More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1120 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1120  type I restriction-modification system specificity subunit  100 
 
 
527 aa  1091    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1539  type I restriction-modification system, M subunit  66.73 
 
 
500 aa  705    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154488  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3148  N-6 DNA methylase  62.78 
 
 
540 aa  685    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4006  N-6 DNA methylase  80.58 
 
 
514 aa  848    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1222  N-6 DNA methylase  78.6 
 
 
519 aa  836    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2909  N4/N6-methyltransferase family protein  75.19 
 
 
515 aa  805    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2453  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  59.96 
 
 
538 aa  634  1e-180  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.53896  normal  0.845275 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3006  N-6 DNA methylase  57.45 
 
 
520 aa  619  1e-176  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.809429  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2743  type I restriction system adenine methylase  58.24 
 
 
518 aa  616  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2017  N-6 DNA methylase  58.43 
 
 
517 aa  615  1e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.54323  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2789  N-6 DNA methylase  55.45 
 
 
532 aa  611  1e-173  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  57.17 
 
 
511 aa  609  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3128  N-6 DNA methylase  58.43 
 
 
518 aa  604  1.0000000000000001e-171  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.465456  decreased coverage  0.00982418 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0019  N-6 DNA methylase  56.42 
 
 
501 aa  597  1e-169  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00151011 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0039  N-6 DNA methylase  56.42 
 
 
501 aa  596  1e-169  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2418  N-6 DNA methylase  54.49 
 
 
525 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.572428  normal  0.0719197 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2793  type I restriction-modification system, M subunit  54.49 
 
 
525 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2248  N-6 DNA methylase  53.31 
 
 
521 aa  555  1e-157  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0522014  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  51.37 
 
 
510 aa  538  9.999999999999999e-153  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  49.81 
 
 
503 aa  536  1e-151  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0005  type I restriction-modification system, M subunit  51.03 
 
 
528 aa  534  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0224  Type I restriction-modification system, M subunit  51.33 
 
 
519 aa  532  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  53.73 
 
 
497 aa  534  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  55.58 
 
 
498 aa  531  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1858  N-6 DNA methylase  49.36 
 
 
540 aa  530  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2908  N-6 DNA methylase  50.38 
 
 
523 aa  529  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2509  site-specific DNA-methyltransferase  52.28 
 
 
540 aa  525  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.642426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1086  type I restriction-modification system, M subunit  49.63 
 
 
576 aa  521  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1940  N-6 DNA methylase  48.52 
 
 
535 aa  520  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0625168  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4777  N-6 DNA methylase  50.1 
 
 
517 aa  520  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.797401  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3300  N-6 DNA methylase  52.4 
 
 
537 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000500405 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3080  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  48.91 
 
 
549 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.801077 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4240  N-6 DNA methylase  47.12 
 
 
567 aa  513  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.386659  hitchhiker  0.00142847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7556  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  50.67 
 
 
544 aa  509  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4473  N-6 DNA methylase  46.38 
 
 
567 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.844286 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0988  N-6 DNA methylase  51.34 
 
 
527 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0032  N-6 DNA methylase  47.15 
 
 
544 aa  503  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.885751  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3915  N-6 DNA methylase  47.24 
 
 
541 aa  502  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0877  putative type I restriction-modification system, M subunit  49.03 
 
 
529 aa  497  1e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1359  N-6 DNA methylase  49.13 
 
 
529 aa  498  1e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0034  N-6 DNA methylase  46.34 
 
 
544 aa  497  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3380  N-6 DNA methylase  45.49 
 
 
570 aa  495  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368642  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4931  type I restriction-modification system, M subunit  47.63 
 
 
539 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal  0.593383 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3767  N-6 DNA methylase  47.73 
 
 
564 aa  491  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12769  type I restriction/modification system DNA methylase hsdM  44.32 
 
 
540 aa  483  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0286  N4/N6-methyltransferase family protein  44.72 
 
 
569 aa  483  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1096  N-6 DNA methylase  47.38 
 
 
543 aa  476  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1102  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  46.78 
 
 
548 aa  474  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.358797  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0483  N-6 DNA methylase  45.05 
 
 
568 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283562  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1809  hypothetical protein  44.47 
 
 
849 aa  430  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0004  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  39.02 
 
 
517 aa  355  1e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2666  type I restriction-modification system specificity subunit  39.77 
 
 
508 aa  350  4e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289078  normal  0.157244 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  35.74 
 
 
510 aa  334  2e-90  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2329  N-6 DNA methylase  36.62 
 
 
538 aa  330  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1303  N-6 DNA methylase  36.97 
 
 
529 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2236  N-6 DNA methylase  36.24 
 
 
528 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1221  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  35.96 
 
 
533 aa  320  3.9999999999999996e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2365  N-6 DNA methylase  34.27 
 
 
526 aa  296  9e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.725173  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0022  N-6 DNA methylase  35.71 
 
 
495 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0030  N-6 DNA methylase  35.71 
 
 
495 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0191758 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  35.86 
 
 
495 aa  286  8e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1712  N-6 DNA methylase  35.7 
 
 
662 aa  281  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.857909  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3498  N-6 DNA methylase  38.33 
 
 
694 aa  276  7e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  34.77 
 
 
633 aa  273  6e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  35.34 
 
 
587 aa  273  6e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  34.58 
 
 
574 aa  273  7e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  34.15 
 
 
574 aa  266  7e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  35.31 
 
 
574 aa  259  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  33.33 
 
 
585 aa  256  5e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2469  N-6 DNA methylase  35.05 
 
 
772 aa  252  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  35.03 
 
 
814 aa  249  6e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  32.66 
 
 
505 aa  249  7e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  33.47 
 
 
808 aa  246  6e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0332  N-6 DNA methylase  32.44 
 
 
709 aa  246  9e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  32.44 
 
 
822 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  31.95 
 
 
523 aa  241  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  31.95 
 
 
508 aa  241  2.9999999999999997e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4352  N-6 DNA methylase  32.35 
 
 
565 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  32.68 
 
 
498 aa  233  5e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0606  type I restriction-modification system subunit M  31.03 
 
 
523 aa  232  1e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  32.04 
 
 
860 aa  231  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  30.57 
 
 
522 aa  231  2e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  31.77 
 
 
816 aa  229  8e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  30.36 
 
 
495 aa  229  9e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  31.54 
 
 
504 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  33.2 
 
 
815 aa  225  1e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  32.42 
 
 
505 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  30.74 
 
 
506 aa  224  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  31.64 
 
 
499 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0005  type I restriction-modification system, M subunit, putative  31.46 
 
 
568 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  31.78 
 
 
500 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  35.66 
 
 
498 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  29.23 
 
 
527 aa  220  5e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  30.61 
 
 
824 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  30.29 
 
 
501 aa  219  8.999999999999998e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  28.46 
 
 
494 aa  219  1e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  30.7 
 
 
526 aa  218  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  31.53 
 
 
496 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  30.93 
 
 
499 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  31.04 
 
 
873 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>