More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3519 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 694 aa  1410    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  27.22 
 
 		 504 aa  143  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  21.9 
 
 		 995 aa  96.3  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1210 aa  95.5  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5445  methyltransferase small  25.14 
 
 		 552 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1345  N-6 DNA methylase  23.86 
 
 		 554 aa  89  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  24.57 
 
 		 595 aa  87.4  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  27.31 
 
 		 1184 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  26.45 
 
 		 974 aa  85.1  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  29.49 
 
 		 1177 aa  84.3  0.000000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  26.77 
 
 		 573 aa  83.2  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  26.99 
 
 		 416 aa  80.9  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0129  N-6 DNA methylase  20.59 
 
 		 533 aa  80.1  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0268034  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  21.72 
 
 		 950 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13292  DNA methylase  22.07 
 
 		 553 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.909406  normal  0.973481 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  22.4 
 
 		 1058 aa  79.7  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0324  N-6 DNA methylase  23.93 
 
 		 657 aa  79.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00528654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  23.4 
 
 		 522 aa  77.8  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  27.96 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  25.19 
 
 		 629 aa  77.8  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  34.56 
 
 		 1257 aa  75.5  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0392  N-6 DNA methylase  19.92 
 
 		 967 aa  75.9  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  24.47 
 
 		 557 aa  75.1  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  31.3 
 
 		 1209 aa  74.3  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  34.56 
 
 		 1244 aa  73.6  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  30.08 
 
 		 1120 aa  72.8  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  23.19 
 
 		 527 aa  71.6  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1036 aa  71.6  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1243  hypothetical protein  22.08 
 
 		 534 aa  71.6  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2480  N-6 DNA methylase  25.34 
 
 		 587 aa  71.2  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255725  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  25.42 
 
 		 518 aa  70.9  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1609  hypothetical protein  23.38 
 
 		 521 aa  70.1  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.160321  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2746  type I restriction-modification system, M subunit  23.18 
 
 		 480 aa  69.3  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.453882  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1201  N-6 DNA methylase  23.61 
 
 		 499 aa  69.7  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721125  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20400  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  20.99 
 
 		 654 aa  69.7  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0518055 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  29.89 
 
 		 522 aa  69.7  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  24.04 
 
 		 510 aa  69.3  0.0000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1545  type I restriction-modification system, M subunit  22.25 
 
 		 522 aa  68.9  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.648114  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  21.03 
 
 		 1132 aa  68.2  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1195  type II restriction-modification enzyme  23.1 
 
 		 1343 aa  68.6  0.0000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3772  N-6 DNA methylase  23.36 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3845  N-6 DNA methylase  23.36 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  29.06 
 
 		 1159 aa  68.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  29.19 
 
 		 527 aa  68.2  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4293  hypothetical protein  25 
 
 		 539 aa  67.8  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2413  N-6 DNA methylase  23.64 
 
 		 494 aa  67.8  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.228533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1235  N-6 DNA methylase  29.61 
 
 		 501 aa  67.4  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0877  putative type I restriction-modification system, M subunit  24.04 
 
 		 529 aa  67  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  27.91 
 
 		 504 aa  67  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  19.57 
 
 		 523 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  24.25 
 
 		 1125 aa  66.6  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3080  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  37.61 
 
 		 549 aa  65.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.801077 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  27.92 
 
 		 562 aa  66.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0079  type I restriction-modification system, M subunit  21.78 
 
 		 520 aa  66.2  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  22.46 
 
 		 500 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3652  N-6 DNA methylase  21.77 
 
 		 489 aa  65.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.729594 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0901  N-6 DNA methylase  23.55 
 
 		 478 aa  65.1  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2008  Sec-independent protein translocase protein TatC  23.05 
 
 		 489 aa  64.7  0.000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4352  N-6 DNA methylase  29.61 
 
 		 565 aa  64.7  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  23.53 
 
 		 493 aa  64.7  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  27.44 
 
 		 505 aa  64.3  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  27.49 
 
 		 505 aa  64.3  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0084  N-6 DNA methylase  22.4 
 
 		 495 aa  64.3  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0544  hypothetical protein  26.49 
 
 		 1093 aa  63.9  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  29.27 
 
 		 493 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  22.88 
 
 		 477 aa  62.4  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4361  N-6 DNA methylase  25.35 
 
 		 908 aa  62.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2995  N-6 DNA methylase  25.18 
 
 		 707 aa  62.4  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00439445  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1748  putative DNA methylase  23.04 
 
 		 928 aa  62.4  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.431397 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0332  N-6 DNA methylase  28.5 
 
 		 709 aa  62  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2550  type I restriction-modification system, M subunit  27.71 
 
 		 527 aa  62.4  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.19461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3247  N-6 DNA methylase  25.22 
 
 		 748 aa  62.4  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0466  type I restriction-modification system, M subunit  23.55 
 
 		 518 aa  62  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0759  hypothetical protein  22.51 
 
 		 912 aa  61.6  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.231322  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0454  type I restriction-modification system, M subunit  23.55 
 
 		 518 aa  62  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2253  type I restriction-modification system, M subunit  24.75 
 
 		 523 aa  62  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  23.91 
 
 		 489 aa  62  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1895  type I restriction-modification system, M subunit  23.24 
 
 		 518 aa  61.2  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646372  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  22.41 
 
 		 489 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1860  type I restriction-modification system, M subunit  23.24 
 
 		 518 aa  61.2  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.876278  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  30.71 
 
 		 1432 aa  61.6  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1104  type I restriction-modification system, M subunit  24.72 
 
 		 519 aa  61.6  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  25.93 
 
 		 1002 aa  61.2  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  31.86 
 
 		 1338 aa  61.2  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3954  type I restriction-modification system, M subunit  24.09 
 
 		 525 aa  61.2  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0267  putative modification methyltransferase  26.43 
 
 		 524 aa  61.2  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0217  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 578 aa  61.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  22.08 
 
 		 673 aa  60.8  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1425 aa  60.8  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  25.86 
 
 		 871 aa  60.8  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2889  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 578 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3517  N-6 DNA methylase  20.07 
 
 		 486 aa  60.8  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0261  type II restriction enzyme, methylase subunit  21.53 
 
 		 909 aa  60.8  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.504808  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  26.29 
 
 		 526 aa  60.5  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2421  type I restriction-modification system, M subunit  23.81 
 
 		 526 aa  60.5  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.636498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  24.1 
 
 		 1189 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1359  N-6 DNA methylase  24.32 
 
 		 529 aa  60.5  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  26.19 
 
 		 1299 aa  60.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0512  type I restriction modification system M subunit (site-specific DNA-methyltransferase subunit)  23.15 
 
 		 489 aa  60.1  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1224  N-6 DNA methylase  32.05 
 
 		 796 aa  60.1  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.708606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>