209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2649 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  45.01 
 
 
1336 aa  802    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  44.25 
 
 
1339 aa  793    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  39.6 
 
 
1322 aa  657    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  39.91 
 
 
1321 aa  698    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  44.66 
 
 
1333 aa  825    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  38.09 
 
 
1358 aa  646    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  41.26 
 
 
1355 aa  756    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  40.68 
 
 
1318 aa  660    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  41.26 
 
 
1306 aa  709    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  100 
 
 
1712 aa  3522    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  40.27 
 
 
1354 aa  701    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  36.41 
 
 
1343 aa  637    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  42.09 
 
 
1338 aa  763    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  45.26 
 
 
1373 aa  800    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  47.41 
 
 
1422 aa  912    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  41.02 
 
 
1331 aa  634  1e-180  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  40.08 
 
 
1319 aa  600  1e-170  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  42.2 
 
 
1219 aa  592  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  39.39 
 
 
1338 aa  593  1e-167  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  37.2 
 
 
1459 aa  587  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  38.04 
 
 
1322 aa  582  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  40 
 
 
1282 aa  527  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  38.54 
 
 
1290 aa  513  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  37.01 
 
 
1243 aa  516  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  39.86 
 
 
1055 aa  491  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1308  putative type II DNA modification enzyme  30.78 
 
 
1442 aa  309  3e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.102171 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  26.66 
 
 
1375 aa  204  9e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  26.75 
 
 
1022 aa  202  3.9999999999999996e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0744  hypothetical protein  27.33 
 
 
1709 aa  201  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  27.47 
 
 
1581 aa  199  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6769  hypothetical protein  27.94 
 
 
1349 aa  193  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  25.72 
 
 
1432 aa  192  5.999999999999999e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  22.82 
 
 
1250 aa  191  9e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  22.93 
 
 
1250 aa  190  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  21.97 
 
 
1277 aa  183  2.9999999999999997e-44  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  26.78 
 
 
1332 aa  179  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  25.55 
 
 
1098 aa  176  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  23.14 
 
 
1278 aa  166  3e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  24.13 
 
 
1612 aa  155  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  30.86 
 
 
926 aa  144  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  28.47 
 
 
1426 aa  143  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  24.4 
 
 
1342 aa  137  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  26.26 
 
 
1321 aa  136  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  30.77 
 
 
1441 aa  134  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  31.2 
 
 
1339 aa  130  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  31.2 
 
 
1339 aa  130  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4895  type II restriction enzyme, methylase subunit  26.83 
 
 
1640 aa  127  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  29.64 
 
 
1461 aa  127  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3884  hypothetical protein  27.03 
 
 
1642 aa  126  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4829  hypothetical protein  27.07 
 
 
1640 aa  127  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3742  hypothetical protein  28.06 
 
 
1575 aa  126  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  29.15 
 
 
1363 aa  126  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3087  hypothetical protein  27.91 
 
 
1572 aa  125  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0122082 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  25.68 
 
 
1353 aa  125  8e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5809  hypothetical protein  26.87 
 
 
1644 aa  124  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  27.64 
 
 
1452 aa  122  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  29.91 
 
 
1347 aa  121  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  26.46 
 
 
1440 aa  120  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  29.1 
 
 
1366 aa  119  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  28.47 
 
 
1409 aa  117  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  25.75 
 
 
1347 aa  115  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  24.58 
 
 
1346 aa  112  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  28.65 
 
 
1365 aa  108  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35210  hypothetical protein  28.02 
 
 
1546 aa  107  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  34.59 
 
 
846 aa  105  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1417  hypothetical protein  28.05 
 
 
1557 aa  105  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0353  type II restriction enzyme, methylase subunit  26.07 
 
 
1573 aa  104  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1354  hypothetical protein  25.49 
 
 
1579 aa  104  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  36.54 
 
 
1279 aa  101  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  24.48 
 
 
1751 aa  100  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5421  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  26.61 
 
 
1581 aa  99  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.689282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0584  hypothetical protein  30.57 
 
 
826 aa  95.9  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1959  hypothetical protein  45.45 
 
 
121 aa  95.9  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00461889  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  29.47 
 
 
1298 aa  93.2  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3917  hypothetical protein  41.12 
 
 
154 aa  87.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0131192 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  24.22 
 
 
1257 aa  87  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  24.22 
 
 
1244 aa  87.4  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  22.28 
 
 
1252 aa  85.5  0.000000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1188  hypothetical protein  37.61 
 
 
124 aa  83.2  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2274  protein of unknown function DUF559  41.84 
 
 
122 aa  80.1  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0690835  hitchhiker  0.00000422818 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2211  protein of unknown function DUF559  41.84 
 
 
122 aa  80.1  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3969  hypothetical protein  43.93 
 
 
126 aa  80.1  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.897432  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0541  hypothetical protein  38.52 
 
 
225 aa  79  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.164679  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3209  protein of unknown function DUF559  38.38 
 
 
122 aa  78.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0254559 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0164  protein of unknown function DUF559  37.04 
 
 
119 aa  77.8  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2461  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  31.11 
 
 
1403 aa  77.4  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1559  hypothetical protein  37.29 
 
 
121 aa  77  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3525  hypothetical protein  42 
 
 
123 aa  76.3  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.739621  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0163  hypothetical protein  35.65 
 
 
194 aa  76.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.103977  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0952  leucyl-tRNA synthetase  32.77 
 
 
1146 aa  76.3  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1705  hypothetical protein  31.49 
 
 
1421 aa  76.3  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  29.93 
 
 
1041 aa  76.3  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0900  hypothetical protein  38.83 
 
 
125 aa  73.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0348  hypothetical protein  36.57 
 
 
148 aa  73.9  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  21.56 
 
 
1194 aa  72.8  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01266  hypothetical protein  36.19 
 
 
117 aa  72.4  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2357  protein of unknown function DUF559  36.19 
 
 
117 aa  72.4  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.218447  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01277  hypothetical protein  36.19 
 
 
117 aa  72.4  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2336  hypothetical protein  36.19 
 
 
117 aa  72.4  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00907426 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1403  hypothetical protein  36.54 
 
 
148 aa  72.4  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0860159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>