121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0789 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  100 
 
 
1250 aa  2492    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  97.2 
 
 
1250 aa  2402    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  34.75 
 
 
1277 aa  546  1e-154  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  33.52 
 
 
1278 aa  529  1e-148  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1308  putative type II DNA modification enzyme  23.91 
 
 
1442 aa  286  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.102171 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  21.35 
 
 
1339 aa  252  3e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  22.82 
 
 
1373 aa  251  6e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6769  hypothetical protein  22.32 
 
 
1349 aa  245  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  21.94 
 
 
1336 aa  245  3e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  22.42 
 
 
1354 aa  241  5e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  27.22 
 
 
1426 aa  241  6.999999999999999e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  22.39 
 
 
1333 aa  239  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  24.17 
 
 
1581 aa  238  7e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  22.89 
 
 
1306 aa  237  9e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  23.81 
 
 
1432 aa  234  6e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  21.24 
 
 
1422 aa  234  7.000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  23.4 
 
 
1332 aa  232  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  22.55 
 
 
1375 aa  228  7e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  21.57 
 
 
1318 aa  225  4e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  22.28 
 
 
1338 aa  224  6e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  23.57 
 
 
1338 aa  223  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  21.68 
 
 
1322 aa  215  4.9999999999999996e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  24.68 
 
 
1098 aa  213  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  22.87 
 
 
1219 aa  210  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  24.66 
 
 
1022 aa  208  6e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  23.93 
 
 
1612 aa  207  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  21.97 
 
 
1321 aa  205  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  21.27 
 
 
1319 aa  204  9e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  22.73 
 
 
1298 aa  198  5.000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  21.37 
 
 
1459 aa  197  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  22.73 
 
 
1358 aa  196  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  22.84 
 
 
1712 aa  196  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  20.47 
 
 
1322 aa  195  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  20.64 
 
 
1055 aa  171  9e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  24.86 
 
 
1282 aa  169  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  24.82 
 
 
1290 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011785  BbuZS7_I29  hypothetical protein  35.11 
 
 
317 aa  154  1e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  22.52 
 
 
1342 aa  148  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  25.13 
 
 
1343 aa  147  9e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  21.06 
 
 
1331 aa  146  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  21.07 
 
 
1243 aa  142  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  26.6 
 
 
1355 aa  138  7.000000000000001e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  23.22 
 
 
1353 aa  136  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  23.88 
 
 
1321 aa  127  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0744  hypothetical protein  27.45 
 
 
1709 aa  127  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0584  hypothetical protein  23.59 
 
 
826 aa  111  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1417  hypothetical protein  24.38 
 
 
1557 aa  111  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1354  hypothetical protein  25.13 
 
 
1579 aa  107  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  19.87 
 
 
1409 aa  105  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3884  hypothetical protein  25.52 
 
 
1642 aa  104  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5809  hypothetical protein  25.52 
 
 
1644 aa  104  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  29.18 
 
 
1751 aa  102  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4829  hypothetical protein  25.35 
 
 
1640 aa  103  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3087  hypothetical protein  25.18 
 
 
1572 aa  100  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0122082 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5421  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  23.9 
 
 
1581 aa  98.6  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.689282 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4895  type II restriction enzyme, methylase subunit  23.61 
 
 
1640 aa  97.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  22.44 
 
 
1461 aa  93.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3742  hypothetical protein  23.86 
 
 
1575 aa  92.8  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  22.07 
 
 
1452 aa  92  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0353  type II restriction enzyme, methylase subunit  24.69 
 
 
1573 aa  92  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  25.87 
 
 
1363 aa  90.1  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  23.32 
 
 
1339 aa  89.4  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  23.32 
 
 
1339 aa  89.4  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  26.37 
 
 
1186 aa  84.7  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  25.41 
 
 
846 aa  83.6  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  24.16 
 
 
1256 aa  83.6  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  21.68 
 
 
1441 aa  82.8  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  23.62 
 
 
1347 aa  82.4  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  25 
 
 
1252 aa  82.8  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  27.47 
 
 
1257 aa  79.7  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  27.2 
 
 
1244 aa  79.7  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  24.19 
 
 
1058 aa  78.2  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  26.35 
 
 
1365 aa  77.4  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  25.83 
 
 
1194 aa  75.9  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  20.06 
 
 
1347 aa  75.1  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35210  hypothetical protein  24.13 
 
 
1546 aa  73.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  22.22 
 
 
1346 aa  72  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  25.15 
 
 
1299 aa  71.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  19.85 
 
 
926 aa  69.7  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  22.29 
 
 
1154 aa  68.9  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  38.84 
 
 
1041 aa  68.6  0.0000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  27.88 
 
 
1177 aa  67.8  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  21.7 
 
 
795 aa  68.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  30.59 
 
 
995 aa  66.2  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  21.43 
 
 
1440 aa  66.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  25.41 
 
 
1366 aa  65.1  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  23.98 
 
 
1178 aa  63.5  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  27.54 
 
 
950 aa  63.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  21.04 
 
 
1210 aa  62.4  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  25.62 
 
 
974 aa  62.4  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  18.36 
 
 
1184 aa  61.6  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  25.28 
 
 
1209 aa  59.7  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  24.27 
 
 
1036 aa  58.2  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  22.31 
 
 
1189 aa  57.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  23.01 
 
 
1076 aa  56.6  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  21.13 
 
 
1338 aa  56.2  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  21.63 
 
 
1239 aa  54.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  21.38 
 
 
882 aa  54.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  23.08 
 
 
1159 aa  54.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  24.64 
 
 
1195 aa  53.5  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>