292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1469 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  100 
 
 		 1002 aa  2047    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2355  N-6 DNA methylase  24.71 
 
 		 1038 aa  247  6e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0162  hypothetical protein  24.66 
 
 		 1016 aa  225  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4361  N-6 DNA methylase  23.88 
 
 		 908 aa  192  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0121  putative DNA methylase  23.54 
 
 		 1022 aa  172  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  24.38 
 
 		 746 aa  153  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  24.95 
 
 		 995 aa  91.3  8e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  21.86 
 
 		 950 aa  90.1  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  25.76 
 
 		 1058 aa  81.6  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  23.49 
 
 		 1036 aa  76.6  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1800  hypothetical protein  24.84 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0286  N4/N6-methyltransferase family protein  24.32 
 
 		 569 aa  70.5  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4240  N-6 DNA methylase  24.22 
 
 		 567 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.386659  hitchhiker  0.00142847 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1809  hypothetical protein  24.39 
 
 		 849 aa  69.3  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  28.24 
 
 		 1055 aa  69.3  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  23.47 
 
 		 1020 aa  69.3  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  29.88 
 
 		 1358 aa  69.3  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  31.97 
 
 		 846 aa  68.6  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  31.06 
 
 		 775 aa  68.2  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3380  N-6 DNA methylase  24.5 
 
 		 570 aa  68.2  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368642  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  27.54 
 
 		 1319 aa  67.8  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  26.7 
 
 		 1338 aa  67.4  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  22.27 
 
 		 834 aa  66.2  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  30.53 
 
 		 1322 aa  65.9  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4473  N-6 DNA methylase  21.96 
 
 		 567 aa  65.9  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.844286 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  23.72 
 
 		 1189 aa  65.5  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  25.34 
 
 		 477 aa  65.1  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  32.6 
 
 		 1041 aa  64.7  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  25.42 
 
 		 1331 aa  64.7  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0483  N-6 DNA methylase  22.87 
 
 		 568 aa  64.3  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283562  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1724  type I restriction-modification system, M subunit  25.48 
 
 		 494 aa  63.9  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1222  N-6 DNA methylase  23.04 
 
 		 519 aa  63.5  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1092  N-6 DNA methylase  22.44 
 
 		 505 aa  63.5  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299691  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3915  N-6 DNA methylase  21.81 
 
 		 541 aa  63.2  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1120  type I restriction-modification system specificity subunit  22.52 
 
 		 527 aa  62.8  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0032  N-6 DNA methylase  21.45 
 
 		 544 aa  62.8  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.885751  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  26.2 
 
 		 510 aa  62.4  0.00000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0898  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  24.81 
 
 		 504 aa  62.8  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000642099  hitchhiker  0.000000156294 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0224  Type I restriction-modification system, M subunit  21.45 
 
 		 519 aa  62  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  23.93 
 
 		 1219 aa  61.6  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4809  N-6 DNA methylase  26.89 
 
 		 544 aa  62  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.136314  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4006  N-6 DNA methylase  22.38 
 
 		 514 aa  62  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  28.22 
 
 		 1321 aa  61.6  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04061  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  27.81 
 
 		 703 aa  61.6  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  23.62 
 
 		 595 aa  61.6  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  25.93 
 
 		 694 aa  61.2  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1539  type I restriction-modification system, M subunit  22.56 
 
 		 500 aa  60.1  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154488  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4713  N-6 DNA methylase  26.52 
 
 		 544 aa  60.1  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0950517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4283  hypothetical protein  28.46 
 
 		 1233 aa  60.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  24.59 
 
 		 836 aa  59.7  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20400  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  24.23 
 
 		 654 aa  59.7  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0518055 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  27.12 
 
 		 489 aa  59.7  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2876  N-6 DNA methylase  26.28 
 
 		 544 aa  59.3  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1457  type I restriction-modification system, M subunit, putative  21.77 
 
 		 684 aa  58.9  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4142  N-6 DNA methylase  24.62 
 
 		 503 aa  59.3  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1436  N-6 DNA methylase  24.41 
 
 		 517 aa  58.9  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  22.91 
 
 		 481 aa  58.9  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2746  type I restriction-modification system, M subunit  25.56 
 
 		 480 aa  58.9  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.453882  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  32 
 
 		 1231 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  25.81 
 
 		 978 aa  58.9  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  23.28 
 
 		 1209 aa  58.9  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  25.42 
 
 		 489 aa  58.5  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  24.02 
 
 		 795 aa  58.5  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1086  type I restriction-modification system, M subunit  20.69 
 
 		 576 aa  58.2  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  23.75 
 
 		 1338 aa  58.2  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  20.96 
 
 		 673 aa  58.2  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  30.53 
 
 		 1195 aa  57.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0004  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  28.28 
 
 		 517 aa  57.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3006  N-6 DNA methylase  20.47 
 
 		 520 aa  57.4  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.809429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  30.51 
 
 		 1422 aa  57  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  23.96 
 
 		 871 aa  57  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1535  N-6 DNA methylase  23.19 
 
 		 486 aa  57  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2789  N-6 DNA methylase  24.32 
 
 		 532 aa  56.6  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2908  N-6 DNA methylase  20.4 
 
 		 523 aa  57  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  25.9 
 
 		 1459 aa  56.6  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3534  EcoEI R domain-containing protein  22.35 
 
 		 481 aa  56.6  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0122101  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  25.86 
 
 		 489 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2909  N4/N6-methyltransferase family protein  23.4 
 
 		 515 aa  56.2  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2498  type I restriction-modification system, M subunit  23.66 
 
 		 488 aa  55.8  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095428  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  30.71 
 
 		 405 aa  56.6  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  24.54 
 
 		 1373 aa  56.2  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2017  N-6 DNA methylase  20.99 
 
 		 517 aa  56.2  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.54323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3541  N-6 DNA methylase  21.45 
 
 		 524 aa  56.6  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  24.86 
 
 		 489 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  31.03 
 
 		 1239 aa  55.8  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0805  N-6 DNA methylase  19.92 
 
 		 484 aa  55.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.614419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0833  N-6 DNA methylase  29.61 
 
 		 489 aa  55.8  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.564652 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  29.44 
 
 		 490 aa  55.8  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3148  N-6 DNA methylase  26.6 
 
 		 540 aa  55.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0684  type I restriction-modification system, M subunit  29.61 
 
 		 489 aa  55.8  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  21.67 
 
 		 510 aa  55.5  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  22.95 
 
 		 1336 aa  55.5  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0005  type I restriction-modification system, M subunit  20 
 
 		 528 aa  55.1  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1282 aa  55.1  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1858  N-6 DNA methylase  20.76 
 
 		 540 aa  55.5  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4777  N-6 DNA methylase  21.12 
 
 		 517 aa  55.1  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.797401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1031  N-6 DNA methylase  24.66 
 
 		 477 aa  54.7  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11238  normal  0.336468 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0353  N-6 DNA methylase  23.34 
 
 		 488 aa  54.7  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0807  DNA-methyltransferase, type I restriction-modification enzyme subunit M  25 
 
 		 486 aa  54.3  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.444408  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2384  hypothetical protein  21.64 
 
 		 732 aa  54.3  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>