84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3225 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  41.25 
 
 		 1151 aa  647    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  42.84 
 
 		 1184 aa  665    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  47.97 
 
 		 1018 aa  663    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  47.88 
 
 		 1188 aa  783    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  42.47 
 
 		 1154 aa  652    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  42.76 
 
 		 1173 aa  687    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  100 
 
 		 869 aa  1776    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  42.13 
 
 		 1170 aa  655    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  46.33 
 
 		 1186 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  30.5 
 
 		 918 aa  305  3.0000000000000004e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  30.05 
 
 		 925 aa  300  1e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1426  RNA-binding region RNP-1  36.02 
 
 		 430 aa  260  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  28.5 
 
 		 973 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  24.11 
 
 		 978 aa  175  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2902  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  31.71 
 
 		 621 aa  164  9e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00367965 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  26.15 
 
 		 1363 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  25.51 
 
 		 1346 aa  128  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  26.87 
 
 		 1409 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  25.59 
 
 		 1366 aa  122  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  25.08 
 
 		 1440 aa  120  9e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  23.48 
 
 		 1282 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  25.91 
 
 		 1353 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  23.32 
 
 		 871 aa  114  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1365 aa  114  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  25.69 
 
 		 1347 aa  114  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  25.6 
 
 		 1347 aa  112  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1290 aa  110  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1465  hypothetical protein  22.25 
 
 		 914 aa  109  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152551  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0176  type II restriction enzyme methylase subunits- like protein  26.49 
 
 		 919 aa  108  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1309  methylase  23.27 
 
 		 933 aa  108  6e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00329115  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1321 aa  106  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1744  DNA methyltransferase  23.66 
 
 		 909 aa  106  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000656447  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  24.21 
 
 		 1342 aa  105  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5634  methylase  22.65 
 
 		 937 aa  101  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  26.69 
 
 		 1461 aa  99.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2899  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  33.33 
 
 		 333 aa  99.8  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0231414 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0759  hypothetical protein  21.82 
 
 		 912 aa  99  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.231322  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  23.75 
 
 		 1441 aa  99  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0416  hypothetical protein  23.44 
 
 		 536 aa  98.2  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  22.72 
 
 		 908 aa  96.7  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2607  methylase  25 
 
 		 928 aa  94  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483035  decreased coverage  0.00951903 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  24.78 
 
 		 929 aa  91.3  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5513  hypothetical protein  26.04 
 
 		 934 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.032293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4502  hypothetical protein  22.82 
 
 		 955 aa  90.1  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.264892 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2393  Type II restriction enzyme methylase subunits-like protein  23.48 
 
 		 934 aa  88.2  6e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.233566  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  23.94 
 
 		 1339 aa  85.9  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  23.94 
 
 		 1339 aa  85.9  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2250  hypothetical protein  26.17 
 
 		 929 aa  85.9  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  25.04 
 
 		 1452 aa  82.4  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1748  putative DNA methylase  22.47 
 
 		 928 aa  82.4  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.431397 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0028  hypothetical protein  26.25 
 
 		 916 aa  82.4  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  24.7 
 
 		 1243 aa  81.3  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15580  Type II restriction enzyme, methylase subunit  22.17 
 
 		 926 aa  78.2  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000708191  unclonable  6.0148299999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1962  type II restriction enzyme, methylase subunit  24.54 
 
 		 918 aa  75.5  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0531091  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1287  putative DNA methylase  25 
 
 		 932 aa  75.1  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000167364 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0261  type II restriction enzyme, methylase subunit  34.23 
 
 		 909 aa  73.2  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.504808  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2530  putative DNA methylase  24.28 
 
 		 928 aa  71.2  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0253553  hitchhiker  0.000494571 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5334  type II restriction enzyme methylase subunit  23.78 
 
 		 926 aa  71.2  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4499  putative DNA methylase  31.53 
 
 		 921 aa  70.9  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154819  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2201  hypothetical protein  21.55 
 
 		 512 aa  69.3  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00286901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4906  hypothetical protein  24.42 
 
 		 941 aa  61.2  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  30.09 
 
 		 1041 aa  55.8  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  28.21 
 
 		 1432 aa  55.5  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  30.34 
 
 		 1338 aa  54.7  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  35.29 
 
 		 1359 aa  51.6  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  25.95 
 
 		 974 aa  51.6  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  27.37 
 
 		 1298 aa  50.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  27.89 
 
 		 1339 aa  50.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2741  hypothetical protein  37.84 
 
 		 118 aa  49.3  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  31.25 
 
 		 1712 aa  49.3  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  28.02 
 
 		 1184 aa  48.9  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  27.27 
 
 		 1322 aa  48.5  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  27.04 
 
 		 1332 aa  47.8  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  30.07 
 
 		 1373 aa  48.1  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  29.08 
 
 		 1422 aa  47.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  25.82 
 
 		 1319 aa  47  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  25.97 
 
 		 838 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  35.37 
 
 		 1425 aa  45.8  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1326  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1141 aa  46.2  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770705  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  25.4 
 
 		 1343 aa  45.8  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4725  hypothetical protein  25.47 
 
 		 1022 aa  45.1  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1039 aa  44.7  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  22.79 
 
 		 1426 aa  44.7  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  27.71 
 
 		 1333 aa  44.3  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>