64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0583 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0583  hypothetical protein  100 
 
 		 882 aa  1793    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  23.35 
 
 		 1183 aa  143  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  22.27 
 
 		 1182 aa  137  7.000000000000001e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  24.14 
 
 		 1219 aa  132  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  22.27 
 
 		 1125 aa  131  6e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  21.13 
 
 		 1140 aa  122  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  22.62 
 
 		 1131 aa  120  9e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2107  hypothetical protein  23.06 
 
 		 1270 aa  118  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  21 
 
 		 1171 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  25.41 
 
 		 1205 aa  112  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  20.73 
 
 		 1167 aa  108  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1241 aa  106  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  24.37 
 
 		 1180 aa  100  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3731  hypothetical protein  23.16 
 
 		 1174 aa  97.8  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0997  hypothetical protein  24.41 
 
 		 706 aa  97.4  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  23.45 
 
 		 1160 aa  94  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1359 aa  89.4  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  23.36 
 
 		 1162 aa  84  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  23.51 
 
 		 1144 aa  78.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1124  hypothetical protein  27.6 
 
 		 1326 aa  77  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1326  hypothetical protein  23.47 
 
 		 1141 aa  71.2  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770705  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  34.04 
 
 		 1218 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  20.62 
 
 		 1497 aa  66.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  32.23 
 
 		 1425 aa  65.9  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  23.91 
 
 		 950 aa  65.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2756  hypothetical protein  23.7 
 
 		 1162 aa  65.1  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.110579 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1132  hypothetical protein  21.76 
 
 		 1174 aa  64.7  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00035988 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1819  hypothetical protein  26.88 
 
 		 1154 aa  62.8  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0470618 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1709  hypothetical protein  22.64 
 
 		 1154 aa  60.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.18586  normal  0.0585819 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  31.87 
 
 		 612 aa  60.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2241  hypothetical protein  21.94 
 
 		 731 aa  60.1  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  22.14 
 
 		 1058 aa  60.1  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4713  N-6 DNA methylase  23.49 
 
 		 544 aa  58.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0950517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  20.22 
 
 		 1324 aa  58.2  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  21.56 
 
 		 995 aa  58.5  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4809  N-6 DNA methylase  23.17 
 
 		 544 aa  58.5  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.136314  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3233  hypothetical protein  21.89 
 
 		 1129 aa  57.8  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  23.58 
 
 		 416 aa  55.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2876  N-6 DNA methylase  23.23 
 
 		 544 aa  55.5  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1081  hypothetical protein  24.64 
 
 		 1107 aa  55.1  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2095  N-6 DNA methylase  22.84 
 
 		 506 aa  53.5  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.866989  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1235  hypothetical protein  19.34 
 
 		 1484 aa  52.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0805  N-6 DNA methylase  24.31 
 
 		 484 aa  52.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.614419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1059  N-6 DNA methylase  22.26 
 
 		 516 aa  51.2  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3181  N-6 DNA methylase  22.98 
 
 		 512 aa  51.2  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1577  type I restriction-modification system, M subunit  28.79 
 
 		 484 aa  50.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2651  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  28 
 
 		 484 aa  50.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0553747  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0228  N-6 DNA methylase  28.79 
 
 		 484 aa  50.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1092  N-6 DNA methylase  21.92 
 
 		 505 aa  48.1  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299691  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1501  N-6 DNA methylase  22.93 
 
 		 513 aa  48.5  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  19.07 
 
 		 1430 aa  48.1  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0725  type III restriction protein res subunit  26.95 
 
 		 1005 aa  48.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147192 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3570  N-6 DNA methylase  27.33 
 
 		 484 aa  47.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.054861  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1535  N-6 DNA methylase  27.41 
 
 		 486 aa  46.2  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3541  N-6 DNA methylase  28.4 
 
 		 524 aa  46.2  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  22.96 
 
 		 775 aa  46.2  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  21.89 
 
 		 1041 aa  45.4  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0898  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  23.73 
 
 		 504 aa  45.4  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000642099  hitchhiker  0.000000156294 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2087  N-6 DNA methylase  27.89 
 
 		 509 aa  45.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122296 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  20.38 
 
 		 1020 aa  45.1  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1724  type I restriction-modification system, M subunit  28.68 
 
 		 494 aa  44.7  0.007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  21.51 
 
 		 1036 aa  44.7  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2914  N-6 DNA methylase  32.97 
 
 		 494 aa  44.3  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170964  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1026  N-6 DNA methylase  21.65 
 
 		 549 aa  44.3  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>