58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1326 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1709  hypothetical protein  49.7 
 
 		 1154 aa  1045    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.18586  normal  0.0585819 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2241  hypothetical protein  48.92 
 
 		 731 aa  641    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1326  hypothetical protein  100 
 
 		 1141 aa  2355    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770705  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3233  hypothetical protein  45.99 
 
 		 1129 aa  960    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1819  hypothetical protein  49.74 
 
 		 1154 aa  1056    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0470618 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1132  hypothetical protein  51.16 
 
 		 1174 aa  1099    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00035988 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1081  hypothetical protein  50 
 
 		 1107 aa  1063    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2756  hypothetical protein  53.29 
 
 		 1162 aa  1222    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.110579 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2238  hypothetical protein  50.49 
 
 		 389 aa  388  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0102712 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  27.16 
 
 		 1183 aa  169  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  26.67 
 
 		 1160 aa  163  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  27.71 
 
 		 1180 aa  162  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  27.09 
 
 		 1167 aa  160  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  27.68 
 
 		 1171 aa  159  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  26.11 
 
 		 1425 aa  157  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  26.08 
 
 		 1144 aa  155  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  26.07 
 
 		 1219 aa  154  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  28.95 
 
 		 1182 aa  152  4e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  26.86 
 
 		 1205 aa  151  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  28.05 
 
 		 612 aa  147  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  27.67 
 
 		 1162 aa  147  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1324 aa  146  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  30.75 
 
 		 1140 aa  142  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3731  hypothetical protein  29.14 
 
 		 1174 aa  142  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1235  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1484 aa  141  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  26.66 
 
 		 1131 aa  140  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  26.35 
 
 		 1497 aa  135  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2107  hypothetical protein  26.23 
 
 		 1270 aa  127  9e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  22.22 
 
 		 1241 aa  125  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  26.52 
 
 		 1218 aa  120  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  23.02 
 
 		 1430 aa  114  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  23.74 
 
 		 1125 aa  111  6e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  22.7 
 
 		 1359 aa  102  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0583  hypothetical protein  23.47 
 
 		 882 aa  71.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1124  hypothetical protein  29.75 
 
 		 1326 aa  63.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0997  hypothetical protein  27.19 
 
 		 706 aa  57.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  26.01 
 
 		 1231 aa  57.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  23.05 
 
 		 1058 aa  57.8  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0994  hypothetical protein  22.35 
 
 		 309 aa  56.2  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  31.29 
 
 		 746 aa  55.1  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  42.86 
 
 		 974 aa  53.5  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  37.88 
 
 		 1002 aa  52.4  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  22.22 
 
 		 1178 aa  51.6  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  24.42 
 
 		 1041 aa  51.2  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  34.29 
 
 		 1239 aa  48.9  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  31.51 
 
 		 929 aa  48.5  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  36.49 
 
 		 1339 aa  47.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  33.77 
 
 		 1338 aa  46.6  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  29.2 
 
 		 918 aa  45.8  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  26.67 
 
 		 869 aa  46.2  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  33.82 
 
 		 1319 aa  45.8  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  33.01 
 
 		 836 aa  45.8  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  40.32 
 
 		 973 aa  45.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  32.38 
 
 		 795 aa  45.4  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4361  N-6 DNA methylase  33.96 
 
 		 908 aa  45.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  34.29 
 
 		 1358 aa  45.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  22.75 
 
 		 527 aa  45.1  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  34.62 
 
 		 1104 aa  44.7  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>