155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3219 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  100 
 
 		 1298 aa  2646    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  22.95 
 
 		 1250 aa  202  5e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  22.66 
 
 		 1250 aa  197  1e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  25.9 
 
 		 1104 aa  188  6e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  23.61 
 
 		 1581 aa  157  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1177 aa  153  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6769  hypothetical protein  24.06 
 
 		 1349 aa  150  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  23.07 
 
 		 1375 aa  144  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  26.3 
 
 		 1178 aa  142  6e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  23.83 
 
 		 1209 aa  141  7.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  24.56 
 
 		 1076 aa  138  5e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  23.93 
 
 		 1194 aa  138  9e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  25.88 
 
 		 1039 aa  135  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  22.21 
 
 		 1332 aa  132  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  22.89 
 
 		 1339 aa  132  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0744  hypothetical protein  26.52 
 
 		 1709 aa  130  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  25.97 
 
 		 882 aa  129  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  29.79 
 
 		 1089 aa  128  9e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  24.4 
 
 		 1159 aa  126  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  22.39 
 
 		 1321 aa  124  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  22.57 
 
 		 1154 aa  124  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1147 aa  122  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  23.07 
 
 		 1354 aa  122  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  23.46 
 
 		 1306 aa  120  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  23.94 
 
 		 1120 aa  120  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  27.19 
 
 		 1098 aa  119  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  24.59 
 
 		 1256 aa  119  3.9999999999999997e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  23.03 
 
 		 1338 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  21.67 
 
 		 1278 aa  114  2.0000000000000002e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  23.68 
 
 		 1338 aa  112  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  24.69 
 
 		 1184 aa  109  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  27.59 
 
 		 1355 aa  108  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  24.11 
 
 		 1022 aa  108  6e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  24.3 
 
 		 1343 aa  107  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  24.96 
 
 		 1244 aa  106  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  23.1 
 
 		 1252 aa  106  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  21.16 
 
 		 1132 aa  105  5e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  25.29 
 
 		 1257 aa  105  6e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  24.32 
 
 		 1318 aa  105  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  24.14 
 
 		 1210 aa  105  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  22.26 
 
 		 1055 aa  103  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  22.53 
 
 		 1422 aa  104  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  21.61 
 
 		 1277 aa  104  1e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  22.58 
 
 		 1219 aa  103  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  23.65 
 
 		 1299 aa  103  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  28.62 
 
 		 838 aa  102  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  23.06 
 
 		 1186 aa  100  3e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  28.37 
 
 		 1088 aa  97.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  22.86 
 
 		 1432 aa  97.1  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  22.76 
 
 		 1338 aa  93.6  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  29.47 
 
 		 1712 aa  92.8  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  23.81 
 
 		 974 aa  91.3  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  21.97 
 
 		 1331 aa  89.7  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  24.74 
 
 		 1373 aa  89  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  30.04 
 
 		 1170 aa  87.8  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  23.43 
 
 		 1336 aa  87.4  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  25.46 
 
 		 1322 aa  85.9  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  21.77 
 
 		 1322 aa  85.5  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1308  putative type II DNA modification enzyme  22.16 
 
 		 1442 aa  84  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.102171 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  21.21 
 
 		 1459 aa  83.2  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  22.32 
 
 		 1358 aa  80.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  24.47 
 
 		 1041 aa  79.7  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1612 aa  79.3  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1426 aa  75.9  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  22.75 
 
 		 1333 aa  74.7  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  23.13 
 
 		 1319 aa  72  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  24.59 
 
 		 1347 aa  69.7  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  25.22 
 
 		 871 aa  68.9  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1465  hypothetical protein  25.67 
 
 		 914 aa  68.6  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152551  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  32.87 
 
 		 950 aa  67  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  22.75 
 
 		 1365 aa  67  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0353  type II restriction enzyme, methylase subunit  22.2 
 
 		 1573 aa  66.6  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  23.18 
 
 		 995 aa  66.2  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  23.57 
 
 		 1441 aa  66.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35210  hypothetical protein  27.75 
 
 		 1546 aa  65.5  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  22.14 
 
 		 1452 aa  63.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  24.73 
 
 		 1058 aa  63.9  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2393  Type II restriction enzyme methylase subunits-like protein  24.29 
 
 		 934 aa  63.2  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.233566  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5634  methylase  24.67 
 
 		 937 aa  63.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  21.71 
 
 		 1282 aa  62.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  23.61 
 
 		 1461 aa  62.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1363 aa  62.4  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  23.1 
 
 		 918 aa  60.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2902  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  23.47 
 
 		 621 aa  59.7  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00367965 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2607  methylase  24.83 
 
 		 928 aa  59.7  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483035  decreased coverage  0.00951903 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  24.34 
 
 		 908 aa  59.3  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5421  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  30.61 
 
 		 1581 aa  58.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.689282 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0759  hypothetical protein  21.97 
 
 		 912 aa  57.8  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.231322  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  30.83 
 
 		 1751 aa  58.2  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0176  type II restriction enzyme methylase subunits- like protein  23.86 
 
 		 919 aa  58.2  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0028  hypothetical protein  23.88 
 
 		 916 aa  57.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  21.9 
 
 		 1290 aa  57.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  33.61 
 
 		 1282 aa  56.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1417  hypothetical protein  21.54 
 
 		 1557 aa  55.8  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0121  putative DNA methylase  26.26 
 
 		 1022 aa  55.8  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  26.53 
 
 		 1151 aa  55.8  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  24.28 
 
 		 1347 aa  55.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  25.52 
 
 		 929 aa  55.5  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  21.59 
 
 		 1154 aa  55.1  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  29.23 
 
 		 1359 aa  55.1  0.000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>