59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2914 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2914  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 494 aa  1008    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170964  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2592  hypothetical protein  96.76 
 
 		 494 aa  977    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  22.05 
 
 		 950 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  23.7 
 
 		 1125 aa  59.7  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13292  DNA methylase  23.97 
 
 		 553 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.909406  normal  0.973481 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  24.11 
 
 		 489 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1535  N-6 DNA methylase  30.63 
 
 		 486 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3570  N-6 DNA methylase  29.91 
 
 		 484 aa  54.7  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.054861  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  28.38 
 
 		 404 aa  54.3  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  20.34 
 
 		 493 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  22.22 
 
 		 500 aa  53.5  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  27.68 
 
 		 489 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  22.72 
 
 		 673 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  22.37 
 
 		 493 aa  53.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3271  putative RNA methylase  22.91 
 
 		 479 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11081  normal  0.0311183 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1634  N-6 DNA methylase  29.46 
 
 		 495 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0807  DNA-methyltransferase, type I restriction-modification enzyme subunit M  26.19 
 
 		 486 aa  51.6  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.444408  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0960  N-6 DNA methylase  24.67 
 
 		 670 aa  51.2  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 489 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  26.24 
 
 		 489 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2534  hypothetical protein  22.97 
 
 		 563 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1577  type I restriction-modification system, M subunit  29.73 
 
 		 484 aa  50.4  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2651  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  29.73 
 
 		 484 aa  50.1  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0553747  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  24.04 
 
 		 1241 aa  49.7  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0228  N-6 DNA methylase  29.73 
 
 		 484 aa  49.3  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  19.75 
 
 		 1324 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  26.06 
 
 		 490 aa  48.9  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  23.89 
 
 		 489 aa  48.5  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1235  N-6 DNA methylase  21.16 
 
 		 501 aa  47.8  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0823  N-6 DNA methylase  25.89 
 
 		 493 aa  47.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1430 aa  47.4  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20220  N-6 DNA methylase  26.61 
 
 		 484 aa  47  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.644983  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  30.65 
 
 		 410 aa  47  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  19.82 
 
 		 505 aa  47  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  22.45 
 
 		 502 aa  47  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143322  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0833  N-6 DNA methylase  25.56 
 
 		 489 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.564652 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0684  type I restriction-modification system, M subunit  25.56 
 
 		 489 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  21.15 
 
 		 573 aa  46.2  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4253  N-6 DNA methylase  24.64 
 
 		 708 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  20.73 
 
 		 1218 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  23.79 
 
 		 405 aa  45.8  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  21.39 
 
 		 523 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4910  N-6 DNA methylase  22.43 
 
 		 584 aa  45.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.268375  normal  0.686666 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0613  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.5 
 
 		 484 aa  45.1  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2746  type I restriction-modification system, M subunit  26.09 
 
 		 480 aa  44.3  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.453882  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3652  N-6 DNA methylase  24.32 
 
 		 489 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.729594 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2863  N-6 DNA methylase  21.65 
 
 		 500 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0330  DNA methylase family protein  27.73 
 
 		 402 aa  44.7  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00332873  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4142  N-6 DNA methylase  23.45 
 
 		 503 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0583  hypothetical protein  32.97 
 
 		 882 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  22.43 
 
 		 873 aa  43.9  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1282  N-6 DNA methylase  23.68 
 
 		 481 aa  43.9  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1096  N-6 DNA methylase  23.36 
 
 		 486 aa  43.9  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  22.49 
 
 		 810 aa  43.9  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0267  putative modification methyltransferase  23.66 
 
 		 524 aa  43.9  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  22.66 
 
 		 815 aa  43.5  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0369  type I restriction-modification system, M subunit  22.27 
 
 		 871 aa  43.5  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2496  hypothetical protein  24.63 
 
 		 488 aa  43.1  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1992  N-6 DNA methylase  22.32 
 
 		 479 aa  43.5  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0409108  normal  0.188366 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>