79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0267 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0267  putative modification methyltransferase  100 
 
 		 524 aa  1061    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13292  DNA methylase  27.26 
 
 		 553 aa  212  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.909406  normal  0.973481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1345  N-6 DNA methylase  24.48 
 
 		 554 aa  171  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5445  methyltransferase small  23.67 
 
 		 552 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2209  DNA methylase (modification methylase) (methyltransferase)  28.65 
 
 		 415 aa  160  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000172069  normal  0.0419277 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4383  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  23.32 
 
 		 489 aa  156  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5430  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  22.93 
 
 		 527 aa  155  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0129  N-6 DNA methylase  24.52 
 
 		 533 aa  116  7.999999999999999e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0268034  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1609  hypothetical protein  24.47 
 
 		 521 aa  110  6e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.160321  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  26.42 
 
 		 523 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  22.76 
 
 		 522 aa  87  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4045  hypothetical protein  19.75 
 
 		 495 aa  84  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539039  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1243  hypothetical protein  22.31 
 
 		 534 aa  77.4  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4293  hypothetical protein  20.08 
 
 		 539 aa  76.6  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  29.23 
 
 		 527 aa  69.7  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  23.18 
 
 		 466 aa  69.3  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  27.16 
 
 		 974 aa  68.6  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  26.13 
 
 		 423 aa  67  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  28.49 
 
 		 389 aa  66.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  19.17 
 
 		 629 aa  62.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  26.43 
 
 		 694 aa  60.8  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  24.26 
 
 		 673 aa  60.8  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0459  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  19.14 
 
 		 579 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.307013 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  27.51 
 
 		 1612 aa  57.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  23.08 
 
 		 478 aa  56.6  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  27.72 
 
 		 1159 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0217  N-6 DNA methylase  22.45 
 
 		 578 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2889  N-6 DNA methylase  22.45 
 
 		 578 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  25.25 
 
 		 995 aa  54.7  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1426 aa  53.5  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  23.61 
 
 		 1036 aa  52.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  23.29 
 
 		 1076 aa  51.6  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  19.72 
 
 		 1184 aa  50.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1062  hypothetical protein  21.88 
 
 		 1231 aa  50.8  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000818904  hitchhiker  0.00000512763 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  25.65 
 
 		 1194 aa  50.4  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  21.63 
 
 		 493 aa  50.4  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  26.47 
 
 		 1178 aa  49.7  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0004  type II DNA modification methyltransferase  25.34 
 
 		 570 aa  49.7  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.606152  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  23.63 
 
 		 595 aa  50.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  23.31 
 
 		 1244 aa  49.7  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  27.4 
 
 		 1186 aa  48.9  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  29.66 
 
 		 1177 aa  48.9  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3090  site-specific DNA-methyltransferase  22.69 
 
 		 527 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  23.74 
 
 		 810 aa  48.5  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1209 aa  48.1  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0309  hypothetical protein  23.15 
 
 		 691 aa  47.8  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  29.6 
 
 		 416 aa  47.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  24.88 
 
 		 1132 aa  47.4  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  28.16 
 
 		 405 aa  47.4  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  28.43 
 
 		 1120 aa  47  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  22.46 
 
 		 573 aa  47  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  21.15 
 
 		 1338 aa  46.6  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2478  N-6 DNA methylase  26.67 
 
 		 881 aa  46.6  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  27.73 
 
 		 836 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  28.97 
 
 		 1252 aa  45.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  38.38 
 
 		 660 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  19.74 
 
 		 1210 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  24.24 
 
 		 950 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  26.72 
 
 		 1218 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  25.2 
 
 		 1104 aa  45.4  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2488  putative RNA methylase  25.38 
 
 		 604 aa  45.1  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  21.21 
 
 		 730 aa  45.1  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  28.3 
 
 		 569 aa  45.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2592  hypothetical protein  24.68 
 
 		 494 aa  45.1  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  22.78 
 
 		 1183 aa  45.1  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  29.41 
 
 		 557 aa  45.4  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  22.37 
 
 		 404 aa  45.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  23.81 
 
 		 1125 aa  44.7  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  21.2 
 
 		 562 aa  44.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  25.97 
 
 		 1257 aa  44.3  0.006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  28.77 
 
 		 235 aa  43.9  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2914  N-6 DNA methylase  23.66 
 
 		 494 aa  43.9  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170964  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2496  hypothetical protein  24.12 
 
 		 488 aa  43.9  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  22.22 
 
 		 1432 aa  43.9  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3075  DEAD-like helicase  21.24 
 
 		 1328 aa  43.9  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  25.11 
 
 		 1154 aa  43.9  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  20.97 
 
 		 557 aa  43.9  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0222  hypothetical protein  29.13 
 
 		 451 aa  43.5  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.791587 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4877  hypothetical protein  19.12 
 
 		 481 aa  43.5  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>