138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1273 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  100 
 
 		 1125 aa  2284    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  27.68 
 
 		 1241 aa  284  6.000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  29.93 
 
 		 1144 aa  276  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  26.92 
 
 		 1180 aa  268  4e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  27.65 
 
 		 1160 aa  255  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  24.98 
 
 		 1171 aa  254  5.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  24.65 
 
 		 1219 aa  249  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  24.7 
 
 		 1182 aa  239  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  27.43 
 
 		 1167 aa  239  3e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  24.93 
 
 		 1205 aa  235  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  27.57 
 
 		 1183 aa  235  4.0000000000000004e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0997  hypothetical protein  27.52 
 
 		 706 aa  231  6e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3731  hypothetical protein  27.84 
 
 		 1174 aa  230  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  25.92 
 
 		 1162 aa  227  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  25.92 
 
 		 1140 aa  213  2e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  26.18 
 
 		 1131 aa  199  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  27.53 
 
 		 1218 aa  198  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  25.61 
 
 		 1430 aa  191  5.999999999999999e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2107  hypothetical protein  28.6 
 
 		 1270 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  25.41 
 
 		 1359 aa  167  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  30.45 
 
 		 612 aa  161  6e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  23.5 
 
 		 1324 aa  155  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  22.58 
 
 		 1425 aa  140  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0583  hypothetical protein  22.27 
 
 		 882 aa  131  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  22.88 
 
 		 1497 aa  115  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1326  hypothetical protein  23.74 
 
 		 1141 aa  111  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770705  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1235  hypothetical protein  22.24 
 
 		 1484 aa  111  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  29.26 
 
 		 995 aa  108  7e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  27.27 
 
 		 1058 aa  103  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  27.91 
 
 		 1132 aa  100  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0994  hypothetical protein  33.85 
 
 		 309 aa  97.8  9e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1124  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1326 aa  97.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  25.15 
 
 		 950 aa  95.5  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2241  hypothetical protein  23.67 
 
 		 731 aa  88.6  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2756  hypothetical protein  19.56 
 
 		 1162 aa  85.5  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.110579 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1132  hypothetical protein  22.86 
 
 		 1174 aa  84.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00035988 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  24.87 
 
 		 1036 aa  83.6  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  26.07 
 
 		 836 aa  82.8  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1081  hypothetical protein  20.76 
 
 		 1107 aa  82.4  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1819  hypothetical protein  22.2 
 
 		 1154 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0470618 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  26.41 
 
 		 1120 aa  79.7  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  25.9 
 
 		 1178 aa  79.7  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1709  hypothetical protein  21.76 
 
 		 1154 aa  78.6  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.18586  normal  0.0585819 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3233  hypothetical protein  18.94 
 
 		 1129 aa  77  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  24 
 
 		 795 aa  77  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  25.95 
 
 		 1076 aa  76.3  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  23.46 
 
 		 1020 aa  75.9  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  26.54 
 
 		 1195 aa  71.6  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  23.47 
 
 		 1209 aa  71.2  0.00000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  24.1 
 
 		 1170 aa  70.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  36.49 
 
 		 974 aa  67.8  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  26.11 
 
 		 1177 aa  66.6  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  24.25 
 
 		 694 aa  66.6  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  24 
 
 		 416 aa  66.6  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  25.28 
 
 		 1039 aa  66.6  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  25.5 
 
 		 1041 aa  63.9  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  25.33 
 
 		 1189 aa  63.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  24.89 
 
 		 1239 aa  62.8  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  23.27 
 
 		 792 aa  62  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  20.78 
 
 		 652 aa  61.6  0.00000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  21.56 
 
 		 1426 aa  60.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2889  N-6 DNA methylase  23.21 
 
 		 578 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0217  N-6 DNA methylase  23.21 
 
 		 578 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  34.25 
 
 		 1089 aa  60.1  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2914  N-6 DNA methylase  23.7 
 
 		 494 aa  59.7  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170964  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  34.21 
 
 		 1612 aa  58.5  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  23.97 
 
 		 404 aa  57  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3191  hypothetical protein  28.07 
 
 		 288 aa  57  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0544  hypothetical protein  23.99 
 
 		 1093 aa  56.2  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  27.86 
 
 		 410 aa  56.2  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  28.87 
 
 		 1432 aa  56.6  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4361  N-6 DNA methylase  21.64 
 
 		 908 aa  56.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  24.72 
 
 		 1282 aa  55.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  34.59 
 
 		 1104 aa  55.8  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4910  N-6 DNA methylase  23.43 
 
 		 584 aa  55.8  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.268375  normal  0.686666 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  26.18 
 
 		 1231 aa  55.1  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0971  putative DNA methylase  22.1 
 
 		 1222 aa  54.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  29.84 
 
 		 1159 aa  54.3  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  25.37 
 
 		 1319 aa  53.5  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1564  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.26 
 
 		 1134 aa  53.9  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1062  hypothetical protein  31.03 
 
 		 1231 aa  53.9  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000818904  hitchhiker  0.00000512763 
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  24.34 
 
 		 1002 aa  52.8  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  21.46 
 
 		 1154 aa  53.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  22.93 
 
 		 573 aa  52.4  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2592  hypothetical protein  22.57 
 
 		 494 aa  52.4  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  23.87 
 
 		 570 aa  51.6  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  27.81 
 
 		 405 aa  51.6  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0991  hypothetical protein  35.16 
 
 		 300 aa  51.2  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  28.83 
 
 		 1194 aa  50.8  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  23.15 
 
 		 595 aa  51.2  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  26.72 
 
 		 629 aa  50.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  40.3 
 
 		 929 aa  49.7  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2250  hypothetical protein  31.07 
 
 		 929 aa  49.3  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5513  hypothetical protein  31.07 
 
 		 934 aa  49.3  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.032293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  26.53 
 
 		 1184 aa  48.9  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0392  N-6 DNA methylase  23.13 
 
 		 967 aa  48.9  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2728  putative DNA methylase  21.41 
 
 		 1208 aa  48.9  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  24.62 
 
 		 423 aa  48.9  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0823  N-6 DNA methylase  22.3 
 
 		 768 aa  48.5  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0181192  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1501  N-6 DNA methylase  22.09 
 
 		 513 aa  48.5  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>