa  52  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11081  normal  0.0311183 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2423  hypothetical protein  33.93 
 
 		 218 aa  52  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.351192  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0353  N-6 DNA methylase  30.17 
 
 		 488 aa  51.6  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  28.08 
 
 		 493 aa  51.2  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0972  N-6 DNA methylase  34.48 
 
 		 911 aa  51.6  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.91965 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0971  putative DNA methylase  32.5 
 
 		 1222 aa  51.6  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  27.73 
 
 		 573 aa  51.2  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1310  N-6 DNA methylase  23.53 
 
 		 489 aa  50.8  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  29.01 
 
 		 489 aa  51.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  24.84 
 
 		 493 aa  50.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0823  N-6 DNA methylase  25.38 
 
 		 493 aa  50.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  32.06 
 
 		 1432 aa  50.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  29.28 
 
 		 1425 aa  50.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1235  N-6 DNA methylase  26.11 
 
 		 501 aa  50.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  29.26 
 
 		 1338 aa  49.7  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2498  type I restriction-modification system, M subunit  32.48 
 
 		 488 aa  50.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095428  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0684  type I restriction-modification system, M subunit  31.07 
 
 		 489 aa  49.7  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0833  N-6 DNA methylase  31.07 
 
 		 489 aa  49.7  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.564652 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  28.08 
 
 		 489 aa  50.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  30.19 
 
 		 595 aa  49.3  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  24.86 
 
 		 500 aa  49.3  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0121  putative DNA methylase  28.15 
 
 		 1022 aa  49.3  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2616  N-6 DNA methylase  26.67 
 
 		 492 aa  48.9  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0464512 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  26.4 
 
 		 950 aa  48.9  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3247  N-6 DNA methylase  26.55 
 
 		 748 aa  48.9  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  32.61 
 
 		 1189 aa  48.5  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  34.92 
 
 		 1282 aa  48.5  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3195  adenine specific DNA methyltransferase  31.13 
 
 		 1125 aa  48.5  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000607783  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  30.63 
 
 		 1338 aa  48.1  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  27.64 
 
 		 1209 aa  47.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  30 
 
 		 502 aa  48.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143322  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1457  type I restriction-modification system, M subunit, putative  24.75 
 
 		 684 aa  48.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  29.2 
 
 		 1322 aa  47.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  29.03 
 
 		 1426 aa  47.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0032  N-6 DNA methylase  24.29 
 
 		 544 aa  47  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.885751  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04061  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  30.68 
 
 		 703 aa  47  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4910  N-6 DNA methylase  27.03 
 
 		 584 aa  47  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.268375  normal  0.686666 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  31.33 
 
 		 405 aa  47  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0823  N-6 DNA methylase  25.4 
 
 		 768 aa  47.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0181192  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  33.03 
 
 		 1231 aa  47  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  26.76 
 
 		 1324 aa  46.2  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  26.27 
 
 		 746 aa  46.6  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  30.7 
 
 		 1373 aa  46.2  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  31.2 
 
 		 416 aa  46.2  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0898  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  22.62 
 
 		 504 aa  46.2  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000642099  hitchhiker  0.000000156294 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3984  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 676 aa  45.8  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3935  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 676 aa  45.8  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  29.2 
 
 		 510 aa  45.4  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  28.06 
 
 		 1321 aa  45.4  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0584  hypothetical protein  27.35 
 
 		 826 aa  45.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3705  hypothetical protein  30.63 
 
 		 509 aa  45.4  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.133916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3192  N-6 DNA methylase  32.65 
 
 		 605 aa  45.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3644  type I restriction enzyme R protein N terminus (HSDR_N)/N-6 DNA methylase  29.69 
 
 		 866 aa  45.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550519  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1412  type I restriction-modification system, M subunit  30.68 
 
 		 517 aa  45.1  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.446719  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2902  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  36.49 
 
 		 621 aa  45.1  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00367965 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  31.25 
 
 		 1055 aa  45.1  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  25.93 
 
 		 570 aa  45.1  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2728  putative DNA methylase  32.56 
 
 		 1208 aa  44.7  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>